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デビッド・J・リップマンは、 1989年[ 1 ]から2017年まで国立衛生研究所（NIH）の国立生物工学情報センター（NCBI ）の所長を務めたアメリカの生物学者です[ 4 ] [ 5 ] 。NCBIは、国際配列データベースコンソーシアムの米国ノードであるGenBank [ 6 ]と、生物医学情報の検索と取得に世界で最も多く利用されているサイトの1つであるPubMedの本拠地です。リップマンは、配列アライメントプログラムBLASTのオリジナル著者の1人であり、バイオインフォマティクスの尊敬される人物です[ 7 ] [ 8 ]。2017年にNCBIを離れ、Impossible Foodsの最高科学責任者になりました[ 9 ]。
リップマンはブラウン大学で学士号を取得し、1980年にニューヨーク州立大学バッファロー校で医学博士号を取得した[ 10 ]。
リップマンは、米国国立衛生研究所の国立医学図書館の一部である国立生物工学情報センターの創設ディレクターでした。彼のリーダーシップの下、NCBIは10人未満のスタッフから500人以上の科学スタッフに成長し、現在ではGenBank、PubMed、PubMed Central、dbGaP、dbSNP、Sequence Read Archive (SRA)、RefSeq、PubChemなど数百の科学および医学データベースをホストしています。NCBIの内部研究プログラムには、Stephen Altschul (BLASTの共著者の1人)、David Landsman、Eugene Koonin [ 11 ] (比較ゲノミクスの多作な著者)、L. Aravindが率いるグループが含まれていました。
リップマンは、1983年のウィルバー・リップマン[ 12 ]アルゴリズム、 1985年のFASTA検索[ 13 ] [ 14 ] 、1990年のBLAST [ 15 ] 、1997年のギャップBLASTおよびPSI-BLAST [ 16 ]など、一連の配列類似性アルゴリズムに関する先駆的な研究で非常に有名です。BLASTは最終的に、この分野で最も広く使用され、引用数の多い（2021年時点で16万件以上の引用）配列アライメントプログラムとなり、NCBI BLASTサーバーは現在、最も頻繁に使用されているリソースの1つです。
リップマンは、NCBI のデニス A. ベンソンらと長年協力して、世界最大のゲノムおよびタンパク質配列データデータベースの 1 つですGenBankの維持と改善に取り組んできました。GenBank は、欧州ヌクレオチドアーカイブおよび日本DNAデータバンクとともに、国際ヌクレオチド配列データベースコラボレーション(INSDC)を構成しており、1990 年以来、ゲノム配列の完全なオープンで制限のないデータベースとして、このようなデータの世界的なリポジトリとなっています。[ 17 ] [ 18 ] [ 19 ]
彼は、数千ものインフルエンザウイルス分離株のゲノムを解読し、公開することを目的とした「インフルエンザゲノム配列決定プロジェクト」の創始者の一人だった。
彼はオープンアクセス出版に関するベセスダ声明の最初の署名者の1人だった。
彼はまた、Biology Directというオープンアクセスで査読付きのオンライン科学ジャーナルの編集長も務めている。[ 20 ]
2017年5月、リップマンはNCBIでの職を辞し、植物由来の肉会社であるインポッシブル・フーズに最高科学責任者として入社した。[ 21 ]
リップマンは、1996年に生体分子技術への卓越した貢献が認められ、生体分子資源施設協会賞を受賞した。
2000年に彼は米国医学アカデミーに選出された。[ 22 ]
2004年に国際計算生物学会からISCBシニアサイエンティスト賞を受賞し、 2009年にはISCBフェローに選出された。[ 2 ] [ 23 ]
2005年、リップマン博士は米国科学アカデミーの会員に選出された。
2013年、彼はホワイトハウスの「オープンサイエンス」変革チャンピオン賞を受賞した。 [ 24 ] [ 25 ]