| アフィフェラ | |
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| 科学的分類 | |
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| 門: | |
| クラス: | |
| 注文: | |
| 家族: | アフィフェラ科 ヘルトら 2020 [1]
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| 属: | アフィフェラ ウルディアインら 2009 [2]
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| 種 | |
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アフィフェラは、シュードモナス門(細菌門)の属である。 [4] [5] [6] アフィフェラは、微生物マットを含む海洋および河口域に生息する。 [5] [3] [6]アフィフェラは嫌気性菌であり、培養された代表的な菌の1つは光合成が可能である。
語源
属名のアフィフェラは、イギリスの哲学者で画家のS.アフィフに由来しており、分類学を科学として発展させ理解するために不可欠な構造主義の哲学的傾向に関する彼の専門知識と指導に敬意を表して名付けられました。[7]
種
この属には3種が含まれる: [3] [6]
- A. marina(ラテン語の marinaは「海洋」を意味する)は、以前はRhodobium marinumとして知られており、それ以前はRhodopseudomonas marinaとして知られていました。 [5]
- A. pfennigii(新ラテン語 pfennigii 、ドイツの微生物学者ノルベルト・フェニッヒにちなんで命名)は、以前はRhodobium pfennigiiとして知られていました。[6]
- A. aestuarii Buddhi et al. 2020年[3]
形態学と生理学
A. marinaは水素を生成する嫌気性菌です。 [5] A. pfennigiiは運動性があり、桿菌で、グラム染色陰性で、長さ1~2μm、幅0.6μmの細胞です。 [6] A. aestuariiは運動性があり、楕円形または桿菌で、グラム染色陰性で、酸化酵素陽性、カタラーゼ陰性で、ピンク色の光合成細菌です。 [3]
分離
Afifella属の3種は沿岸水域から分離されました。A . marinaはアドリア海沿岸の海綿動物から分離されました。[5] A. pfennigiiはオーストラリア近海のツアモツ諸島ランギロア環礁の汽水池の底生微生物マットから分離されました。[6] A. aestuariiはインド・グジャラート州パタ近郊の河口から分離されました。[3]
文化と成長
A. marina はrhodospirillaceae 培地 (DSMZ 培地 27) で 25 °C、3% NaCl で生育し、光に対して嫌気性である。 [5] A. pfennigii は(DSMZ 培地 27) で 28 °C、1% NaCl と 0.15% NaHCO 3で生育し、光に対して嫌気性である。 [6] A. aestuarii は生育にチアミンを必要とし、光有機従属栄養、光有機従属栄養、化学有機従属栄養の成長モードが可能な唯一のAfifella分離株である。 [3]
ゲノム配列解析
A. marinaは DSM 2698 T株として指定され、GC 含量は 63.8 mol% です。 [5] [3] A. pfennigiiは DSM17143 T株として指定され、GC 含量は 63.8 mol% です。[6] [3] A. aestuariiは JA968 T株として指定され、GC 含量は 63.5 mol% です。16rRNA 遺伝子配列の比較により、 A. aestuarii株 JA968T はA. marina株 DSM 2698 Tと 99.9% の類似性で非常に類似しており、 A. pfennigii株 DSM17143 Tとは 98.4% の類似性がありました。 [3]
参照
参考文献
- ^ Hördt A、García López M、Meier-Kolthoff JP、Schleuning M、Weinhold LM、Tindall BJ、Gronow A、Kyrpides NC、Woyke T、Göker M (2020)。「1,000以上のタイプ株ゲノムの分析により、アルファプロテオバクテリアの分類が大幅に改善 」。Front。Microbiol。11:468。doi:10.3389 / fmicb.2020.00468。PMC 7179689。PMID 32373076。
- ^ ウルディアン M、ロペス=ロペス A、ゴンサロ C、ブッセ HJ、ランガー S、ケンプファー P、ロセロ=モーラ R (2008)。 「Rhodobium marinumとRhodobium pfennigiiを、光従属栄養性アルファプロテオバクテリアの新属であるAfifella marina gen. nov. comb. nov. およびAfifella pfennigii comb. nov.として再分類し、ロドビウム、ロドビウム オリエンティス、およびロドビウム ゴカルネンセの記述を修正しました。」システム アプリケーション 微生物。31 (5): 339–351。土井:10.1016/j.syapm.2008.07.002。PMID 18774253。
- ^ abcdefghij ブッディ、サイラジャ; G.、スレッシュ。グプタ、ディープシカ。 Ch.、サシカラ。 Ch. V.、ラマナ(2020)。 「Afifella aestuarii sp. nov.、光合成細菌」。系統的および進化的微生物学の国際ジャーナル。70 (1): 327–333。土井:10.1099/ijsem.0.003756。ISSN 1466-5026。PMID 31592760。
- ^ LPSNにおけるAC属の分類; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (2020年11月1日). 「命名法上の常設名を持つ原核生物名のリスト(LPSN)がDSMZに移動」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
- ^ abcdefg Reimer LC、Sarda Carbasse J、Podstawka A、Overmann J(2019年11月29日)。「Afifella marina(Imhoff 1984)Urdiain et al. 2009」。BacDive :細菌および古細菌の生物多様性に関する株関連情報。DSMZ。doi : 10.13145 /bacdive13874.20191129.4.1 。2020年9月16日閲覧。
- ^ abcdefgh Reimer LC、Sarda Carbasse J、Podstawka A、Overmann J (2019 年 11 月 29 日)。 「Afifella pfennigii (Caumette et al. 2007) Urdiain et al. 2009」。BacDive: 細菌および古細菌の生物多様性に関する菌株関連情報。 DSMZ。ドイ:10.13145/bacdive13876.20191129.4.1 。2020 年9 月 16 日に取得。
- ^ Afifella in LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (2020年11月1日). 「List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
