リネピテマ・ヒューミルウイルス 1

リネピテマ・ヒューミルウイルス 1
ウイルスの分類
(ランク外):	ウイルス
領域:	リボビリア
王国：	オルタナウイルス科
門:	ピスビリコタ
クラス：	ピソニビリセテス
注文：	ピコルナウイルス科
家族：	ディシストロウイルス科
属:	アパラウイルス
ウイルス：	リネピテマ・ヒューミルウイルス 1

リネピテマ・ヒューミレウイルス-1（LHUV-1）は、侵略的アルゼンチンアリ（リネピテマ・ヒューミレ）種内で活発に複製されていることが発見された新しいウイルスです。アルゼンチンアリは世界中で非常に侵略的で、その巨大なコロニーは南極大陸を除くすべての大陸に侵入しています。アリの侵略性により、このウイルスが他のウイルスとともに脆弱なミツバチの集団に拡散し、コロニー全体の崩壊の原因となっている可能性があります。^[1]

1. ICTVにはリネピテマ・ヒューミレウイルス1は含まれていない^[2]
2. NCBIはこれを含めていますが、未分類のウイルスに分類しています^[3]免責事項：NCBI分類データベースは、ウイルスの命名法や分類に関する権威ある情報源ではありません。
3. 記事1「侵略的アルゼンチンアリ、Linepithema humileに感染する一本鎖RNAウイルス」では、それがDicistroviridae科のAparavirus属の一部であると述べられている^[4]
4. 記事2「侵入アリが新たな生息域に新しいウイルスを運び、ミツバチの病原体の貯蔵庫を形成する」でも、このウイルスはディシストロウイルス科に属するとされている。記事ではアパラウイルス属に属するとは述べられていないが、このウイルスが属する系統群には記事1の系統樹に含まれるほぼすべての種が含まれている。^[1]

アルゼンチンアリによってニュージーランドとオーストラリアにリネピテマ・ヒューミルウイルス-1（LHUV-1）が持ち込まれたことがわかった。アリ以外にも、ミツバチなど世界中の他の種でもこのウイルスが報告されている。アルゼンチンアリは、ミツバチの死に関係する病原体であるデフォームド・ウィング・ウイルス（DWV）の宿主であり、そのリザーバーとして機能している。ミツバチとアルゼンチンアリの相関関係と直接的な相互作用は、蜂の巣への侵入と襲撃の際に発生する。ニュージーランドから分離されたDWVの配列は、地元の蜂とスズメバチの集団の株と類似していることが判明した。これは、アリ、スズメバチ、ミツバチがこれらの病原体株を共有していることを示唆している。^[1]

アルゼンチンアリなどの外来種の侵入が発生し、それが大量発生すると、重要な病原体の貯蔵庫や宿主となる能力によって、大きな影響を及ぼす傾向があることがわかった。^[1]アリがミツバチと接触した場所のアリは、最も高いウイルス量を示した。アリがミツバチと接触しなかった場所では、他のウイルスに比べて DWV の蔓延率が低いことがわかった。^[4]

研究者らは、アルゼンチン、オーストラリアのn1000コンティグ配列のサンプルサイトでLinepithema humileウイルス-1（LHUV-1）が検出され、ニュージーランドでは検査されたサイトの半分未満であったことを発見した。ニュージーランドから追加のアリのサンプルが使用され、以前にハチ、アリ、その他の昆虫で観察されたウイルスを調べ、ウイルスグループ間の相関関係を決定した。ウイルスはIAPV、KBV、ABVP、DWV、SINV-1、およびSINV-2であり、ミツバチと一般的なスズメバチではDWV配列のみが見つかった。さらに、DWVとLHUV-1のマイナス鎖の両方が検出され、これら2つのウイルスがアルゼンチンアリで活発に複製されていることが示された。^[1]

DWV と LHUV-1 の存在は、 RT-PCRやサンガー配列決定法などの分子的方法によって検出され、確認されました。 ^[1]サンガー配列決定法から生成されたデータは、LHUV-1 由来の RNA メタゲノム コンティグ n6409 のデータと同一でした。^[1]ニュージーランドの女王アルゼンチンアリの働きアリ 1 匹は、ウイルス複製を伴う LHUV-1 陽性でしたが、DWV は陽性ではありませんでした。LHUV-1 と DWV は両方ともアルゼンチンアリで複製されていることが観察されました。LHUV-1 ウイルスと DWV ウイルスは両方とも、媒介粒子ではなく、アリに寄生する原因である可能性が高いと報告されています。これら 2 つのウイルスの蔓延は、アルゼンチンアリの個体数の減少に重要な役割を果たしていることが示されており、将来の生物的防除開発の出発点となる可能性があります。^[1]

LHUV-1の蔓延の問題に対処するため、L. humileのゲノムの配列が決定された。ゲノムアセンブリでは、ゲノムから失われたcox7aが欠落していることが判明した。L . humileに特有であることが判明した遺伝子では、嗅覚受容体、毒液の生成を助けるペプチダーゼ、クチクラ炭化水素（CHC）の合成または異化に関与する脂質活性に関連する遺伝子、DNAメチル化遺伝子など、99の用語が強化された。^[5]

LHUV-1ウイルスは、そのゲノム内に他のウイルスファミリーの断片を含んでいることがわかった。^[5]注目すべきことに、このウイルスは、ツールキットを使用してDNAメチル化を受けることができる単一コピーのDnmt遺伝子を保持している。 ^[5]これに加えて、LHUV-1ゲノムのさまざまな系統内には独立した放散の発生が存在する。祖先遺伝子は増殖する傾向があり、その結果、主要なローヤルゼリータンパク質様遺伝子（MRJPLS）などの遺伝子が活性化され、進化して新しい選択圧に適応することが報告されている。^[5]

研究者らは、DNAメチル化に関するジヌクレオチド遷移SNPがL. humileで10倍多く発生していることを発見した。さらに、SNPデータは他のトランスバージョンと同等であると結論付けられた。DWVとLHUV-1の活発な複製を調査するために、修正RT-PCRを使用して両方のウイルス（DWVとLHUV-1）のRNAマイナス鎖を検出した。^{[1]コンティグn6409配列の存在は、}サンガー配列決定によって確認された。これにより、系統解析によりコンティグを他のジシストロウイルスと位置付けることができた。