ゲノム病原体監視センター

ゲノム病原体監視センターは、オックスフォードシャーにある計算ゲノミクス研究機関である。

ゲノム病原体監視センターは、インペリアル・カレッジ・ロンドンとウェルカム・サンガー研究所の共同プロジェクトとして2015年に開設されました。2017年には、国立健康研究所（NIHR）の資金提供を受けて抗生物質耐性を研究する新しいグローバルヘルス研究ユニットが同センターに設置されることが発表されました。^{[ 1 ] [ 2 ]}これにより、同センターはフィリピンなど多くの国で抗生物質耐性の監視に関わるようになりました。^{[ 3 ]}

2018年から2021年まで、ウェルカム・サンガー研究所とオックスフォード大学が共同でCGPSを運営していました。2021年9月以降、CGPSはオックスフォード大学を拠点としています。

COVID-19パンデミックの間、このセンターはCOG-UKコンソーシアムの一員として資金提供を受けた。^{[ 4 ]}

2022年9月22日、オックスフォード大学ビッグデータ研究所の一部であるゲノム病原体監視センターが、今後5年間のNIHRグローバルヘルス研究ユニット（GHRU）としての活動に対し、700万ポンドの資金を獲得したことが発表された。同センターの研究および能力開発活動は、抗菌薬耐性（AMR）の監視のためのゲノミクスとデータ提供に重点を置いている。^{[ 5 ]}

センターの所長はデビッド・アーネンセン氏です。^{[ 6 ] [ 7 ]}

2019年には、ゲノム病原体監視センター、欧州疾病予防管理センター、ウェルカム・サンガー研究所の間で、ヨーロッパ全域における感染症の監視と追跡を改善するために協力することが合意された。^{[ 8 ]}

センターの後援の下、Epicollect5（分散した観察者からのデータ入力に使用、例えば「市民科学」プログラムによるもの）、Microreact ^{[ 9 ] [ 10 ]}、およびPathogenwatchアプリケーションが生成され、共有されています。^{[ 6 ]} Microreact ^{[ 11 ]}はCOVID-19パンデミック中に広く使用され、 Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages （pangolin）ソフトウェアツールのコンポーネントとなっています。^{[ 7 ] [ 12 ] [ 13 ]}

このセンターは、オックスフォード大学ナフィールド医学部ビッグデータ研究所内に位置しています。

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