HLA-DQ4

HLA-DQ4
	結合ポケットにグリアジンペプチドを含む HLA-DQ の図。
ポリマータイプ	MHCクラスII、DQ細胞表面抗原

HLA-DQ4 (DQ4) は、HLA-DQ (DQ) 血清型の中の血清型サブグループです。血清型は、DQ β 鎖の β ⁴サブセットの抗体認識によって決定されます。DQ の β 鎖はHLA-DQB1遺伝子座によってコード化され、DQ4 は HLA-DQB1 *04対立遺伝子グループによってコード化されます。このグループには現在、2 つの共通対立遺伝子、DQB1 *0401と DQB1 *0402が含まれています。HLA -DQ4と HLA-DQB1*04 は意味がほぼ同義です。DQ4 β 鎖は、遺伝的に連結されたHLA-DQA1対立遺伝子によってコード化された α 鎖と結合して、シスハプロタイプアイソフォームを形成します。 DQ4.3 および DQ4.4 というニックネームが付けられたこれらのアイソフォームは、それぞれ DQA1 *0303および DQA1 *0401遺伝子によってもエンコードされます。

血清型

対立遺伝子

DQB1*0401

DQB1*0402

ハプロタイプ

ドラクエ4.3

DQA1*0303:DQB1*0401は DRB1*0405 と関連しており、インドネシアから日本、東アジアの内陸部に至る西太平洋沿岸地域でよく見られます。日本では、 DR4 遺伝子を介して若年性糖尿病の感受性を付与すると考えられます。

DQA1*0303:DQB1*0402は主に北東アジアと西太平洋沿岸で発見されています。DQA1*0303:DQB1*0402 と類似しています。

ドラゴンクエスト4.2

DQA1*0401:DQB1*0402は、世界的に三峰性分布を示します。最も高い頻度は新大陸の高地で見られ、北西メキシコとアンデス山脈でピークを迎えます。また、ナミビアとボツワナでも高いレベルで見られます。これら 2 つの集団のうち、北日本のアイヌでは中程度に高い頻度です。

DQ4と病気

DQ4 は以下と関連しています:

若年性糖尿病網膜症^[2]^[3]

DR8-DQ4ハプロタイプは、

乳頭状甲状腺癌^[4]
若年性特発性関節炎^[5] DR8アレル経由、^[6]
慢性クラミジア感染症、^[7]
おそらく天疱瘡^[8]

DR4-DQ4(DRB1*0405:DQB1*0401)は以下に関連付けられています:

自己免疫性膵炎、^[9]
若年性1型糖尿病、^[10]
関節リウマチ^[11]

DQA1*0303:DQB1*04 ハプロタイプは以下と関連しています:

クローン病^[12]^[13]日本語訳。

他に挙げられている疾患としては、高地肺水腫、フォークト・小柳・原田病（DRB1*0405、日本語版は上記表を参照）、米国におけるHIV耐性、血友病A（抗FVIIIインヒビター反応）などがあります。

DQ4 配布

左の表は、日本人^[14]のDR-DQ型の値を示しています（一貫性を保つために表現型頻度からハプロタイプ頻度に変換された値）。この表がここに掲載されているのは、日本人集団のDQ4型の多様性が他の地域では見られないからです。DQ4は世界のほとんどの地域では通常まれですが、どこでより頻繁に出現するかは興味深いものです。DQ4のノードは、メキシコ北西部と南アメリカ西部の高地地域でDQA1*0401:DQB1*0402（このページではDQ4.24）ハプロタイプにあり、その地域ではハプロタイプ頻度が40％に達します。アメリカ先住民集団以外では、日本の北海道のアイヌではDQ4.24が10％と高くなっています。アイヌとメソアメリカおよびアンデスの集団、ラコタ・スー族とのつながりを示唆する他の多くの AB ハプロタイプがあり、それらはすべてアイヌよりも高い DQ4 レベルを持っています。アジアにおける DQ4 の連鎖は、DQ4.24 の DR8 (DR*0801、DR*0802、DR*0804) で最も濃厚であるように見え、頻度は琉球諸島からオホーツク、ウルチ、ネギダル、トファラルにかけて約 10% まで上昇し、マンシでは 4% まで低下し、その間では点状レベルになっています。DQB1*0402 のハプロタイプの多様性は、アムール川/日本列島を中心としているように見え、DQB1*0401 の多様性は、ほぼ同様のパターンに従っています。DQ4.24 はスウェーデン人でも高くなっていますが、これは他の HLA 遺伝子座で追跡可能な東から西への遺伝子流動によるものかもしれません。

DQA1*0401:DQB1*0402 は !Kung 族に見られるため、アフリカで進化し、おそらく最も初期の波の 1 つとともに移住したと合理的に推測できます。移住ルートを追跡するのは非常に困難ですが、初期の人類分布として想定されている西太平洋地域/オーストリア・インドルートではなく、中央アジアに第 2 の拡大拠点がある可能性があります。ユーラシアにも見られる !Kung 族の最も一般的なハプロタイプ (たとえば Cw-B) は、最も初期の移住と関連しているようで、沿岸移住を示唆しています。ただし、アイヌ^[15]とアムール川流域^[16]での比較的高い頻度は、約 18 kya からの考古学と一致するトランスバイカル湖を通じた移住を示唆しています。このようなルートでは、朝鮮人が日本人よりも上位に、日本人がさらに上位に、さらに琉球人がさらに上位に、さらに台湾原住民よりも上位にいることになると予想されます。西側では、レバントおよび黒海地域の遺伝子頻度は「拡散」レベルにありますが、ヤズ地域のゾロアスター教徒には頻度が増加している場所があります (DQA1*0401 および DQB1*0402)。したがって、DR8-DQ4.24 ハプロタイプは、おそらく西側起源の 1 つです。

^{DR4-DQA1*0303:DQB1*040XはPNG高地グループ[17]}で高頻度に見られるが、DQ4.24では見られない。DR*0405とDR*410はこれらのDQ型と特異的に関連しており、ある程度のハプロタイプの多様性がある。そのため、DQA1*03:DQB1*04の存在は日本人と近シベリア人の西太平洋地域起源であると思われるが、残念ながら台湾原住民集団におけるこれらのハプロタイプの現在のタイピングはない。インドネシアでの存在は、mtDNAだけでなく他のHLA型によって確立できる逆行性遺伝子流動の結果である 可能性がある。

参考文献

^ IMGT/HLAから派生
^ 三村孝文、船津秀、内潟勇、北野聡、野間秀、清水栄、今野勇、天野聡、荒家正、吉野修、岩本勇、堀誠 (2003)。「若年発症1型糖尿病患者におけるヒト白血球抗原状態と増殖性糖尿病網膜症の関係」。Am J Ophthalmol . 135 (6): 844–8. doi :10.1016/S0002-9394(02)02291-2. PMID 12788125。
^ 三村孝文、船津秀一、内潟勇、北野聡、清水栄、天野聡、山上聡、野間秀一、荒家正之、堀誠 (2005)。「若年発症1型糖尿病および増殖性糖尿病網膜症患者におけるグルタミン酸脱炭酸酵素自己抗体の有病率とHLA遺伝子型との関連」眼科学. 112 (11): 1904–9. doi :10.1016/j.ophtha.2005.05.016. PMID 16157380.
^ ポルト T、コエーリョ I、ボアビダ J、ペレイラ C、ヌネス J、メンドンサ D、マルティンス B、ソブリーニョ L、レイテ V (2006)。「HLA DQ4-DR8 ハプロタイプと甲状腺乳頭癌との関連」。内分泌疾患。64 (2): 179–83。土井：10.1111/j.1365-2265.2006.02445.x。PMID 16430717。S2CID 22695710 。
^ Smerdel A, Lie B, Finholt C, Ploski R, Førre Ø, Undlien D, Thorsby E (2003). 「いくつかの DR-DQ ハプロタイプの HLA クラス I 領域における若年性特発性関節炎の追加感受性遺伝子」.組織抗原. 61 (1): 80–4. doi :10.1034/j.1399-0039.2003.610107.x. PMID 12622778.
^ Smerdel A, Ploski R, Flatø B, Musiej-Nowakowska E, Thorsby E, Førre Ø (2002). 「若年性特発性関節炎 (JIA) は主に HLA-DR8 と関連しているが、DR8-DQ4 ハプロタイプ上の DQ4 とは関連していない」。Ann Rheum Dis . 61 (4): 354–7. doi :10.1136/ard.61.4.354. PMC 1754045. PMID 11874841 .
^ Betsou F, Borrego M, Guillaume N, Catry M, Romão S, Machado-Caetano J, Sueur J, Mention J, Faille N, Orfila J (2003). 「クラミジア・トラコマティス熱ショックタンパク質10と早期妊娠因子の交差反応性」Clin Diagn Lab Immunol . 10 (3): 446–50. doi :10.1128/CDLI.10.3.446-450.2003. PMC 154954. PMID 12738647 .
^ Birol A, Anadolu R, Tutkak H, Gürgey E (2002). 「トルコの天疱瘡患者におけるHLAクラス1およびクラス2抗原」Int J Dermatol . 41 (2): 79–83. doi :10.1046/j.1365-4362.2002.01370.x. PMID 11982641. S2CID 26468899.
^ 川S、太田正、吉沢K、堀内A、浜野H、越智Y、中山K、徳武Y、勝山Y、斉藤S、長谷部O、清沢K (2002). 「HLA DRB10405-DQB10401 ハプロタイプは、日本人における自己免疫性膵炎と関連しています。」消化器科。122 (5): 1264–9。土井：10.1053/gast.2002.33022。PMID 11984513。
^ Kikuoka N, Sugihara S, Yanagawa T, Ikezaki A, Kim H, Matsuoka H, Kobayashi Y, Wataki K, Konda S, Sato H, Miyamoto S, Sasaki N, Sakamaki T, Niimi H, Murata M (2001). 「細胞傷害性Tリンパ球抗原4遺伝子多型は日本人小児の1型糖尿病感受性を付与する：HLA遺伝子型および自己抗体との関連の分析」Clin Endocrinol . 55 (5): 597–603. doi :10.1046/j.1365-2265.2001.01397.x. PMID 11894970. S2CID 39528979.
^ Tsuchiya K, Kimura A, Kondo M, Nishimura Y, Sasazuki T (2001). 「HLA-A と HLA クラス II 対立遺伝子の組み合わせが関節リウマチの感受性を制御する」.組織抗原. 58 (6): 395–401. doi :10.1034/j.1399-0039.2001.580608.x. PMID 11929590.
^ Matake H, Okabe N, Naito S, Yao T (1992). 「クローン病の日本人患者149名を対象としたHLA研究」Gastroenterol Jpn . 27 (4): 496–501. doi :10.1007/BF02777785. PMID 1526431. S2CID 24096011.
^ 中島明、松橋暢、児玉剛、矢崎裕、高添正、木村明 (1995)。「クローン病におけるHLA連鎖感受性および耐性遺伝子」消化器病学。109 (5): 1462–7。doi : 10.1016 /0016-5085(95)90631-2。PMID 7557126。
^ ab Tanaka T, Ohmori M, Yasunaga S, Ohshima K, Kikuchi M, Sasazuki T (1999). 「日本人組織球性壊死性リンパ節炎（菊池病）患者におけるHLAクラスII遺伝子（HLA-DR、-DQ、-DP）のDNAタイピング」。組織抗原。54 （3）：246–253。doi ：10.1034/ j.1399-0039.1999.540305.x。PMID 10519361 。
^ 伴内正人、徳永和人、今西隆也、針原真也、藤澤和人、十次哲也、大本和也 (1996). 「北海道、日高地方に住むアイヌのHLAクラスII対立遺伝子」。私は J Phys Anthropol です。101 (1): 1 ～ 9。ドイ:10.1002/(SICI)1096-8644(199609)101:1<1::AID-AJPA1>3.0.CO;2-Z。PMID 8876810。
^ Uinuk-Ool TS、Takezaki N、Sukernik RI、Nagl S、Klein J (2002)。「HLAクラスII遺伝子頻度によって明らかにされるシベリア先住民族の起源と類似性」。人間の遺伝学。110 (3): 209–226。土井：10.1007/s00439-001-0668-0。PMID 11935333。S2CID 20940785 。
^ Gao X、Bhatia K 、 Trent RJ、Serjeantson SW (1992)。「メラネシア人5集団におけるHLA-DR、 DQヌクレオチド配列多型」。組織抗原。40 (1): 31–37。doi :10.1111/j.1399-0039.1992.tb01954.x。PMID 1440559 。

[1] IMGT/HLAから派生

[2] 三村孝文、船津秀、内潟勇、北野聡、野間秀、清水栄、今野勇、天野聡、荒家正、吉野修、岩本勇、堀誠 (2003)。「若年発症1型糖尿病患者におけるヒト白血球抗原状態と増殖性糖尿病網膜症の関係」。Am J Ophthalmol . 135 (6): 844–8. doi :10.1016/S0002-9394(02)02291-2. PMID 12788125。

[3] 三村孝文、船津秀一、内潟勇、北野聡、清水栄、天野聡、山上聡、野間秀一、荒家正之、堀誠 (2005)。「若年発症1型糖尿病および増殖性糖尿病網膜症患者におけるグルタミン酸脱炭酸酵素自己抗体の有病率とHLA遺伝子型との関連」眼科学. 112 (11): 1904–9. doi :10.1016/j.ophtha.2005.05.016. PMID 16157380.

[4] ポルト T、コエーリョ I、ボアビダ J、ペレイラ C、ヌネス J、メンドンサ D、マルティンス B、ソブリーニョ L、レイテ V (2006)。「HLA DQ4-DR8 ハプロタイプと甲状腺乳頭癌との関連」。内分泌疾患。64 (2): 179–83。土井：10.1111/j.1365-2265.2006.02445.x。PMID 16430717。S2CID 22695710 。

[5] Smerdel A, Lie B, Finholt C, Ploski R, Førre Ø, Undlien D, Thorsby E (2003). 「いくつかの DR-DQ ハプロタイプの HLA クラス I 領域における若年性特発性関節炎の追加感受性遺伝子」.組織抗原. 61 (1): 80–4. doi :10.1034/j.1399-0039.2003.610107.x. PMID 12622778.

[6] Smerdel A, Ploski R, Flatø B, Musiej-Nowakowska E, Thorsby E, Førre Ø (2002). 「若年性特発性関節炎 (JIA) は主に HLA-DR8 と関連しているが、DR8-DQ4 ハプロタイプ上の DQ4 とは関連していない」。Ann Rheum Dis . 61 (4): 354–7. doi :10.1136/ard.61.4.354. PMC 1754045. PMID 11874841 .

[7] Betsou F, Borrego M, Guillaume N, Catry M, Romão S, Machado-Caetano J, Sueur J, Mention J, Faille N, Orfila J (2003). 「クラミジア・トラコマティス熱ショックタンパク質10と早期妊娠因子の交差反応性」Clin Diagn Lab Immunol . 10 (3): 446–50. doi :10.1128/CDLI.10.3.446-450.2003. PMC 154954. PMID 12738647 .

[8] Birol A, Anadolu R, Tutkak H, Gürgey E (2002). 「トルコの天疱瘡患者におけるHLAクラス1およびクラス2抗原」Int J Dermatol . 41 (2): 79–83. doi :10.1046/j.1365-4362.2002.01370.x. PMID 11982641. S2CID 26468899.

[9] 川S、太田正、吉沢K、堀内A、浜野H、越智Y、中山K、徳武Y、勝山Y、斉藤S、長谷部O、清沢K (2002). 「HLA DRB10405-DQB10401 ハプロタイプは、日本人における自己免疫性膵炎と関連しています。」消化器科。122 (5): 1264–9。土井：10.1053/gast.2002.33022。PMID 11984513。

[10] Kikuoka N, Sugihara S, Yanagawa T, Ikezaki A, Kim H, Matsuoka H, Kobayashi Y, Wataki K, Konda S, Sato H, Miyamoto S, Sasaki N, Sakamaki T, Niimi H, Murata M (2001). 「細胞傷害性Tリンパ球抗原4遺伝子多型は日本人小児の1型糖尿病感受性を付与する：HLA遺伝子型および自己抗体との関連の分析」Clin Endocrinol . 55 (5): 597–603. doi :10.1046/j.1365-2265.2001.01397.x. PMID 11894970. S2CID 39528979.

[11] Tsuchiya K, Kimura A, Kondo M, Nishimura Y, Sasazuki T (2001). 「HLA-A と HLA クラス II 対立遺伝子の組み合わせが関節リウマチの感受性を制御する」.組織抗原. 58 (6): 395–401. doi :10.1034/j.1399-0039.2001.580608.x. PMID 11929590.

[12] Matake H, Okabe N, Naito S, Yao T (1992). 「クローン病の日本人患者149名を対象としたHLA研究」Gastroenterol Jpn . 27 (4): 496–501. doi :10.1007/BF02777785. PMID 1526431. S2CID 24096011.

[13] 中島明、松橋暢、児玉剛、矢崎裕、高添正、木村明 (1995)。「クローン病におけるHLA連鎖感受性および耐性遺伝子」消化器病学。109 (5): 1462–7。doi : 10.1016 /0016-5085(95)90631-2。PMID 7557126。

[Sasazuki-14] Tanaka T, Ohmori M, Yasunaga S, Ohshima K, Kikuchi M, Sasazuki T (1999). 「日本人組織球性壊死性リンパ節炎（菊池病）患者におけるHLAクラスII遺伝子（HLA-DR、-DQ、-DP）のDNAタイピング」。組織抗原。54 （3）：246–253。doi ：10.1034/ j.1399-0039.1999.540305.x。PMID 10519361 。

[Ainu_II-15] 伴内正人、徳永和人、今西隆也、針原真也、藤澤和人、十次哲也、大本和也 (1996). 「北海道、日高地方に住むアイヌのHLAクラスII対立遺伝子」。私は J Phys Anthropol です。101 (1): 1 ～ 9。ドイ:10.1002/(SICI)1096-8644(199609)101:1<1::AID-AJPA1>3.0.CO;2-Z。PMID 8876810。

[Uinuk-Ool-16] Uinuk-Ool TS、Takezaki N、Sukernik RI、Nagl S、Klein J (2002)。「HLAクラスII遺伝子頻度によって明らかにされるシベリア先住民族の起源と類似性」。人間の遺伝学。110 (3): 209–226。土井：10.1007/s00439-001-0668-0。PMID 11935333。S2CID 20940785 。

[Melanesian_II-17] ^ Gao X、Bhatia K 、 Trent RJ、Serjeantson SW (1992)。「メラネシア人5集団におけるHLA-DR、 DQヌクレオチド配列多型」。組織抗原。40 (1): 31–37。doi :10.1111/j.1399-0039.1992.tb01954.x。PMID 1440559 。