
鎌山神社の主神は、日本の伝説上の初代天皇である神武天皇の長兄、彦五瀬命である。古事記と日本書紀によると、神武天皇が大和盆地を征服するために東征を行った際、神武天皇とその兄弟の軍勢は瀬戸内海を北上し、浪速付近に上陸した。彼らは長光彦という地元の王から激しい抵抗を受け、その後の戦いの最中に彦五瀬命は矢に射られた。彼は兄弟たちに、自分たちは太陽の女神アマテラスの子孫であるため、昇る太陽に向かって戦うのは縁起が悪いと忠告し、軍勢は長光彦を迂回して背後(つまり西)から攻撃すべきだと促した。こうして軍は南下して紀伊半島へと向かったが、五瀬命の傷は悪化し、「亀山」と呼ばれる場所で息を引き取った。その場所に彼の古墳が築かれた。
亀山神社の文献記録は、豊臣秀吉の軍勢が紀伊国に侵攻した戦国時代に全て失われたため、神社の創建時期は不明である。 927年の延喜式にその名が記されており、当時すでに相当規模の神社であった。本殿の裏手にある古墳は、皇室によって五瀬命の墓と特定されていた。1381年の記録では、神社の神主は紀伊国の古墳時代の国宮都の子孫を自称する鵜飼家が世襲で務めていた。1585年に豊臣秀吉によって破壊され、1600年に浅野義長によって再建されたが、規模は大幅に縮小された。1669年には、紀州藩初代大名である徳川頼信が本殿と周辺の建物の再建を後援した。しかし、江戸時代を通じて、この神社は藩の地社奉行の管理下にあり、信者も外部からの収入源もなかった。
明治維新後、この神社は1873年に近代神社格付け制度において村神社の位階を与えられた。しかし、国家神道の発展と神武天皇への重きが増すにつれ、1885年に 官幣中社、1915年には官幣大社に昇格した。格付け制度において最下位から最高位まで昇格した唯一の例である。 1938年には大規模な改修が行われた。
竈山墓は、高さ1メートル、直径6メートルの円形古墳で、標高9メートルの丘陵地に位置しています。宮内庁によって皇陵に指定されているため、考古学的発掘調査は禁止されています。
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