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| アルマジロリピートドメイン | |||||||||
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 β-カテニンのアルマジロドメインの構造。[1] | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | アーム | ||||||||
| パム | PF00514 | ||||||||
| ファム一族 | CL0020 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | SM00185 | ||||||||
| プロサイト | PS50176 | ||||||||
| SCOP2 | 3bct / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd00020 | ||||||||
| メンブラノーム | 350 | ||||||||
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アルマジロリピートは、多くのタンパク質に見られる、長さ約42残基の特徴的な反復アミノ酸 配列です。アルマジロリピートを含むタンパク質には、通常、複数の直列反復コピーが含まれます。[2] [3]各アルマジロリピートは、ヘアピン構造を形成する一対のαヘリックスで構成されています。反復の複数のコピーは、 αソレノイド構造と呼ばれる構造を形成します。
アルマジロリピートを含むタンパク質の例としては、β-カテニン、Sarm1（SARM1）[4] 、α-インポーチン[5] 、プラコグロビン[6]、 大腸腺腫性ポリポーシス（APC）[7]などが挙げられます。
アルマジロという用語は、アルマジロリピートが最初に発見されたショウジョウバエのβ-カテニン遺伝子の歴史的な名前に由来しています。β-カテニンは、以前はカドヘリン細胞接着タンパク質を細胞骨格に結合させるタンパク質であると考えられていましたが、最近の研究では、β-カテニンがα-カテニンのホモ二量体化を制御し、それがアクチンの分岐と束形成を制御することが示されています。[8]しかし、アルマジロリピートは、他の機能を持つさまざまなタンパク質に見られます。このタイプのタンパク質ドメインは、胚発生中のWNTシグナルの伝達に重要です。
構造
アルマジロリピートの3次元フォールドは、 β-カテニンの結晶構造で初めて観察されました。12個のタンデムリピートが、 1ユニットあたり3つのヘリックスを持つアルファヘリックスのスーパーヘリックスを形成しています。 [1]円筒形構造は正に帯電した溝を特徴としており、おそらくβ-カテニンの既知の相互作用パートナーの酸性表面と相互作用します。[9]
参考文献
- ^ ab Huber AH、Nelson WJ、Weis WI（1997年9月）。「β-カテニンのアルマジロリピート領域の 3次元構造」。Cell.90 （5）：871–82。doi ：10.1016 / S0092-8674 （00） 80352-9。PMID 9298899。S2CID 18612343。
- ^ Peifer M 、 Berg S、 Reynolds AB (1994)。「多様な細胞内役割を持つタンパク質が共有する反復アミノ酸モチーフ」。Cell。76 ( 5 ) : 789–91。doi : 10.1016 / 0092-8674(94)90353-0。PMID 7907279。S2CID 26528190。
- ^ Groves MR、Barford D (1999)。「らせん状 反復タンパク質のトポロジカル特性」。Current Opinion in Structural Biology。9 ( 3 ): 383–9。doi :10.1016/S0959-440X(99)80052-9。PMID 10361086 。
- ^ 「Scopusプレビュー - Scopus - Scopusへようこそ」。www.scopus.com 。 2023年3月21日閲覧。
- ^ Herold A、Truant R、Wiegand H、Cullen BR (1998 年 10 月)。「インポーチン α 核内輸入因子の機能ドメイン構成の決定」。J . Cell Biol . 143 (2): 309–18. doi :10.1083/jcb.143.2.309. PMC 2132842. PMID 9786944 .
- ^ McCrea PD、Turck CW、 Gumbiner B (1991 年 11 月)。「E カドヘリンと関連するショウジョウバエのアルマジロタンパク質 (プラコグロビン) の相同体」。Science。254 ( 5036 ): 1359–61。Bibcode : 1991Sci ...254.1359M。doi :10.1126/science.1962194。PMID 1962194 。
- ^ Hirschl D 、Bayer P、Müller O (1996 年 3 月)。「APC タンパク質からのアルマジロ単一反復配列の二次構造」。FEBS Lett。383 ( 1–2): 31–6。doi : 10.1016 /0014-5793(96)00215-3。PMID 8612785。S2CID 36190869 。
- ^ Nusse、Roel、Hans Clevers。「Wnt/β-カテニンシグナル伝達、疾患、および新たな治療法」Cell、vol. 169、no. 6、2017年6月1日、pp. 985–999、doi:10.1016/j.cell.2017.05.016。
- ^ 「Armadillo (IPR000225)」. InterPro . EMBL-EBI.
外部リンク
- 真核生物線形モチーフ リソースモチーフ クラス TRG_NLS_Bipartite_1
- 真核生物線形モチーフ リソースモチーフ クラス TRG_NLS_MonoCore_2
- 真核生物線形モチーフ リソースモチーフ クラス TRG_NLS_MonoExtC_3
- 真核生物線形モチーフ リソースモチーフ クラス TRG_NLS_MonoExtN_4
- 米国国立医学図書館の医学件名標目表(MeSH)にある Armadillo+Domain+Proteins
- PROSITEのArmadillo/plakoglobin ARM リピート[永久リンク切れ ]