事実（生物学）

FACT（クロマチン転写を促進する、^[1]時にはクロマチン転写を促進する^[2]^[3]）は、真核生物のRNAポリメラーゼII（Pol II）転写伸長にin vitroおよびin vivoの両方で影響を与えるヘテロ二量体タンパク質複合体です。これは、クロマチン化されたDNA テンプレート上での生産的なin vitro Pol II転写に必須であるヒト細胞から精製された因子として1998年に発見されました。^[4]

FACTは140キロダルトン（kDa）と80キロダルトン（kDa）のサブユニットから構成されています。140 kDaのサブユニットはヒト遺伝子SUPT16H（S. cerevisiaeではSPT16 ）によってコードされ、80 kDaのサブユニットはヒト遺伝子SSRP1（S. cerevisiaeではPOB3 ）によってコードされています。酵母中のこれらのサブユニットは両方ともPol II転写伸長に影響を及ぼし、精製されたヒトFACTはモノヌクレオソームとヒストンH2A / H2B二量体に特異的に結合しますが、H3 / H4四量体（ヌクレオソームコア粒子を参照）やPol IIには結合しません。^[5]

タグ付けされた組み換えタンパク質を用いた共免疫沈降アッセイでは、Spt16 サブユニットは H2A/H2B 二量体およびモノヌクレオソームと相互作用するが、H3/H4 四量体とは相互作用しないのに対し、SSRP1 サブユニットは H3/H4 四量体とのみ相互作用し、モノヌクレオソームとは相互作用しないことが示された。Spt16 の高酸性C 末端(既知のヒストンシャペロンの共通特徴) を削除しても、Spt16 が SSRP1 と安定した複合体を形成することは妨げられないが、モノヌクレオソームとの相互作用およびクロマチン化されたテンプレートでの in vitro 転写を刺激する能力は失われる。2 つのサブユニットは一緒になっても、どちらか一方だけでは、遊離ヒストンおよび DNA からのヌクレオソームの形成を刺激することができる (ヒストンシャペロン活性)。これら 2 つのサブユニットはすべての真核生物で高度に保存されており、転写に加えて、DNA 修復および複製にも影響を及ぼすことがわかっている。^[6]

細胞内では、FACTは、ショウジョウバエ 多糸染色体の蛍光抗体染色やショウジョウバエKc細胞抽出物のクロマチン免疫沈降（ChIP）アッセイで見られるように、活発に伸長するPol IIに関与するゲノムの部分に濃縮されています。^[7]

参考文献

^ Winkler, Duane D.; Luger, Karolin (2011-05-27). 「ヒストンシャペロンの事実：ヌクレオソーム再編成の構造的洞察とメカニズム」. The Journal of Biological Chemistry . 286 (21): 18369–18374. doi : 10.1074/jbc.R110.180778 . ISSN 0021-9258. PMC 3099653. PMID 21454601 .
^ Martin, Benjamin JE; Chruscicki, Adam T.; Howe, LeAnn J. (2018-11-01). 「転写はサッカロミセス・セレビシエにおけるFAcilitatesクロマチントランザクション（FACT）複合体とヌクレオソームの相互作用を促進する」。遺伝学。210 （3）：869–881。doi ：10.1534 / genetics.118.301349。ISSN 0016-6731。PMC 6218215。PMID 30237209。
^ Frost, Jennifer M.; Kim, M. Yvonne; Park, Guen Tae; Hsieh, Ping-Hung; Nakamura, Miyuki; Lin, Samuel JH; Yoo, Hyunjin; Choi, Jaemyung; Ikeda, Yoko; Kinoshita, Tetsu; Choi, Yeonhee (2018-05-15). 「FACT複合体は、シロイヌナズナの生殖中のヘテロクロマチンにおけるDNA脱メチル化に必要である」。米国科学アカデミー紀要。115 ( 20): E4720 – E4729。Bibcode :2018PNAS..115E4720F。doi : 10.1073 / pnas.1713333115。ISSN 0027-8424。PMC 5960277 。PMID 29712855。
^ Orphanides, George; LeRoy, Gary; Chang, Chun-Hsiang; Luse, Donal S.; Reinberg, Danny (1998). 「FACT、ヌクレオソームを介した転写産物伸長を促進する因子」. Cell . 92 (1): 105–116. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80903-4 . PMID 9489704. S2CID 11248520.
^ Orphanides, George; Wu, Wei-Hua; Lane, William S.; Hampsey, Michael; Reinberg, Danny (1999). 「クロマチン特異的転写伸長因子 FACT はヒト SPT16 および SSRP1 タンパク質からなる」。Nature . 400 (6741): 284–288. Bibcode :1999Natur.400..284O. doi : 10.1038/22350. PMID 10421373. S2CID 4300397.
^ Belotserkovskaya, Rimma; Oh, Sangtaek; Bondarenko, Vladimir A.; Orphanides, George; Studitsky, Vasily; Reinberg, Danny (2003). 「FACT は転写依存性ヌクレオソーム変化を促進する」. Science . 301 (5636): 1090–1093. Bibcode :2003Sci...301.1090B. doi :10.1126/science.1085703. PMID 12934006. S2CID 26667338.
^ Saunders, Abbie; Werner, Janis; Andrulis, Erik D.; Nakayama, Takahiro; Hirose, Susumu; Reinberg, Danny; Lis, John T. (2003). 「FACT と RNA ポリメラーゼ II 伸長複合体のクロマチンを介した生体内追跡」. Science . 301 (5636): 1094–1096. Bibcode :2003Sci...301.1094S. doi :10.1126/science.1085712. PMID 12934007. S2CID 10064786.

さらに読む

Reinberg, D., Sims, R. (2006). de FACTo ヌクレオソームダイナミクス. Journal of Biological Chemistry, 281 (33) 23297-23391.

[1] Winkler, Duane D.; Luger, Karolin (2011-05-27). 「ヒストンシャペロンの事実：ヌクレオソーム再編成の構造的洞察とメカニズム」. The Journal of Biological Chemistry . 286 (21): 18369–18374. doi : 10.1074/jbc.R110.180778 . ISSN 0021-9258. PMC 3099653. PMID 21454601 .

[2] Martin, Benjamin JE; Chruscicki, Adam T.; Howe, LeAnn J. (2018-11-01). 「転写はサッカロミセス・セレビシエにおけるFAcilitatesクロマチントランザクション（FACT）複合体とヌクレオソームの相互作用を促進する」。遺伝学。210 （3）：869–881。doi ：10.1534 / genetics.118.301349。ISSN 0016-6731。PMC 6218215。PMID 30237209。

[3] Frost, Jennifer M.; Kim, M. Yvonne; Park, Guen Tae; Hsieh, Ping-Hung; Nakamura, Miyuki; Lin, Samuel JH; Yoo, Hyunjin; Choi, Jaemyung; Ikeda, Yoko; Kinoshita, Tetsu; Choi, Yeonhee (2018-05-15). 「FACT複合体は、シロイヌナズナの生殖中のヘテロクロマチンにおけるDNA脱メチル化に必要である」。米国科学アカデミー紀要。115 ( 20): E4720 – E4729。Bibcode :2018PNAS..115E4720F。doi : 10.1073 / pnas.1713333115。ISSN 0027-8424。PMC 5960277 。PMID 29712855。

[Orphanides_1998-4] Orphanides, George; LeRoy, Gary; Chang, Chun-Hsiang; Luse, Donal S.; Reinberg, Danny (1998). 「FACT、ヌクレオソームを介した転写産物伸長を促進する因子」. Cell . 92 (1): 105–116. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80903-4 . PMID 9489704. S2CID 11248520.

[Orphanides_1999-5] Orphanides, George; Wu, Wei-Hua; Lane, William S.; Hampsey, Michael; Reinberg, Danny (1999). 「クロマチン特異的転写伸長因子 FACT はヒト SPT16 および SSRP1 タンパク質からなる」。Nature . 400 (6741): 284–288. Bibcode :1999Natur.400..284O. doi : 10.1038/22350. PMID 10421373. S2CID 4300397.

[Sims_and_Reinberg_2006-6] Belotserkovskaya, Rimma; Oh, Sangtaek; Bondarenko, Vladimir A.; Orphanides, George; Studitsky, Vasily; Reinberg, Danny (2003). 「FACT は転写依存性ヌクレオソーム変化を促進する」. Science . 301 (5636): 1090–1093. Bibcode :2003Sci...301.1090B. doi :10.1126/science.1085703. PMID 12934006. S2CID 26667338.

[Saunders_2003-7] Saunders, Abbie; Werner, Janis; Andrulis, Erik D.; Nakayama, Takahiro; Hirose, Susumu; Reinberg, Danny; Lis, John T. (2003). 「FACT と RNA ポリメラーゼ II 伸長複合体のクロマチンを介した生体内追跡」. Science . 301 (5636): 1094–1096. Bibcode :2003Sci...301.1094S. doi :10.1126/science.1085712. PMID 12934007. S2CID 10064786.