ブダペストリファレンスコネクトーム

ブダペストリファレンスコネクトーム
開発者	バラーズ・シャルカイ、チャバ・ケレペシ、バリント・ヴァルガ、ヴィンス・グロルムス
安定版リリース	3.0
書かれた	Perl、JavaScript、WebGL
利用可能	英語
タイプ	コネクトミクス
Webサイト	pitgroup.org/connectome/

ブダペストリファレンスコネクトームサーバーは、418人の健康な被験者の頻繁に現れる解剖学的脳接続を計算します。^[1]^[2]これは、ヒューマンコネクトームプロジェクトの拡散MRIデータセットからリファレンスコネクトーム（または脳グラフ）に準備されており、CSVおよびGraphML形式でダウンロードして、サイト上で3Dで視覚化できます。

特徴

ブダペスト参照コネクトームには、解剖学的に特定された灰白質領域に対応する1015個のノードがあります。ユーザーは多数のパラメータを設定でき、結果として得られるコンセンサスコネクトームはウェブページ上で簡単に視覚化できます。^[2]ユーザーは、グラフィカルコンポーネント上のノードの解剖学的ラベルをズーム、回転、照会できます。

背景

ブダペストリファレンスコネクトームは、バージョン 2 では 96 人の被験者、バージョン 3 では 418 人の被験者の脳グラフのコンセンサスグラフです。被験者の特定の割合に存在するエッジのみが返されます。選択された各エッジには、そのエッジを含む各グラフで特定の重みがあるため、これらの複数の重みは、平均 (つまり、平均値) または中央値のいずれかを取得して 1 つの重みに結合されます。ユーザーインターフェイスでは、これらのパラメーターをカスタマイズできます。ユーザーは、返されるエッジの最小頻度を選択できます。女性または男性のリファレンスコネクトームを表示して比較するオプションがあります。女性のコネクトームには男性のコネクトームよりも大幅に多くのエッジが含まれており、女性のコネクトームのエッジの大部分は、2 つの半球間を走っています。^[3]^[4]^[5]

発見

ブダペスト参照コネクトームは、研究者らを人間の脳グラフのコンセンサスコネクトームダイナミクスの発見に導いた。すべての脳グラフに現れるエッジは、脳幹の周囲に接続されたサブグラフを形成する。徐々に頻度の低いエッジを許可することで、このコアサブグラフは低木のように継続的に成長する。成長のダイナミクスは個々の脳の発達を反映し、人間のコンセンサス脳グラフのいくつかのエッジを方向付ける機会を提供する可能性がある。^[6]

参考文献

^ シャルカイ、バラーズ;他。（2015年）。「ブダペストリファレンス Connectome サーバー v2.0」。神経科学の手紙。595：60-2。arXiv : 1412.3151。土井：10.1016/j.neulet.2015.03.071。PMID 25862487。S2CID 6563189 。
^ ab Szalkai、Balázs;ケレペシ、チャバ。ヴァルガ、バリント。ヴィンス・グロルムス (2017)。「Human Connectome プロジェクトのパラメーター化可能なコンセンサスコネクトーム: Budapest Reference Connectome Server v3.0」。認知神経力学。11 (1): 113–116。arXiv : 1602.04776。土井：10.1007/s11571-016-9407-z。PMC 5264751。PMID 28174617。
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^ Szalkai, Balázs; Varga, Bálint; Grolmusz, Vince (2015). 「グラフ理論分析により、女性の脳は男性の脳よりもよくつながっていることが明らかになりました」. PLOS ONE . 10 (7): e0130045. arXiv : 1501.00727 . Bibcode :2015PLoSO..1030045S. doi : 10.1371/journal.pone.0130045 . ISSN 1932-6203. PMC 4488527. PMID 26132764 .
^ Szalkai, Balázs; Varga, Bálint; Grolmusz, Vince (2017). 「脳サイズのバイアス補正グラフ理論パラメータは女性の構造コネクトームでも優れている」.脳イメージングと行動. 12 (3): 663–673. doi :10.1007/s11682-017-9720-0. PMID 28447246. S2CID 4028467.
^ Kerepesi, Csaba; et al. (2016). 「コネクトームのエッジを方向付ける方法: コンセンサスコネクトームのダイナミクスと人間の脳における接続の発達」. PLOS ONE . 11 (6): e0158680. arXiv : 1509.05703 . Bibcode :2016PLoSO..1158680K. doi : 10.1371/journal.pone.0158680 . PMC 4928947. PMID 27362431 .

[connectome-1] シャルカイ、バラーズ;他。（2015年）。「ブダペストリファレンス Connectome サーバー v2.0」。神経科学の手紙。595：60-2。arXiv : 1412.3151。土井：10.1016/j.neulet.2015.03.071。PMID 25862487。S2CID 6563189 。

[bpconn3-2] Szalkai、Balázs;ケレペシ、チャバ。ヴァルガ、バリント。ヴィンス・グロルムス (2017)。「Human Connectome プロジェクトのパラメーター化可能なコンセンサスコネクトーム: Budapest Reference Connectome Server v3.0」。認知神経力学。11 (1): 113–116。arXiv : 1602.04776。土井：10.1007/s11571-016-9407-z。PMC 5264751。PMID 28174617。

[IngalhalikarSmith2013-3] Ingalhalikar, M.; Smith, A.; Parker, D.; Satterthwaite, TD; Elliott, MA; Ruparel, K.; Hakonarson, H.; Gur, RE; Gur, RC; Verma, R. (2013). 「ヒト脳の構造コネクトームにおける性差」Proceedings of the National Academy of Sciences . 111 (2): 823–828. Bibcode :2014PNAS..111..823I. doi : 10.1073/pnas.1316909110 . ISSN 0027-8424. PMC 3896179 . PMID 24297904.

[Szalkai2015-4] Szalkai, Balázs; Varga, Bálint; Grolmusz, Vince (2015). 「グラフ理論分析により、女性の脳は男性の脳よりもよくつながっていることが明らかになりました」. PLOS ONE . 10 (7): e0130045. arXiv : 1501.00727 . Bibcode :2015PLoSO..1030045S. doi : 10.1371/journal.pone.0130045 . ISSN 1932-6203. PMC 4488527. PMID 26132764 .

[Szalkai2017-5] Szalkai, Balázs; Varga, Bálint; Grolmusz, Vince (2017). 「脳サイズのバイアス補正グラフ理論パラメータは女性の構造コネクトームでも優れている」.脳イメージングと行動. 12 (3): 663–673. doi :10.1007/s11682-017-9720-0. PMID 28447246. S2CID 4028467.

[Kerepesi2016-6] Kerepesi, Csaba; et al. (2016). 「コネクトームのエッジを方向付ける方法: コンセンサスコネクトームのダイナミクスと人間の脳における接続の発達」. PLOS ONE . 11 (6): e0158680. arXiv : 1509.05703 . Bibcode :2016PLoSO..1158680K. doi : 10.1371/journal.pone.0158680 . PMC 4928947. PMID 27362431 .