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1896年、マレー連邦高等弁務官の職が創設された。高等弁務官は、マラヤにあるイギリスの保護下にある4つの州の連合体であるマレー連邦においてイギリス政府を代表する。高等弁務官の公邸は、マレー連邦の首都クアラルンプールのペルダナ・レイク・ガーデン内にあるキングズ・ハウス（現在はホテル、カルコサ・スリ・ネガラの一部）であった。キングズ・ハウスは、王室高官や名士の来賓にとって重要な場所として機能した。
海峡植民地の総督は、常に当然の権利としてマレー連邦州の高等弁務官を務めており、総督の公邸は海峡植民地の首都シンガポールにあり、総督官邸（現在はシンガポール大統領官邸であるイスタナ）として知られていました。
ペルリス、ケダ、ケランタン、トレンガヌ、ジョホールの5つの保護州（総称して非連合マレー州と呼ばれる）のそれぞれにおいて、イギリス政府は顧問によって代表されていた。顧問は、ペルリス政府顧問、ケダ州スルタン顧問、ケランタン政府顧問、トレンガヌ顧問、ジョホール政府顧問であった。
海峡植民地は 1946 年に解消されました。シンガポールは独自の権利で皇室植民地となりました。残りの海峡植民地 (すなわちペナンとマラッカ) は、マレー連邦諸州、ペルリス、ケダ、ケランタン、トレンガヌ、ジョホールと合併して、もう 1 つの皇室植民地であるマラヤ連邦を形成しました。マレー連邦諸州、ペルリス、ケダ、ケランタン、トレンガヌ、ジョホールの現地統治者は英国に権力を譲渡し、これらの地域は英国の植民地となりました。マラヤ連邦の新しい皇室植民地は、マラヤ連邦総督によって率いられました。
1948 年、英国政府は以前の保護国の現地統治者に権力を返還し、マラヤ連邦は保護国と王室植民地の連合であるマラヤ連邦に変わりました(ペナンとマラッカはマラヤ連邦時代を通じて王室植民地のままでした)。マラヤ連邦はマラヤ高等弁務官によって率いられました。
マラヤが英国から独立した際、事実上の国家元首としてのマラヤ高等弁務官の地位は、9つのマレー諸国の統治者によって任命されたマラヤの最高統治者、またはマラヤのヤン・ディ・ペルトゥアン・アゴンに取って代わられた。「高等弁務官」という称号は、英連邦諸国では一般的であるように、独立したマラヤ（後にマレーシア）の上級英国外交官の称号となった。