グルケン局在化シグナル

グルケン局在化シグナル
グルケン局在化シグナル
	Phoebeの予測二次構造とGurkenの配列保存
識別子
シンボル	グルケン
Rfam	RF00626
その他のデータ
RNAタイプ	シスレグ
ドメイン	真核生物
それで	SO:0005836
PDB構造	PDBe

mRNA局在化は、タンパク質をその機能部位に標的化する遺伝子発現の転写後調節の一般的な様式である。^{[ 1 ]} タンパク質は安定性と機能のために細胞環境に大きく依存しているため、mRNA局在化シグナルはタンパク質機能の維持に不可欠である。Gurken局在化シグナルは、ショウジョウバエの多くの種で保存されているRNA調節要素である。この要素は、メッセンジャーRNAのコード領域内のRNAステムループから構成され、卵母細胞の核近くの背側前部キャップへのダイニンを介したGurken mRNA輸送のシグナルを形成する。^[²^]

作用機序

ショウジョウバエの卵形成中、生殖細胞と体細胞間のシグナル伝達により、卵と胚の前後極性が確立される。このプロセスには、TGFα 様タンパク質であるgurken (grk) と、ショウジョウバエ上皮成長因子受容体(EGFR) である torpedo (top) との相互作用が関与する。^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} gurken RNA の局在は、gurken タンパク質の分布を制御することにより、細胞形態を決定する。^{[ 4 ]}卵母細胞の背側前方に局在しない gurken mRNA 転写産物は、翻訳後修飾によりサイレンシングされる。^{[ 3 ]} gurken タンパク質の翻訳後修飾は、タンパク質の局在と機能を決定することが観察されている。卵形成全体を通して gurken 転写産物のポリアデニル化が起こり、ポリ (A)テールの長さによって、卵形成のどの段階で gurken タンパク質がアデニル化されるかが決まる。^{[ 3 ]} 30～50個のグルケンアデニル化残基は初期卵形成に関連し、50～90個のアデニル化残基は後期卵形成に関連している。

グルケン局在シグナルと他の局在シグナルの主な違いは、グルケン局在シグナルはコーディング領域全体に分布しているのに対し、他の局在シグナルの大部分は3'非翻訳領域に存在することです。[9] ^{[ 4 ]}グルケン局在シグナルは、3'非翻訳領域に存在すると正しく機能しません。^{[ 4 ]}

参考文献

↑ Van De Bor V、Davis I (2004年6月)「mRNAの局在化はより複雑になる」Current Opinion in Cell Biology . 16 (3): 300– 307. doi : 10.1016/j.ceb.2004.03.008 . PMID 15145355 .
↑ Van De Bor V, Hartswood E, Jones C, Finnegan D, Davis I (2005). " gurkenとI因子レトロトランスポゾン RNA は共通の局在シグナルと機構を共有する" . Developmental Cell . 9 (1): 51– 62. doi : 10.1016/j.devcel.2005.04.012 . PMID 15992540 .
1 2 3 Brody, Thomas B. 「Gurken mRNAの局在と翻訳に影響を与える要因（パート2/2）」。The Interactive Fly 。2020年5月1日に発生生物学会のWebサーバー経由で取得。
1 2 3 4 Thio, Guene; Ray, Robert; Barcelo, Gail; Schupbach, Trudi (2000 年 5 月 15 日). "ショウジョウバエ卵形成におけるgurken RNAの局在化には転写産物の 5′ および 3′ 領域の要素が必要である" . Developmental Biology . 221 (2): 435– 446. doi : 10.1006/dbio.2000.9690 . PMID 10790337 .

外部リンク

RfamのGurken ローカリゼーションシグナルのページ

[j.ceb.2004.03.008-1] Van De Bor V、Davis I (2004年6月)「mRNAの局在化はより複雑になる」Current Opinion in Cell Biology . 16 (3): 300– 307. doi : 10.1016/j.ceb.2004.03.008 . PMID 15145355 .

[pmid15992540-2] Van De Bor V, Hartswood E, Jones C, Finnegan D, Davis I (2005). " gurkenとI因子レトロトランスポゾン RNA は共通の局在シグナルと機構を共有する" . Developmental Cell . 9 (1): 51– 62. doi : 10.1016/j.devcel.2005.04.012 . PMID 15992540 .

[The_interactive_Fly-3] 1 2 3 Brody, Thomas B. 「Gurken mRNAの局在と翻訳に影響を与える要因（パート2/2）」。The Interactive Fly 。2020年5月1日に発生生物学会のWebサーバー経由で取得。

[dbio.2000.9690-4] 1 2 3 4 Thio, Guene; Ray, Robert; Barcelo, Gail; Schupbach, Trudi (2000 年 5 月 15 日). "ショウジョウバエ卵形成におけるgurken RNAの局在化には転写産物の 5′ および 3′ 領域の要素が必要である" . Developmental Biology . 221 (2): 435– 446. doi : 10.1006/dbio.2000.9690 . PMID 10790337 .

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