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| ENOD40 | |||||||||
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 ENOD40 ペプチドの配列ロゴ。 | |||||||||
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| シンボル | ENOD40 | ||||||||
| パム | PF08247 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
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| ENOD40 | |
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 ENOD40の二次構造と配列の保存 | |
| 識別子 | |
| シンボル | ENOD40 |
| Rfam | RF01845 |
| その他のデータ | |
| RNAタイプ | 非コードRNA |
| ドメイン | マグノリオ植物門 |
| PDB構造 | PDBe |
enod40 は早期ノジュリン 40 としても知られ、顕花植物に見られる遺伝子です。この遺伝子は、タンパク質遺伝子と非コード RNA遺伝子の両方の特徴を備えています。 [1]この遺伝子の非コード特徴は、タンパク質コード配列よりも広く保存されているという証拠がいくつかあります。 [2]ダイズ では、 enod40は、共生する土壌根粒菌に関連する窒素固定根粒の形成初期段階で発現することがわかっています。 [3] [4]この遺伝子は、リン酸獲得アーバスキュラー菌根を 形成する菌類を含む根でも活性化します。 [5]根粒の発達において調査された 新規RNA 結合タンパク質MtRBP1 ( Medicago truncatula RNA 結合タンパク質1)との相互作用は、ENOD40 が核タンパク質の細胞質再局在化の機能を持つことを示唆しています。 [6] 非マメ科植物の研究では、遺伝子組み換えアラビドプシス系統におけるENOD40の過剰発現により細胞増殖の減少が観察された。 [7]
参照
参考文献
- ^ クレスピ MD、ジュルケヴィッチ E、ポワレ M、ドーベントン＝カラファ Y、ペトロヴィッチ G、コンドロシ E、コンドロシ A (1994)。 「enod40は根粒器官形成中に発現する遺伝子で、植物の成長に関与する翻訳不可能なRNAをコードする。」エンボ J . 13 (21): 5099–5112。土井：10.1002/j.1460-2075.1994.tb06839.x。PMC 395456。PMID 7957074。
- ^ Gultyaev AP、Roussis A (2007)。「enod40 RNAの保存された二次構造と拡張セグメントの同定により、植物における新しいenod40ホモログが明らかになった」。Nucleic Acids Res。35 ( 9 ) : 3144–3152。doi :10.1093/nar/gkm173。PMC 1888808。PMID 17452360。
- ^ ヤン WC、カティナキス P、ヘンドリックス P、スモルダーズ A、デ・フリース F、シュペー J、ファン・カンメン A、ビセリング T、フランセン H (1993)。 「大豆根粒発生中に細胞特異的発現の新しいパターンを示す遺伝子、GmENOD40の特徴付け」。プラント J . 3 (4): 573–585。土井：10.1046/j.1365-313X.1993.03040573.x。PMID 8220464。
- ^ Kouchi H, Hata S (1993). 「大豆根粒発育の初期段階で発現する遺伝子を表す新規ノジュリン cDNA の単離と特性評価」Mol Gen Genet . 238 (1–2): 106–119. doi :10.1007/bf00279537. PMID 7683079. S2CID 23793878.
- ^ van Rhijn P, Fang Y, Galili S, Shaul O, Atzmon N, Wininger S, Eshed Y, Lum M, Li Y, To V, Fujishige N, Kapulnik Y, Hirsch AM (1997). 「アルファルファ菌根における早期ノジュリン遺伝子の発現は、アーバスキュラー菌根およびリゾビウム誘導性根粒の形成に使用されるシグナル伝達経路が保存されている可能性があることを示している」Proc Natl Acad Sci USA . 94 (10): 5467–5472. Bibcode :1997PNAS...94.5467V. doi : 10.1073/pnas.94.10.5467 . PMC 24702 . PMID 11038545.
- ^ Campalans A、Kondorosi A 、 Crespi M (2004)。「Enod40、短いオープンリーディングフレームを含むmRNAは、Medicago truncatulaの核RNA結合タンパク質の細胞質局在を誘導する」。Plant Cell。16 ( 4 ) : 1047–1059。doi :10.1105/ tpc.019406。PMC 412876。PMID 15037734。
- ^ グッゾ F、ポルタルッピ P、グリシ R、バローネ S、ザンピエリ S、フランセン H、リーヴァイ M (2005)。 「シロイヌナズナにおけるenod40によって誘導される細胞サイズの縮小」。J エクスプボット。56 (412): 507–513。土井：10.1093/jxb/eri028。PMID 15557291。
さらに読む
- ポドコウィンスキー J、ズミエンコ A、フロレク B、ヴォイチェホフスキ P、リバルチク A、ブシェシンスキー J、チェシオルカ J、ブラゼヴィチ J、コンドロシ A、クレスピ M、レゴッキ A (2009)。 「ルピナス・ルテウスにおける最も短いマメ科植物ENOD40遺伝子の翻訳および構造解析」。アクタ ビオチン ポール。56 (1): 89-102。土井: 10.18388/abp.2009_2520。PMID 19287803。
- ワン X、ホンテレス J、リージョ A、グアルネリオ C、ファン デ プート D、フェドロバ E、ビセリング T、フランセン H (2007)。 「Medicago truncatula ENOD40-1 と ENOD40-2 はどちらも結節の形成とバクテロイドの発生に関与しています。」J エクスプボット。58 (8): 2033 ～ 2041 年。土井: 10.1093/jxb/erm072。PMID 17452749。
- Gultyaev AP、Roussis A (2007)。「enod40 RNA の保存された二次構造と拡張セグメントの同定により、植物における新しい enod40 ホモログが明らかになりました」。Nucleic Acids Res . 35 (9): 3144–3152. doi :10.1093/nar/gkm173. PMC 1888808 . PMID 17452360。
- 村上 勇、三輪 秀、今泉 安楽 秀、小内 秀、ダウニー JA、川口 正、川崎 誠 (2006)。「ポジショナルクローニングにより、根粒形成における NIN および ENOD40 遺伝子発現に必要な GRAS ファミリーの推定転写因子である Lotus japonicus NSP2 が同定されました」。DNA Res . 13 (6): 255–265. doi : 10.1093/dnares/dsl017 . PMID 17244637。
- Lee A、Lum MR、Hirsch AM (2007)。「Melilotus alba Desr の非結節性、非菌根性 (NodMyc) 変異体 Masym3 における ENOD40 遺伝子発現とサイトカイニン応答」。Plant Signal Behav . 2 (1): 33–42. doi :10.4161/psb.2.1.3734. PMC 2633896. PMID 19516966 。
- Ruttink T、Boot K、Kijne J、Bisseling T、Franssen H (2006)。「ENOD40 はエチレン生合成速度を変化させ、タバコ Bright Yellow-2 細胞の伸長成長に影響を与える」。J Exp Bot . 57 (12): 3271–3282. doi : 10.1093/jxb/erl089 . PMID 16957021。
- Grønlund M, Roussis A, Flemetakis E, Quaedvlieg NE, Schlaman HR, Umehara Y, Katinakis P, Stougaard J, Spaink HP (2005). 「Lotus japonicus における初期ノジュリン Enod40 のプロモーター活性の分析」Mol Plant Microbe Interact . 18 (5): 414–427. doi : 10.1094/MPMI-18-0414 . hdl : 1887/61968 . PMID 15915640.
- Röhrig H、John M、Schmidt J (2004)。「ENOD40ペプチドAによるS-チオレーションによる大豆スクロース合成酵素の改変」。Biochem Biophys Res Commun。325 ( 3): 864–870。doi : 10.1016 /j.bbrc.2004.10.100。hdl : 11858 /00-001M-0000-0012-3B5C-C。PMID 15541370 。
- Dey M、Complainville A、Charon C、Torrizo L、Kondorosi A、Crespi M、Datta S (2004)。「endod40 過剰発現植物である Medicago truncatula およびイネにおける植物ホルモン反応」。Physiol . Plant . 120 (1): 132–139. doi :10.1111/j.0031-9317.2004.0208.x. PMID 15032885。
- Compaan B、Ruttink T、Albrecht C、Meeley R、Bisseling T 、 Franssen H (2003)。「トランスポゾンタグ付き ENOD40 を持つ Zea mays ラインの識別と特性評価」。Biochim Biophys Acta。1629 ( 1–3): 84–91。doi :10.1016/j.bbaexp.2003.08.004。PMID 14522083 。
- Vleghels I、Hontelez J、Ribeiro A、Fransz P、Bisseling T、Franssen H (2003)。 「トマト植物の発育中のENOD40の発現」。プランタ。218 (1): 42–49。土井：10.1007/s00425-003-1081-9。PMID 14508686。S2CID 37198384 。
- Santi C、von Groll U、Ribeiro A、Chiurazzi M、Auguy F、Bogusz D、Franche C、Pawlowski K (2003)。「マメ科植物と放線菌共生における根粒誘導の比較：放線菌根粒の誘導にはENOD40は関与しない」。Mol Plant Microbe Interact。16 ( 9 ): 808–816。doi ：10.1094/MPMI.2003.16.9.808。PMID 12971604。
- Girard G、Roussis A、Gultyaev AP、Pleij CW、Spaink HP (2003)。「大豆の早期根粒形成遺伝子 enod40 によってコードされる RNA の構造モチーフ」。Nucleic Acids Res . 31 (17): 5003–5015. doi :10.1093/nar/gkg721. PMC 212817 . PMID 12930950。
- Larsen K (2003). 「ライグラス (Lolium perenne) ENOD40 ホモログをコードする cDNA の分子クローニングと特性解析」J Plant Physiol . 160 (6): 675–687. doi :10.1078/0176-1617-00962. PMID 12872490.
- Favery B、Complainville A、Vinardell JM、Lecomte P、Vaubert D、Mergaert P、Kondorosi A、Kondorosi E、Crespi M、Abad P (2002)。「共生誘導遺伝子 ENOD40 および CCS52a は、Medicago truncatula における寄生虫と線虫の相互作用に関与している」。Mol Plant Microbe Interact。15 ( 10 ): 1008–1013。doi : 10.1094/MPMI.2002.15.10.1008。PMID 12437298。
- Varkonyi -Gasic E、White DW (2002)。「シロツメクサのenod40遺伝子ファミリー。2種類の遺伝子の発現パターンは、血管機能における役割を示唆している」。Plant Physiol。129 ( 3 ) : 1107–1118。doi :10.1104/ pp.010916。PMC 166505。PMID 12114565。
- Rohrig H, Schmidt J, Miklashevichs E, Schell J, John M (2002). 「大豆 ENOD40 はスクロース合成酵素に結合する 2 つのペプチドをエンコードする」Proc Natl Acad Sci USA . 99 (4): 1915–1920. Bibcode :2002PNAS...99.1915R. doi : 10.1073/pnas.022664799 . PMC 122294 . PMID 11842184.
- Staehelin C、Charon C、Boller T、Crespi M、Kondorosi A (2001)。「早期結節遺伝子enod40を過剰発現するMedicago truncatula植物は、菌根のコロニー形成を加速し、樹枝状体の形成を増強する」。Proc Natl Acad Sci USA。98 ( 26 ): 15366–15371。Bibcode : 2001PNAS ...9815366S。doi : 10.1073/ pnas.251491698。PMC 65035。PMID 11752473。
- Imaizumi-Anraku H, Kouchi H, Syono K, Akao S, Kawaguchi M (2000). 「不完全に発達した根粒維管束を持つ空根粒を形成するLotus japonicusの共生変異体alb1におけるENOD40発現の解析」Mol Gen Genet . 264 (4): 402–410. doi :10.1007/s004380000330. PMID 11129043. S2CID 10727926.
- Sousa C、Johansson C、Charon C、Manyani H、Sautter C、Kondorosi A、Crespi M (2001)。「アルファルファの根皮質における細胞特異的成長反応の誘発のための、初期ノジュリン遺伝子 enod40 (短いオープンリーディングフレームを含む RNA) の翻訳および構造要件」。Mol Cell Biol . 21 (1): 354–366. doi :10.1128/MCB.21.1.354-366.2001. PMC 88808 . PMID 11113209。
- Flemetakis E、Kavroulakis N、Quaedvlieg NE、Spaink HP、Dimou M、Roussis A、Katinakis P (2000)。「Lotus japonicus には、共生組織、非共生組織、胚組織で発現する 2 つの異なる ENOD40 遺伝子が含まれています」。Mol Plant Microbe Interact . 13 (9): 987–994. doi : 10.1094/MPMI.2000.13.9.987 . PMID 10975655。
- Charon C、Sousa C、Crespi M 、 Kondorosi A (1999)。「enod40 発現の変化は、 sinorhizobium meliloti によって誘導される medicago truncatula 根粒の発達を変化させる」。Plant Cell。11 ( 10 ): 1953–1966。doi :10.1105/ tpc.11.10.1953。PMC 144109。PMID 10521525。
- Kouchi H, Takane K, So RB, Ladha JK, Reddy PM (1999). 「イネ ENOD40: イネおよびトランスジェニックダイズ根粒における単離および発現解析」. Plant J. 18 ( 2): 121–129. doi : 10.1046/j.1365-313X.1999.00432.x . PMID 10363365.
- Mirabella R、Martirani L、 Lamberti A、Iaccarino M、Chiurazzi M (1999)。「大豆ENOD40(2)プロモーターはシロイヌナズナで活性であり、時間的および空間的に制御されている」。Plant Mol Biol。39 ( 1): 177–181。doi : 10.1023 / A:1006146627301。PMID 10080720。S2CID 27117762 。
- Corich V、Goormachtig S、Lievens S、Van Montagu M、Holsters M (1998)。「Sesbania rostrata の幹に生息する根粒における ENOD40 遺伝子発現のパターン」。Plant Mol Biol。37 ( 1): 67–76。doi : 10.1023 /A:1005925607793。PMID 9620265。S2CID 6061623 。
- Fang Y、Hirsch AM (1998)。「トランスジェニックアルファルファにおける根粒形成因子とサイトカイニンによる初期根粒遺伝子 ENOD40 発現と誘導の研究」。Plant Physiol . 116 (1): 53–68. doi :10.1104/pp.116.1.53. PMC 35188. PMID 9449836 。
- Charon C、Johansson C、Kondorosi E、Kondorosi A、Crespi M (1997)。「enod40 はマメ科植物の根皮質細胞の脱分化と分裂を誘導する」。Proc Natl Acad Sci USA。94 ( 16 ): 8901–8906。Bibcode : 1997PNAS ...94.8901C。doi : 10.1073/ pnas.94.16.8901。PMC 23190。PMID 11038563。
- Minami E, Kouchi H, Cohn JR, Ogawa T, Stacey G (1996). 「様々なリポキチンシグナル分子に反応した大豆の根における初期結節リン ENOD40 の発現」. Plant J. 10 ( 1): 23–32. doi : 10.1046/j.1365-313X.1996.10010023.x . PMID 8758977.
- Papadopoulou K、Roussis A、Katinakis P (1996)。「Phaseolus ENOD40 は共生および非共生の器官形成プロセスに関与している：根粒および側根の発達中の発現」。Plant Mol Biol。30 ( 3) : 403–417。doi :10.1007/ BF00049320。PMID 8605294。S2CID 2726636 。
- クレスピ MD、ジュルケヴィッチ E、ポワレ M、ドーベントン＝カラファ Y、ペトロヴィッチ G、コンドロシ E、コンドロシ A (1994)。 「enod40は根粒器官形成中に発現する遺伝子で、植物の成長に関与する翻訳不可能なRNAをコードする。」エンボ J . 13 (21): 5099–5112。土井：10.1002/j.1460-2075.1994.tb06839.x。PMC 395456。PMID 7957074。
- Matvienko M、Van de Sande K、Yang WC、van Kammen A、Bisseling T、Franssen H (1994)。「根粒発育の初期段階と後期段階の両方で発現する遺伝子を表す大豆とエンドウ豆の ENOD40 cDNA クローンの比較」。Plant Mol Biol . 26 (1): 487–493. doi :10.1007/BF00039559. PMID 7948896. S2CID 11639458.
外部リンク
- Lotus japonicus ENOD40 の ENTREZ ページ
- Rfamの Early nodulin 40 のページ
- ENOD40 RNAのNONCODEエントリ