二重染色体断片(DM )は染色体外DNAの小さな断片で、乳がん、肺がん、卵巣がん、結腸がん、そして最も有名な神経芽腫を含む多数のヒト腫瘍で観察されています。これらは、腫瘍の発生過程における染色体破砕症[1]の結果としての遺伝子増幅の現れであり、細胞に成長と生存のための選択的優位性を与えます。この選択的優位性は、二重染色体に増幅されたがん遺伝子や薬剤耐性に関与する遺伝子が頻繁に含まれることによって生じます。DMは、実際の染色体と同様にクロマチンで構成され、細胞分裂中に細胞の核内で複製されます。一般的な染色体とは異なり、DMは最大で数百万塩基対の大きさの環状DNA断片で構成され、セントロメアやテロメアは含まれていません。さらに、DMには重要な調節要素が欠けていることが多く、遺伝子が恒常的に発現できるようにしています。ecDNAという用語は、より一般的な意味で DM を指すために使用されることがあります。Double Minute という用語は、顕微鏡でこれらの特徴を視覚化したことから始まります。double はドットがペアで見つかったため、minute はドットが非常に小さいためです。
形成
DM形成の最も一般的に提案されているメカニズムは、クロモトリプシスによるもので、単一の壊滅的なイベントで最大数百のゲノム配置が発生し、再統合されなかった染色体断片が結合してDMが作成されます。[1]クロモトリプシス以外のDM形成の特定のモデルも提案されています。「欠失プラスエピソーム」モデル(「エピソームモデル」とも呼ばれる)では、DNAセグメントが無傷の染色体から切り取られ、環状化され、相互組み換えによってDMとして増幅されます。[2] 「転座-切除-欠失-増幅」モデルは、転座イベント中に、染色体から増幅された遺伝子を削除する過程で、ブレークポイント領域からDMが形成されることを支持しています。 [3]もう一つの提案されたメカニズムは、GLC1細胞株で示された多段階の進化プロセスであり、アンプリコン内の一連の染色体変異イベントによってDMのサブポピュレーションが作成されます。[4]これらのモデルとは別に、いくつかの研究では、細胞融合後の均質染色領域(HSR)の分解、[5]低酸素による脆弱部位の活性化による染色体切断、[6]またはDNAメチル化レベルの低下など、DM形成の他のプロセスが示唆されています。[7]
遺伝子増幅における役割
DM の形成は、遺伝子増幅における役割において特に重要です。遺伝子を保持する能力に加えて、DM は自律的に複製し、さらなる遺伝子増幅を促進します。[2]また、DM の円形で圧縮度の低い構造は、転写要素にアクセスしやすく、エンハンサーと接触しやすい、よりオープンな構造を持つことで、転写レベルの向上を可能にします。[8] 「切断-融合-架橋」サイクルは、細胞分裂が起こる際にテロメアの損失によって姉妹染色分体が繰り返し結合したり引き離されたりする現象を表し、染色体内遺伝子の増幅を説明する一般的なモデルです。このプロセスは DM を直接生成するわけではありませんが、DM 形成の初期段階であることが示唆されているため、DM による遺伝子増幅にも寄与する可能性があります。[9]
がんにおける役割
腫瘍細胞にDMが存在することはあまり一般的ではありませんが、特定の癌では発生率が高いことがわかっています。癌のデータベースを広範に検索したところ、全症例の約1.4%がDM陽性であり、癌の種類の中では神経芽腫が31.7%とDMの頻度が最も高いことがわかりました。[10]癌遺伝子や薬剤耐性遺伝子など、腫瘍細胞の増殖をサポートする特定の遺伝子の増幅は、悪性腫瘍の細胞採用に不可欠です。[11]遺伝子増幅における役割により、DMの存在は腫瘍増殖の加速要因となる可能性があります。その一例は、急性骨髄性白血病の患者におけるDMによるMYC遺伝子の増幅であり、これは生存率の低下と相関しています。[12]ヒト腫瘍細胞における染色体外増幅遺伝子の喪失を誘導すると腫瘍形成能が低下することが示されており、そのため、DMまたは癌遺伝子を運ぶ他のecDNAの除去は癌治療研究の1つの提案された方法である。[13]
遺伝子増幅以外にも、DM は腫瘍の進化と治療抵抗性を促進することで癌に関与している。DM は細胞分裂中に染色体物質を細分化するために通常不可欠なセントロメアとテロメアを欠いているが、有糸分裂染色体のテロメア末端と結合することで娘細胞の核に分離することができる。 [14]このプロセスにより多様な分割が生じ、子孫細胞に受け継がれる DM 数の不均等な分割により腫瘍の不均一性が高まり、腫瘍の進化が促進され、腫瘍細胞が選択的優位性を獲得する可能性が高まる。[15]増幅された遺伝子は、DM に存在するだけでなく、染色体 HSR にも存在する可能性がある。DM と HSR の相互変換は化学療法抵抗性のメカニズムとして示唆されており、薬物治療の標的となる癌遺伝子は染色体外 DNA から選択的に除去されるが、薬物の中止後に再出現する。[16]
参照
- マイクロDNA
- 小核
- 染色体外 DNA (ecDNA)
- 染色体外環状 DNA (eccDNA)
参考文献
- ^ ab Stephens PJ、Greenman CD、Fu B、et al. (2011)。「がんの発症中に単一の壊滅的なイベントで獲得された大規模なゲノム再編成」。Cell。144 ( 1 ) : 27–40。doi : 10.1016 / j.cell.2010.11.055。PMC 3065307。PMID 21215367 。
- ^ ab Carroll, SM; DeRose, ML; Gaudray, P; Moore, CM; Needham-Vandevanter, DR; Von Hoff, DD; Wahl, GM (1988 年 4 月)。「二重微小染色体は染色体欠失由来の前駆体から生成できる」。分子細胞 生物学。8 (4): 1525–1533。doi :10.1128/ mcb.8.4.1525-1533.1988。PMC 363312。PMID 2898098。
- ^ ヴァン・ロイ、ナディーン;ジョー・ヴァンデゾンペレ。メンテン、ビョルン。ヘレン・ニルソン。エルス州デ・スメット。ロッキ、マリアーノ。デ・ペペ、アン。ポールマン、スヴェン。フランク・スペレマン (2006 年 2 月)。 「MYCとATBF1の非シンテニー的共増幅を引き起こす転座-切除-欠失-増幅機構」。遺伝子、染色体、がん。45 (2): 107–117。土井:10.1002/gcc.20272。PMID 16235245。S2CID 37969207 。
- ^ アルベルト、ラバテ;マッキア、ジェマ。ダダボ、ピエトロ。ロノセ、アンジェロ。トロメオ、ドロン。トロンベッタ、ドメニコ。コック、クラース。バルテンハーゲン、クリストフ。ウィーラン、クリストファー・W.パルンボ、オラツィオ;セヴェルニーニ、マルコ。シフォラ、イングリッド。デュガ、マーティン。カレッラ、マッシモ。デ・ベリス、ジャンルカ。ロッキ、マリアーノ。カルボーン、ルシア。ストルラッツィ、クレリア・ティツィアナ(2014年8月18日)。 「ヒト癌におけるMYC増幅による二重分/均一染色領域のゲノム構成と進化」。核酸研究。42 (14): 9131–9145。土井:10.1093/nar/gku590。PMC 4132716。PMID 25034695。
- ^ Iman, DS; Shay, JW (1989年8月15日). 「ヒト体細胞ハイブリッドにおけるmyc遺伝子増幅の修正」. Cancer Research . 49 (16): 4417–22. PMID 2568170.
- ^ Coquelle, Arnaud; Toledo, Franck; Stern, Sabine; Bieth, Anne; Debatisse, Michelle (1998年8月). 「腫瘍の進行における低酸素症の新たな役割」. Molecular Cell . 2 (2): 259–265. doi : 10.1016/s1097-2765(00)80137-9 . PMID 9734364.
- ^ 清水 憲明; 花田 直之; 宇谷 幸一; 関口 直樹 (2007 年 10 月 1 日)。「遺伝子発現と DNA メチル化の調節による遺伝子増幅の染色体内および染色体外部位の相互変換」。Journal of Cellular Biochemistry。102 ( 2 ): 515–529。doi :10.1002/jcb.21313。PMID 17390337。S2CID 29967930 。
- ^ Wei, J; Wu, C; Meng, H; Li, M; Niu, W; Zhan, Y; Jin, L; Duan, Y; Zeng, Z; Xiong, W; Li, G; Zhou, M (2020). 「発がんと進化に関わる染色体外がん遺伝子の生合成と役割」。American Journal of Cancer Research。10 ( 11): 3532–3550。PMC 7716155。PMID 33294253。
- ^ Lo, Anthony Wl; Sabatier, Laure; Fouladi, Bijan; Pottier, Géraldine; Ricoul, Michelle; Mumane, John P. (2002). 「ヒト癌細胞株における自発的テロメア消失によって開始される切断/融合/架橋サイクルによる DNA 増幅」。Neoplasia . 4 ( 6): 531–538. doi :10.1038/sj.neo.7900267. PMC 1503667. PMID 12407447 .
- ^ Movafagh, A; Mirfakhraei, R ; Mousavi-Jarrahi, A (2011). 「がんにおける二重微小染色体の頻発、特に白血病に関する最新の情報」。アジア太平洋がん予防ジャーナル。12 (12): 3453–6。PMID 22471496。
- ^ 清水 暢 (2021年9月28日). 「遺伝子増幅と染色体外環状DNA」.遺伝子. 12 (10): 1533. doi : 10.3390/genes12101533 . PMC 8535887. PMID 34680928 .
- ^ Wong, KF; Siu , LL; Wong, WS (2014年2月)。「ダブルミニッツとMYC増幅:メイ・グリュンワルド・ギムザ法と蛍光in situハイブリダイゼーション法を組み合わせた研究」。American Journal of Clinical Pathology。141 (2): 280–4。doi : 10.1309 /AJCPWUBGT7C0LHIN。PMID 24436278。
- ^ Von Hoff, DD; McGill, JR; Forseth, BJ; Davidson, KK; Bradley, TP; Van Devanter, DR; Wahl, GM (1992 年 9 月 1 日)。「ヒト腫瘍細胞からの染色体外増幅 MYC 遺伝子の除去は腫瘍形成能を低下させる」。米国 科学アカデミー紀要。89 (17): 8165–9。doi : 10.1073 / pnas.89.17.8165。PMC 49877。PMID 1518843。
- ^ Kanda, T; Otter, M ; Wahl, GM (2001 年 1 月)。「染色体テザリングによるウイルスおよび細胞の非動原体染色体外分子の有糸分裂分離」。Journal of Cell Science。114 ( Pt 1): 49–58。doi : 10.1242 /jcs.114.1.49。PMID 11112689 。
- ^ Verhaak, RGW; Bafna, V; Mischel, PS (2019年5月). 「腫瘍の病因と進化における染色体外癌遺伝子増幅」. Nature Reviews. Cancer . 19 (5): 283–288. doi :10.1038/s41568-019-0128-6. PMC 7168519. PMID 30872802 .
- ^ ワシントン州ネイサンソン;ジニ、B;モッタヘデ、J;ヴィスニエイ、K;古賀 哲;ゴメス、G;エスキン、A;ファン・K;ワン、J;増井 和也パウカール、A;ヤン、H;大橋正夫朱、S;ウィコスキー、J;リード、R;ネルソン、SF。クルーシー、TF;ジェームス、CD;ペンシルベニア州ラオ。コーンブルーム、ハワイ州。 JR、ヒース。ウェストバージニア州カヴェニー。フルナリ、FB;ミッシェル、PS(2014年1月3日)。 「染色体外変異体EGFR DNAの動的調節を介した標的療法抵抗性」。科学。343 (6166): 72-6。Bibcode :2014Sci...343...72N。doi :10.1126/science.1241328. PMC 4049335. PMID 24310612 .
- Baskin, F; Rosenberg, RN; Dev , V (1981 年 6 月)。「神経芽細胞腫細胞の取り込み変異体における二重分染色体と不安定な多剤交差耐性との相関」。Proc Natl Acad Sci USA。78 ( 6): 3654–3658。Bibcode : 1981PNAS ...78.3654B。doi : 10.1073/ pnas.78.6.3654。PMC 319629。PMID 6943568。 全文無料。
- Barker PE (1982年2月)。 「ヒト腫瘍細胞における2倍の時間」。癌遺伝学および細胞遺伝学。5 (1):81–94。doi :10.1016/0165-4608(82)90043-7。PMID 6175392 。
- Masters, J; Keeley, B; Gay, H; Attardi, G (1982). 「二重微小染色体の可変含有量は、メトトレキサート耐性ヒト細胞株における表現型の不安定性の程度と相関しない」Mol Cell Biol . 2 (5): 498–507. doi :10.1128/mcb.2.5.498. PMC 369819. PMID 7110138. 全文無料。
- 清水 暢; カプール 亮; 浪花 聡; 坂丸 暢; 山田 剛; 山村 勇; 宇谷 KI (2019年3月20日). 「種間雑種細胞における染色体腕からの無動原体安定二重分節の生成と維持」BMC分子細胞生物学. 20 (1): 2. doi : 10.1186/s12860-019-0186-3 . PMC 6446505 . PMID 31041889.
- コネチカット州ストルラッツィ。ロノセ、A;グアスタディセーニ、MC。トロンベッタ、D;ダダボ、P;ダニエレ、G;ラバテ、A;マッキア、G;スーレース、C;コック、K;ウルマン、R;プルガト、S;オハイオ州パルンボ;カレラ、M; PF、アンブロス。ロッチ、M (2010 年 9 月)。 「固形腫瘍における二重分または均一染色領域としての遺伝子増幅: 起源と構造」。ゲノム研究。20 (9): 1198–206。土井:10.1101/gr.106252.110。PMC 2928498。PMID 20631050。
