マーク・ガースタイン | |
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| 生まれる | マーク・ベンダー・ガースタイン 2月23日 |
| 市民権 | 私たち |
| 母校 | |
| 受賞歴 | |
| 科学者としてのキャリア | |
| フィールド | バイオインフォマティクス[3] |
| 機関 | |
| 論文 | タンパク質認識:表面と構造変化 (1993) |
| 博士課程の指導教員 |
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| その他の学術アドバイザー | マイケル・レビット(ポスドク) |
| 博士課程の学生 | ヴェルナー・クレブス[6] [7] |
| Webサイト |
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マーク・ベンダー・ガースタインは、バイオインフォマティクスとデータサイエンス の分野で研究するアメリカの科学者です。2009 年現在、イェール大学の計算生物学[アップデート]およびバイオインフォマティクス プログラムの共同ディレクターを務めています。
マーク・ガースタインは、イェール大学のアルバート・L・ウィリアムズ 生物医学情報学教授、分子生物物理学および生化学教授、統計学およびデータサイエンス教授、コンピューターサイエンス教授です。[8] 2018年、ガースタインはイェール大学生物医学データサイエンスセンターの共同ディレクターに任命されました。[9]
教育
1989年にハーバード大学で 物理学の学士号を首席で取得した後、ガースタインは、ケンブリッジ大学のルース・リンデン・ベル[5]と分子生物学研究所のサイラス・チョシアの指導の下、タンパク質の構造変化に関する博士号を取得し、1993年に卒業しました[10] 。その後、 1993年から1996年まで、ノーベル賞受賞者のマイケル・レビットの指導の下、スタンフォード大学でバイオインフォマティクスのポスドク研究 を行いました。
研究
ガースタインはバイオインフォマティクスの分野で研究を行っています。[3] [11] [12] これには、データマイニングや機械学習、分子シミュレーション、データベース設計など、分子生物学の問題に対するさまざまな計算手法の適用が含まれます。彼の研究グループは、ヒトゲノムの注釈付け、[13] パーソナルゲノミクス、ガンゲノミクス、ゲノム技術(次世代シーケンシングなど)を支援するツールの構築、分子ネットワークの解析、高分子運動のシミュレーションなど、多くの焦点を持っています。グループが開発した注目すべきデータベースとツールには、高分子の構造変化を分類する高分子運動データベース[6] [7]、分子ネットワークの解析に役立つtYNA [14]、出版ネットワークを解析するPubNet [15]、特定の転写因子が結合するゲノム領域を識別するPeakSeq [16]などがあります。およびCNVnator [17]は、ゲノム内のブロック変異を分類します。ガースタインは、データサイエンスの一般的な問題がゲノミクスにどのような影響を与えるかについても、特にプライバシー[18]と科学的コミュニケーションの構造化[19]に関連して広範囲に執筆しています。
ガースタインの研究は、査読付き 科学雑誌[20] [21] [22]や、より一般的なフォーラムの非科学出版物に掲載されています。[23]彼の研究はHが100を超えるなど、頻繁に引用されています。[3]彼は、 PLoS Computational Biology、Genome Research、Genome Biology、Molecular Systems Biologyなど、多くの編集委員会や諮問委員会に所属しています。彼の論文は、ニューヨークタイムズ[24] [25] [26]の一面を含む[13]や他の主要新聞にも引用されています。[27]
受賞と栄誉
WMケック財団優秀若手研究者賞[28]に加え、ガースタイン氏は米国海軍、IBM、米国研究製薬工業協会、ドナヒュー財団から賞を受賞している。[29]彼はAAASフェローである。[1]他の受賞には、ケンブリッジ大学エマニュエル・カレッジでの博士研究を支援するハーシェル・スミス奨学金や、デイモン・ラニヨンがん研究財団ポストドクターフェローシップがある。彼はENCODE、[30] modENCODE、[31] [32] [33] 1000ゲノムプロジェクト、ブレインスパン、[34] DOE Kbaseなど、数多くの科学コンソーシアムに貢献している。[要出典]彼は2015年に国際計算生物学会のフェローに任命された。[2]
参考文献
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外部リンク
- イェール大学のマーク・ガースタイン研究所
- イェール大学コンピュータサイエンス学部のマーク・ガースタイン
- イェール大学医学部のマーク・ガースタイン
- Google Scholarにインデックスされた Mark Gerstein の出版物
- Mark Gerstein の ResearchGate での出版物
- DBLP書誌サーバーの Mark Gerstein
