バーギーの系統的細菌学マニュアル

『Bergey の系統的細菌学マニュアル』は、細菌種に重点を置き、あらゆる特徴的側面を使用して原核生物の正体を決定するための主要なリソースです。

このマニュアルはバーギーの「細菌学の決定マニュアル」に続いて出版されたが、後者は未知の細菌を同定するためのガイドとして現在でも出版されている。^[1] 1923年にデイヴィッド・ヘンドリックス・バーギーによって最初に出版されたこのマニュアルは、細菌を特定の科に並べることで、その構造的および機能的特性に基づいて細菌を分類するために使用されている。しかし、このプロセスは近年より経験的になっている。 ^[2]

細菌と古細菌の分類学的概要は、マニュアルのバージョン2から分類名を索引付けした派生出版物です。^[3] 2018年9月までは、Bergey's manual trustのウェブサイトから無料で入手できました。 ^[4] ミシガン州立大学は、 NamesforLifeのレコードを索引付けした代替バージョンを提供しています。^[5]

5巻からなるBMSBは、2015年以降、継続的に更新されているオンラインブックであるBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria^{(BMSAB)に正式に置き換えられました。[6]}

組織

1980年に新しい契約で「系統的細菌学」への巻セットの変更が行われ、新しいスタイルには「生物間の関係」が含まれ、全体的に「範囲が拡大」されました。この新しいスタイルは、1984年に最初に出版された4巻セット^[7]に採用されました。巻の情報は次のように分類されました。

第1巻には「医学的および産業的重要性」があると考えられていたグラム陰性細菌のすべての種類に関する情報が含まれていました。第2巻にはグラム陽性細菌のすべての種類に関する情報が含まれていました。第3巻は、古細菌とともに、残りのわずかに異なるグラム陰性細菌のすべてを扱っています。第4巻には、糸状放線菌とその他の類似の細菌に関する情報が含まれています。 ^[8]

現在の巻は、プロテオバクテリア内のクラスの場合のように、多くの高等分類群が表現型ではなく、16S系統発生のみに基づいて定義されている点で、以前の巻とは大きく異なります。^[9]

現在のグループ分けは次のとおりです。

第1巻（2001年）：古細菌と深く分岐した光合成細菌^[10]
第 2 巻 (2005 年):プロテオバクテリア— 3 冊に分かれています。
- 2A: 入門エッセイ^[9]
- 2B:ガンマプロテオバクテリア^[11]
- 2C: プロテオバクテリアの他のクラス^[12]
第3巻（2009年）：フィルミクテス^[13]
第 4 巻 (2011 年):バクテロイデテス、スピロヘータ、テネリクテス(モリクテス)、アシドバクテリア、フィブロバクテレス、フソバクテリア、ディクチョグロミ、ジェマティモナデテス、レンズファエラエ、疣贅菌、クラミジア、およびプランクトミセテス^[14]
第5巻（2部構成）（2012年）：放線菌^[15]

バーギーのマニュアルトラスト

バーギーマニュアルトラストは、バーギーの決定細菌学マニュアルと補足参考書の出版を維持するために 1936 年に設立されました。トラストはまた、トラストとマニュアルの出版社である Springer の共同資金による共同支援で、細菌分類学に多大な貢献をした個人にバーギー賞とバーギーメダルを授与して表彰しています。

バーギーズマニュアルトラストとジョンワイリーアンドサンズ社は、オンライン百科事典『バーギーズマニュアル古細菌と細菌の系統学（BMSAB）』を共同出版しています。2019年にトラストは、ゲノム分類データベース（GTDB）が提供する分類を使用して、系統ゲノムをBMSABに含めることを決定しました。^[16]

批評家の反応

『内科学年報』は、これらの巻について「明快に書かれ、正確で読みやすい」と評し、「特に分類学に興味のある人向けに作られている」としている。^[17]

エディション

バーギーの細菌学マニュアル

Bergey, DH, Harrison, FC, Breed, RS, Hammer, BW & Huntoon, FM (編著、1923)。Bergey 's Manual of Determinative Bacteriology、第 1 版、The Williams & Wilkins Co、ボルチモア、442 ページ。
Bergey, DH, Harrison, FC, Breed, RS, Hammer, BW & Huntoon, FM (編著、1925 年)。Bergeyの決定細菌学マニュアル、第 2 版、The Williams & Wilkins Co、ボルチモア、462 ページ。
Bergey, DH, Harrison, FC, Breed, RS, Hammer, BW & Huntoon, FM (編著、1930 年)。Bergeyの決定細菌学マニュアル、第 3 版、The Williams and Wilkins Co.、ボルチモア、589 ページ。
Bergey, DH, Breed, RS, Hammer, BW, Huntoon, FM, Murray, EGD & Harrison, FC (編著、1934)。Bergey 's Manual of Determinative Bacteriology、第 4 版、The Williams & Wilkins Co、ボルチモア。
Bergey, DH, Breed, RS, Murray, EGD & Hitchens, AP (編著、1939)。Bergey 's Manual of Determinative Bacteriology、第 5 版、The Williams and Wilkins Co.、ボルチモア。
Breed, RS, Murray, EGD & Hitchens, AP (編著、1948年)。Bergey 's Manual of Determinative Bacteriology、第6版、The Williams and Wilkins Co.、ボルチモア、[1]。
Breed, RS, Murray, EGD & Smith, NR (編著、1957年)。Bergey 's Manual of Determinative Bacteriology、第7版、The Williams and Wilkins Co.、ボルチモア、[2]。
Buchanan, RE & Gibbons, NR (編著、1974)。Bergey 's Manual of Determinative Bacteriology、第 8 版、Williams & Wilkins。ボルチモア。
Holt, John G. (編著、1994年)。Bergey 's Manual of Determinative Bacteriology、第9版、Williams & Wilkins。ボルチモア。ISBN 978-0683006032 。