遺伝子発現 、ニューロン 、脳の巨視的 構造、神経疾患 や精神 疾患に関する情報を提供するオンライン神経科学 データベースが 数多く存在する。これらのデータベースには、記述的データや数値データ、脳機能に関する情報、死後 脳切片や3D MRI 、fMRI 画像などの「生」画像データへのアクセスを提供するものなど、様々な種類がある。ヒトの脳に特化したものもあれば、ヒト以外の動物の脳に特化したものもある。
脳の構造、発達、機能に関する情報を発信するデータベースの数が増えるにつれて、これらのリソース自体を収集する必要性も高まってきました。その結果、現在では神経科学データベースのデータベースが存在し、中には3000件を超えるエントリを持つものもあります。[ 1 ]
参考文献 ↑ 「検索クエリ「database」を使用したエントリ数」neuinfo.org . NIF . 2015年 1月25日 取得 . ↑ Szechtman H、Dvorkin-Gheva A、Gomez-Marin A（2022年9月21日）。「標準条件下での行動パフォーマンスのための仮想ライブラリ - 反復試験中および薬物投与または脳損傷後のオープンフィールドにおけるげっ歯類の自発活動」の補足データ doi : 10.5524/102261 .CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク) ↑ Lein ES、Hawrylycz MJ、Ao N、Ayres M、Bensinger A、Bernard A、et al. (2007 年 1 月 ) 。 「成体マウス脳 における 遺伝子発現のゲノムワイドアトラス」。Nature。445 ( 7124) : 168–76。Bibcode : 2007Natur.445..168L。doi : 10.1038 / nature05453。PMID 17151600。S2CID 4421492 。 ↑ Jack CR、Bernstein MA、Fox NC、Thompson P、Alexander G、Harvey D、et al. (2008 年 4 月) 「アルツハイマー病神経画像イニシアチブ (ADNI)：MRI 法」 . Journal of Magnetic Resonance Imaging . 27 (4): 685–91 . doi : 10.1002/jmri.21049 . PMC 2544629 . PMID 18302232 . ↑ Amunts K、Lepage C 、 Borgeat L、Mohlberg H、Dickscheid T、Rousseau MÉ、et al . (2013 年 6 月 ) 。 「 BigBrain: 超高解像度 3D ヒト脳モデル」。Science。340 ( 6139): 1472–5。Bibcode : 2013Sci ...340.1472A。doi : 10.1126 /science.1235381。PMID 23788795。S2CID 14122170 。 ↑ Kempton MJ、Geddes JR、Ettinger U、Williams SC、Grasby PM (2008 年 9 月)。 「双極性障害における 98 の 構造画像研究 の メタ分析、データベース、およびメタ回帰」 。Archives of General Psychiatry。65 ( 9): 1017–32。doi : 10.1001 /archpsyc.65.9.1017。PMID 18762588 。 ↑ Vaccarino AL、Dharsee M、Strother S、Aldridge D、Arnott SR、Behan B、Dafnas C、Dong F、Edgecombe K、El-Badrawi R、El-Emam K、Gee T、Evans SG、Javadi M、Jeanson F、Lefaivre S、Lutz K、MacPhee FC、Mikkelsen J、Mikkelsen T、Mirotchnick N、Schmah T、Studzinski CM、Stuss DT、Theriault E、Evans KR (2018)。 「 Brain - CODE: 多次元神経科学データの管理、連携、共有、分析のための安全な神経情報学プラットフォーム」 。Frontiers in Neuroinformatics。12 28。doi : 10.3389 / fninf.2018.00028。ISSN 1662-5196 。 PMC 5974337 . PMID 29875648 . ↑ Serag A、Aljabar P、Ball G、Counsell SJ、Boardman JP、Rutherford MA、et al . (2012 年 2 月)。「適応カーネル回帰を用いた発達中の脳の一貫した高解像度時空間アトラスの 構築 」 。NeuroImage。59 ( 3 ) : 2255–65。doi : 10.1016 / j.neuroimage.2011.09.062。PMID 21985910。S2CID 9747334 。 ↑ Szalkai B 、 Kerepesi C 、Varga B、Grolmusz V (2017年2 月 )。 「Human Connectome Projectからのパラメータ化可能なコンセンサスコネクトーム：Budapest Reference Connectome Server v3.0」 。Cognitive Neurodynamics。11 ( 1 ) : 113– 116。arXiv : 1602.04776。doi : 10.1007/ s11571-016-9407 - z。PMC 5264751。PMID 28174617 。 ↑ Laird AR、Lancaster JL 、Fox PT (2005)。 「BrainMap：ヒト脳マッピングデータベースの社会的進化」 （ PDF ） 。Neuroinformatics。3 （ 1）： 65–78。doi ： 10.1385 /ni : 3:1: 065。PMID 15897617 。 ↑ Mikula S、Trotts I、Stone JM、 Jones EG (2007 年3 月 )。 「 インターネット を 利用した高解像度脳マッピングと仮想顕微鏡」 。NeuroImage。35 ( 1 ): 9–15。doi : 10.1016 / j.neuroimage.2006.11.053。PMC 1890021。PMID 17229579 。 ↑ 岡野 英、佐々木 英、山森 達、入来 亜、下郡 達、山口 裕、葛西 Ｋ、宮脇 亜（2016 年 11 月）。 「Brain/MINDS: マーモセットの神経科学のための日本の国家頭脳プロジェクト 」 ニューロン 。 92 (3): 582–590 。 土井 ： 10.1016/j.neuron.2016.10.018 。 PMID 27809998 。 ↑ Nielsen, FA (2003). Bredeデータベース：機能的神経画像のための小規模データベースNeuroImage 19(2)、第9回ヒト脳機能マッピング国際会議にて発表、2003年6月19日～22日、ニューヨーク。 ↑ パパドプロス・オルファノス D、ミシェル V、シュワルツ Y、ピネル P、モレノ A、ル・ビアン D、フルアン V (2017 年 1 月)。 「ブレインミクス/ローカライザー データベース」 。 ニューロイメージ 。 144 (Pt B): 309–314 。 土井 : 10.1016/j.neuroimage.2015.09.052 。 PMID 26455807 。 S2CID 13004274 。 ↑ Petersen, Peter Christian; Hernandez, Michelle; Buzsáki, György (2020). "The Buzsaki Lab Databank – Public electrophysiological datasets from awake animals". doi : 10.5281/zenodo.4307883 . ↑ 「ブザキ研究室のデータバンク」 。 ↑ Tyszka JM、Pauli WM（2016 年 11月）。 「高解像度グループテンプレートによるヒト扁桃体複合体の亜領域の生体内区分 」 。Human Brain Mapping。37 （ 11 ） ： 3979–3998。doi ： 10.1002 / hbm.23289。PMC 5087325。PMID 27354150 。 ↑ Shafto MA、Tyler LK、Dixon M、Taylor JR、Rowe JB、Cusack R、et al. (2014 年 10 月) 「ケンブリッジ老化神経科学センター (Cam-CAN) 研究プロトコル: 健康な認知老化の横断的、生涯にわたる多分野にわたる調査」 BMC Neurology 14 ( 6) 204. doi : 10.1186/s12883-014-0204-1 . PMC 4219118 . PMID 25412575 . ↑ Clark K、Vendt B、Smith K、Freymann J、Kirby J、Koppel P、et al. (2013 年 12 月) 「がん画像アーカイブ (TCIA)：公開情報リポジトリの維持と運用」 . Journal of Digital Imaging . 26 (6): 1045–57 . doi : 10.1007/ s10278-013-9622-7 . PMC 3824915. PMID 23884657 . ↑ 佐藤 A、関根 Y、猿田 C、西部 H、森田 N、佐藤 Y、定方 T、篠田 Y、小島 T、古市 T (2008 年 10 月)。 「小脳発達トランスクリプトーム データベース (CDT-DB): マウス小脳の出生後の発達における時空間的遺伝子発現のプロファイリング」。 ニューラルネットワーク 。 21 (8): 1056–69 . 土井 : 10.1016/j.neunet.2008.05.004 。 PMID 18603407 。 ↑ Van Horn JD、Grethe JS、Kostelec P、Woodward JB、Aslam JA、Rus D、Rockmore D、Gazzaniga MS (2001) 機能的磁気共鳴画像データセンター (fMRIDC)：神経画像研究の大規模データベース化における課題と利点Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci Aug 29;356(1412):1323-39 ↑ "Hippocampome" . hippocampome.org . 2016年 8月10日 取得 . ↑ Wheeler DW、White CM、Rees CL、Komendantov AO、Hamilton DJ、Ascoli GA (2015 年 9 月)。 「 Hippocampome.org : げっ歯類 の 海馬 におけるニューロンタイプの知識ベース」 。eLife。4 e09960。doi : 10.7554 / eLife.09960。PMC 4629441。PMID 26402459 。 ↑ Ahmad S、Wu W、Wu Z、Thung KH、Liu S、Lin W、Li G、Wang L、Yap PT (2023)。 「 乳幼児 期 の ヒト脳の多面的なアトラス」 。Nature Methods。20 ( 1 ): 55–64。doi : 10.1038 / s41592-022-01703 - z。PMC 9834057。PMID 36585454。S2CID 247600108 。 ↑ Lüsebrink F、Mattern H、Yakupov R、Acosta-Cabronero J、Ashtarayeh M、Oeltze-Jafra S、Speck O (2021 年 5 月)。 「 ヒト ファントム としての包括的な超高解像度全脳 in vivo MRI データセット」 。Scientific Data。8 ( 1 ) 138。Bibcode : 2021NatSD...8..138L。doi : 10.1038 / s41597-021-00923 - w。PMC 8149725。PMID 34035308 。 ↑ Amunts K、Zilles K（2015年12月）。 「 ブロード マン を 超えるヒト脳の構造マッピング」 。Neuron。88 （ 6 ） ： 1086–1107。doi ： 10.1016/j.neuron.2015.12.001。PMID 26687219 。 ↑ Zilles K 、 Amunts K（2010年2月）。「ブロードマン の地図の100周年―構想と運命」。Nature Reviews . Neuroscience . 11 （ 2）： 139–45。doi ： 10.1038/ nrn2776。PMID 20046193。S2CID 5278040 。 ↑ 「キマタ・アトラスのホームページ」 。 キマタ アトラス 。ケンブリッジ大学 。 2015 年 12 月 11 日 に取得 。 ↑ Kempton MJ、Salvador Z、Munafò MR、Geddes JR、Simmons A、Frangou S、et al. (2011年7月) 「大うつ病性障害における構造的神経画像研究。メタ分析と双極性障害との比較」 . Archives of General Psychiatry . 68 (7): 675–90 . doi : 10.1001/archgenpsychiatry.2011.60 . PMID 21727252 . ↑ 下郡T、阿部A、郷Y、橋川T、岸N、菊池SS、北Y、新見K、西部H、奥野M、嵯峨K、櫻井M、佐藤M、芹沢T、鈴木S、高橋E、田中M、立本S、土岐M、UM、王Y、ウィンダックKJ、山岸H、山下K、与田T、吉田AC、吉田C、吉本T、岡野H（2018年3月）。 「コモンマーモセットの新生児脳のデジタル遺伝子アトラス」。 神経科学研究所 。 128 : 1–13 . 土井 : 10.1016/j.neures.2017.10.009 。 PMID 29111135 。 S2CID 3735944 。 ↑ Rosen GD、Williams AG、Capra JA、Connolly MT、Cruz B、Lu L、Airey DC、Kulkarni K、Williams RW (2000) マウス脳ライブラリー @ www.mbl.org。国際マウスゲノム会議 14: 166。www.mbl.org。 ↑ Winnubst, Johan; Bas, Erhan; Ferreira, Tiago A.; Wu, Zhuhao; Economo, Michael N.; Edson, Patrick; Arthur, Ben J.; Bruns, Christopher; Rokicki, Konrad; Schauder, David; Olbris, Donald J.; Murphy, Sean D.; Ackerman, David G.; Arshadi, Cameron; Baldwin, Perry (2019-09-19). "Reconstruction of 1,000 Projection Neurons Reveals New Cell Types and Organization of Long-Range Connectivity in the Mouse Brain" . Cell . 179 (1): 268–281.e13. doi : 10.1016/j.cell.2019.07.042 . ISSN 1097-4172 . PMC 6754285 . PMID 31495573 。 ↑ トリパシー、シュリージョイ。ガーキン、リチャード。 「ニューロエレクトロ」 。 www.neuroelectro.org 。 2016 年 8 月 10 日 に取得 。 ↑ Ascoli GA 、Donohue DE、Halavi M (2007 年8 月 ) 。 「 NeuroMorpho.Org: 神経形態 学 の中央リソース」 。The Journal of Neuroscience。27 ( 35): 9247–51。doi : 10.1523 /JNEUROSCI.2055-07.2007。PMC 6673130。PMID 17728438 。 ↑ Mirsky JS、Nadkarni PM、Healy MD、Miller PL、Shepherd GM (1998 年 7 月)。 「 神経形態と相関する膜特性データの統合と検索のためのデータベース ツール」 。Journal of Neuroscience Methods。82 ( 1 ): 105–21。doi : 10.1016 / S0165-0270(98 ) 00049-1。PMID 10223520。S2CID 12871618 。 ↑ Marcus DS、Wang TH、Parker J、Csernansky JG、Morris JC、Buckner RL (2007 年 9 月)。 「オープンアクセス画像研究シリーズ ( OASIS )：若年 、中年、非認知症、および認知症の高齢者 の 横断的 MRI データ」 。Journal of Cognitive Neuroscience。19 ( 9 ): 1498–507。doi : 10.1162 / jocn.2007.19.9.1498。PMID 17714011。S2CID 10840552 。 ↑ Vogelstein, Joshua T (2011-11-18). "Q&A: Open Connectome Project とは？ . " Neural Systems & Circuits . 1 (1) 16. doi : 10.1186/2042-1001-1-16 . ISSN 2042-1001 . PMC 3278382 . PMID 22329952 . ↑ マサチューセッツ州ユセル；タッカー、S.チョイ、Ｊ．ボアス、DA (2020)、 データ – openfnirs 、 2024 年 4 月 18 日に取得 ↑ Poldrack RA、Barch DM、Mitchell JP、Wager TD、Wagner AD、Devlin JT、Cumba C、Koyejo O、Milham MP (2013年7月)。 「 タスク ベース fMRIデータのオープンな共有に向けて：OpenfMRIプロジェクト」 。Frontiers in Neuroinformatics。7 ( 12 ): 12。doi : 10.3389 /fninf.2013.00012。PMC 3703526。PMID 23847528 。 ↑ Niso G 、 Rogers C、Moreau JT、Chen LY、Madjar C、Das S、et al. (2016 年 1 月) 。 「 OMEGA: オープン MEG アーカイブ」 。NeuroImage。124 ( Pt B): 1182–7。doi : 10.1016 /j.neuroimage.2015.04.028。hdl : 10261 / 379395。PMID 25896932。S2CID 29021506 。 ↑ Labus JS、Naliboff B、Kilpatrick L、Liu C、Ashe-McNalley C、dos Santos IR、et al. (2016 年 1 月)。 「疼痛および内受容感覚イメージング ネットワーク (PAIN)：慢性体性 痛 および内臓痛 障害の ためのマルチ モーダル 、マルチサイトの 脳画像リポジトリ」 。NeuroImage。124 (Pt B): 1232–7。doi : 10.1016 / j.neuroimage.2015.04.018。PMC 4627849。PMID 25902408 。 ↑ Conrad MS 、Sutton BP、Dilger RN、Johnson RW (2014 年 9 月)。 「新生子豚 (Sus scrofa) の生体内 三次元磁気共鳴画像法に基づく平均脳コレクション 」 。PLOS ONE。9 ( 9 ) e107650。Bibcode : 2014PLoSO ... 9j7650C。doi : 10.1371 / journal.pone.0107650。PMC 4177841。PMID 25254955 。 ↑ Wang L、Alpert KI、Calhoun VD、Cobia DJ、Keator DB、King MD、et al. (2016 年 1 月)。 「 SchizConnect : 統合失調症および関連疾患に関する神経画像データベース を大規模 に 統合する ための仲介」 。NeuroImage。124 (Pt B): 1155–67。doi : 10.1016 / j.neuroimage.2015.06.065。PMC 4651768。PMID 26142271 。 ↑ Obeid I、Picone J (2016-05-13 ) 。 「テンプル大学病院の脳波データ コーパス 」 。Frontiers in Neuroscience。10 : 196。doi : 10.3389 / fnins.2016.00196。PMC 4865520。PMID 27242402 。 ↑ Lüsebrink F、Sciarra A 、 Mattern H、Yakupov R、Speck O (2017 年 3 月)。 「250 μmの超高等方性 解像度 を 持つ 1 強調生体内ヒト全脳 MRI データセット」 。Scientific Data。4 ( 170032) 170032。Bibcode : 2017NatSD ... 470032L。doi : 10.1038 / sdata.2017.32。PMC 5349250。PMID 28291265 。 ↑ Gorgolewski KJ、Varoquaux G、Rivera G、Schwartz Y、Ghosh SS、Maumet M、Nichols TE、Poldrack RA、Poline JB、Yarkoni T、Margulies DS (2015)。 「NeuroVault.org: 人間 の脳の閾値処理されていない統計マップ を 収集および共有する ためのウェブベースの リポジトリ 」 。Frontiers in Neuroinformatics。9。bioRxiv 10.1101 / 010348。doi : 10.3389 / fninf.2015.00008。PMC 4392315。PMID 25914639 。 ↑ Gardner D、Akil H、Ascoli GA、Bowden DM、Bug W、Donohue DE、et al . (2008 年 9 月)。 「 神経 科学 情報フレームワーク: 神経科学のためのデータと知識環境」 。Neuroinformatics。6 ( 3): 149–60。doi : 10.1007 /s12021-008-9024 - z。PMC 2661130。PMID 18946742 。
