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| リンクドメイン | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 ヒトCD44のヒアルロン酸結合ドメインの構造 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | リンク | ||||||||
| パム | PF00193 | ||||||||
| ファム一族 | CL0056 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | SM00445 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00955 | ||||||||
| SCOP2 | 1o7b / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd01102 | ||||||||
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リンクドメインまたはリンクモジュールは、 Xリンクドメイン（Xは細胞外）とも呼ばれ、ヒアルロン酸に結合するタンパク質ドメインです。[1]これは、血液細胞の移動とアポトーシスに重要です。[2]リンクドメインは、ヒアレクタンなどの脊椎動物のいくつかの細胞外タンパク質に見られます。[3]これは、細胞外マトリックスの組み立てと安定性、細胞接着、および移動に関与しているようです。[3] [4]
構造
この構造は、C型レクチンに似た大きな疎水性コアの周りに配置された2つのαヘリックスと2つの反平行 βシートで構成されていることが示されています。 [5]このドメインには、 2つのジスルフィド結合に関与する4つの保存されたシステインが含まれています。リンクドメインは、HABM（ヒアルロン酸結合モジュール）[4] およびPTR（プロテオグリカンタンデムリピート）とも呼ばれています。[6]
リンクドメインタンパク質
リンクドメインを含む タンパク質には以下のものがあります。
- ヒアレクタン（プロテオグリカンのファミリー）：アグリカン、ブレビカン、ニューロカン、バーシカンは中枢神経系で発現します。
- 軟骨リンクタンパク質（LP）、HAおよびアグリカンとともに多分子凝集体を形成するプロテオグリカン。
- 腫瘍壊死因子誘導タンパク質6（TSG-6 ）。炎症および腫瘍形成中の細胞間および細胞-マトリックス相互作用に関与している可能性がある。
- HA の主な細胞表面受容体であるCD44抗原。
参照
参考文献
- ^ 「リンクドメイン署名とプロファイル」PROSITE 2004年12月2016年9月30日閲覧。
- ^ 米田 正之、中村 孝文、村井 正之、和田 秀次 (2010)。「ホヤ類のXlinkドメインのヘパリン結合能の証拠と脊索動物におけるXlinkドメインの進化に関する考察」。J Mol Evol . 71 ( 1 ): 51–9。Bibcode :2010JMolE..71...51Y。doi :10.1007/s00239-010-9363-x。PMID 20582409。S2CID 10614265 。
- ^ ab Hynes, RO; Naba, A (2011年9月21日). 「マトリソームの概要 - 細胞外マトリックスの構成要素と機能の一覧」Cold Spring Harbor Perspectives in Biology . 4 (1): a004903. doi :10.1101/cshperspect.a004903. PMC 3249625 . PMID 21937732.
- ^ ab Barta E, Deák F, Kiss I (1993年6月). 「リンクタンパク質のヒアルロン酸結合モジュールの進化」. Biochem. J. 292 ( 3): 947–9. doi :10.1042/bj2920947. PMC 1134205. PMID 8318021 .
- ^ Kohda D, Morton CJ, Parkar AA, Hatanaka H, Inagaki FM, Campbell ID, Day AJ (1996年9月). 「リンクモジュールの解構造：細胞外マトリックスの安定性と細胞移動に関与するヒアルロン酸結合ドメイン」. Cell . 86 (5): 767–75. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80151-8 . PMID 8797823. S2CID 16347386.
- ^ Brissett NC、 Perkins SJ (1996 年 6 月)。「リンクタンパク質、アグリカン、CD44 のヒアルロン酸結合プロテオグリカンタンデムリピートドメインのタンパク質フォールドは、C 型レクチンスーパーファミリーのものと類似している」。FEBS Lett。388 ( 2–3 ): 211–6。doi : 10.1016/0014-5793(96 ) 00576-5。PMID 8690089。S2CID 24295651 。