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| クロモドメイン | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ポリコームクロモドメインの構造。[1] | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | クロモドメイン | ||||||||
| パム | PF00385 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | SM00298 | ||||||||
| プロサイト | PS50013 | ||||||||
| SCOP2 | 1pfb / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd00024 | ||||||||
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クロモドメイン(クロマチン構成修飾子[ 2 ])は、クロマチンのリモデリングと操作に関連するタンパク質によく見られる約40~50個のアミノ酸残基からなるタンパク質構造ドメインです。このドメインは植物と 動物の両方で高度に保存されており、マウスのゲノムなど多くのゲノム内の多数の異なるタンパク質に存在します。クロモドメインを含む遺伝子の中には、クロモドメインを完全に省略した選択的スプライシングアイソフォームが複数あるものもあります。 [3]哺乳類では、クロモドメインを含むタンパク質は、クロマチンのリモデリングとヘテロクロマチン領域の形成に関連する遺伝子制御の側面を担っています。[4]クロモドメインを含むタンパク質は、メチル化ヒストンにも結合し[5] [6] 、 RNA誘導性転写サイレンシング複合体に現れます。[7]ヒストンの修飾では、クロモドメインは非常に保存されています。これらは、クロマチンタンパク質の表面に存在するメチル化されたリジン残基を識別して結合することで機能し、それによって遺伝子転写を制御します。 [8]
参照
参考文献
- ^ Min J、Zhang Y、Xu RM(2003年8月)。「Lys27でメチル化されたヒストンH3へのポリコームクロモドメインの特異的結合の構造的基礎」。Genes Dev。17 (15 ): 1823–8。doi : 10.1101/gad.269603。PMC 196225。PMID 12897052。
- ^ Messmer S、Franke A、Paro R (1992年7月)。「Drosophila melanogasterにおけるポリコームクロモドメインの機能的役割の分析」。Genes Dev . 6 (7): 1241–1254. doi : 10.1101/gad.6.7.1241 . PMID 1628830。
- ^ Tajul-Arifin K、Teasdale R、Ravasi T、Hume DA、Mattick JS (2003)。「マウストランスクリプトームにコードされているクロモドメイン含有タンパク質の同定と分析」。Genome Res . 13 (6B): 1416–1429. doi :10.1101/gr.1015703. PMC 403676 . PMID 12819141.
- ^ Jones DO, Cowell IG, Singh PB (2000). 「哺乳類のクロモドメインタンパク質:ゲノム組織と発現における役割」BioEssays . 22 (2): 124–37. CiteSeerX 10.1.1.575.6410 . doi :10.1002/(SICI)1521-1878(200002)22:2<124::AID-BIES4>3.0.CO;2-E. PMID 10655032.
- ^ Nielsen PR, Nietlispach D, Mott HR, Callaghan J, Bannister A, Kouzarides T, Murzin AG, Murzina NV, Laue ED (2002). 「リジン9でメチル化されたヒストンH3に結合したHP1クロモドメインの構造」. Nature . 416 (6876): 103–7. Bibcode :2002Natur.416..103N. doi :10.1038/nature722. PMID 11882902. S2CID 4423019.
- ^ Jacobs SA 、Khorasanizadeh S ( 2002)。「リジン9メチル化ヒストンH3テールに結合したHP1クロモドメインの構造」。Science。295 ( 5562): 2080–3。Bibcode : 2002Sci ...295.2080J。doi : 10.1126/science.1069473。PMID 11859155。S2CID 38589662 。
- ^ Verdel A, Jia S, Gerber S, Sugiyama T, Gygi S, Grewal SI, Moazed D (2004). 「RITS 複合体によるヘテロクロマチンの RNAi 媒介ターゲティング」. Science . 303 (5658): 672–6. Bibcode :2004Sci...303..672V. doi :10.1126/science.1093686. PMC 3244756. PMID 14704433 .
- ^ Yap KL、Zhou MM(2011年3月)。「遺伝子転写におけるクロモドメインによるリジンメチル化認識の構造とメカニズム」。生化学。50 ( 12 ):1966–80。doi : 10.1021/bi101885m。PMC 3062707。PMID 21288002。
外部リンク
- クロマチンリモデリング: cellsignal.com のクロモドメイン
