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FAM63Bは、ヒトではFAM63B遺伝子によってコードされるタンパク質です。この遺伝子はヒトにおいて高発現しています。また、FAM63B遺伝子は進化の歴史を通じて高度に保存されています。FAM63Bの発見された機能は、キネシン-1軽鎖との相互作用、およびワクシニアウイルスを核から細胞周辺部へ輸送することです。
FAM63Bは15q21.3-q22.1に位置し、染色体15上の90,707塩基対に及ぶ。[ 1 ] [ 2 ]
FAM63Bの正式名称は、配列類似性63ファミリーメンバーBです。[ 3 ] FAM63Bは、一部の出版物では別名KIAA1164としても記載されています。[ 4 ]
FAM63B遺伝子は、9種類のタンパク質バリアントに選択的にスプライシングされる一次転写産物をコードしています。FAM63Bバリアントaは、ヒトで最も一般的なアイソフォームです。[ 2 ]
FAM63BはPfamスーパーファミリーのメンバーであり、タンパク質ファミリー内で相同な機能不明ドメイン（DUF544）を含んでいます。[ 2 ] FAM63Bタンパク質バリアントanは、W476からW533までの二分割トリプトファン結合モチーフも含んでいます。 [ 6 ]タンパク質のバリアントaは、567から574までのアラニンの疎水性領域と、598から617までの混合電荷配列も含んでいます。[ 5 ] FAM63Bタンパク質は、バリアントaの607から621までの小胞体への復帰を指定するシグナル配列（KDEL）を含む可能性があります。
FAM63B の二次構造は、コイル、いくつかのα ヘリックス、および少数のβ シートの組み合わせです。[ 5 ] [ 7 ] [ 8 ] Phyre 2 プログラムは、タンパク質の 23% に α ヘリックス、9% に β ストランド、残りの 59% は無秩序であると予測しています。[ 7 ]無秩序領域は、他のプログラムによって予測されたコイル領域と一致しており、その結果、N 末端から始まる長いコイル状タンパク質の領域が生じます。SOUSI プログラムによると、FAM63B の 265 番目から 280 番目の残基の間には、膜貫通配列である可能性のある 16 アミノ酸の長さの領域があります。[ 9 ]しかし、膜貫通配列は、膜内で安定するためには一般的に少なくとも 20 アミノ酸の長さである必要があるため、膜貫通配列である可能性は低いです。したがって、FAM63Bはどの細胞小器官の膜にも固定されておらず、細胞内および細胞小器官間を自由に移動できる。
FAM63Bの三次構造についてはあまり知られていない。予測される折り畳み構造を図に示す。
FAM63Bタンパク質の翻訳後修飾。[ 9 ]
FAM63BにはVal274とLeu277にNES（核外輸送シグナル）が予測されている。 [ 10 ]また、 FAM63Bには599番目の残基RKRKにNLS（核局在シグナル）が予測されている。 [ 9 ]これに一致して、細胞質/核判別のためのラインハルト法は、FAM63Bが76.7%の信頼度で核に局在すると予測している。NLSとNESシグナルの両方の存在とFAM63BのO-GlcNAc翻訳後修飾は、このタンパク質が核と細胞質の両方に局在し、発見されたタンパク質が核と細胞周辺部の間でワクシニアウイルスのシャトルとして機能することを裏付けている。
FAM63Bは中程度から高い発現を示し、恒常的に発現している。FAM63Bはヒトにおいて普遍的に発現していると考えられる。[ 11 ]
FAM63Bの発現は、胚性幹細胞および分化組織では高いが、胚様体や多能性間葉系幹細胞などの他の前駆細胞では低いか、あるいは発現していない。FAM63Bは多能性および単能性の段階で発現しているが、胚様体、間葉系幹細胞、その他の前駆細胞で起こっているような分化には重要ではないと考えられる。
FAM63BのプロモーターはGXP_5885であり、染色体15の正鎖（58770692、58771462）に位置し、長さは711塩基対である。[ 12 ]
FAM63Bは、 KLC-1というタンパク質と相互作用することが示されている。[ 13 ] KLC-1（キネシン軽鎖1）は、カーゴ結合軽鎖を介してキネシン-1をリクルートするタンパク質であり、二分トリプトファン結合モチーフを含んでいる。[ 13 ]このモチーフは、核周囲空間から細胞周辺部へのウイルスの輸送に必要なワクシニアウイルス膜貫通タンパク質A36に存在する。[ 13 ] A36が存在しない場合、二分トリプトファン結合モチーフを持つタンパク質は、キネシン軽鎖と相互作用し、KLC-1をリクルートし、核から細胞質へのウイルスの輸送を促進することができる。[ 13 ]
FAM63Bタンパク質の発見された機能は、ヒトゲノムにおけるワクシニアウイルスの輸送体である。FAM63Bは、W476とW533の間に二分トリプトファン結合モチーフを含んでいる。[ 13 ]このモチーフには、+2位にQ残基も含まれており、これはKLC-1またはKLC-2に結合するタンパク質で頻繁に見られることがわかっている。[ 13 ] FAM63Bは、A36欠損細胞で発現させた場合に細胞周辺部へのウイルス輸送を回復させ、ワクシニアの細胞質ドメインA36をうまく置き換えることができることが研究されているタンパク質の1つである。[ 13 ]
FAM63Bの具体的な病理学的特徴は不明である。
FAM63BはmiRNAによって制御される4つのネットワークの一部であり、そのうち3つは神経分化とドーパミン作動性遺伝子発現に関連している。[ 14 ]これらの知見は、FAM63Bが統合失調症の検出と治療のバイオマーカーとして使用できる可能性を示唆している。[ 14 ]さらに、FAM63Bの異常なメチル化は統合失調症の発症に関与している可能性がある。[ 14 ] FAM63Bは、関節炎に関連する関連遺伝子のリストで25個中13位にランクされている。[ 15 ]
FAM63Bには、機能が不明な遺伝子であるFAM63Aというパラログが1つあります。FAM63A遺伝子は、469アミノ酸長のタンパク質をコードしており、FAM63Bと76%の相同性があります。[ 16 ]
FAM63Bは、植物を含むすべての多細胞および単細胞真核生物で発見されているが、原生生物と菌類は除外されている。この遺伝子は古細菌でも発見されているが、細菌では発見されていない。[ 17 ]
FAM63Bの最も遠い相同体は、42億5000万年前にヒトの遺伝子から分岐した古細菌であるサーモプラズマタレス古細菌に見られる。 [ 17 ] [ 18 ]
FAM63BはPfamスーパーファミリーの一員であり、タンパク質ファミリー内で相同な機能不明ドメイン（DUF544）を含んでいる。[ 17 ]このタンパク質の領域は、FAM63Bの二分トリプトファン結合モチーフやC末端シグナル配列と同様に、FAM63Bホモログ間で高度に保存されている。
以下の系統樹は、FAM63Bの進化の時間較正を示しています。
