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| エルシニア科 | |
|---|---|
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| ペスト菌 | |
科学的分類 
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| ドメイン： | 細菌 |
| 門: | シュードモナドタ |
| クラス： | ガンマプロテオバクテリア |
| 注文： | 腸内細菌 |
| 家族： | エルシニア科 Adeolu 他、2016 |
| 属 | |
エルシニア科はグラム陰性細菌の科で、よく知られている病原菌もいくつか含まれています。例えば、タイプ属エルシニアにはペストの原因菌であるペスト菌が含まれます。この科は、シュードモナス門ガンマプロテオバクテリア綱腸内細菌目に属します。[1]
Yersiniaceae という名前は、ラテン語のYersiniaに由来しており、科のタイプ属と、科を表すために使用される接尾辞「-aceae」を指します。これらを合わせると、 Yersiniaceae は命名上のタイプがYersinia属である科を指します。
生化学的特性と分子シグネチャー[1]
これらの細菌は運動性があり、カタラーゼ陽性であり、二硫化水素を生成しません。
Yersiniaceae 種のゲノム配列の解析により、この科に特有の3 つの保存されたシグネチャーインデル(CSI) が、 TetRファミリー転写調節因子タンパク質と仮説タンパク質に特定されました。[1]これらの CSI は、この科のメンバーを腸内細菌目内の他の科や他のすべての細菌と区別するための信頼性の高い分子的方法を提供します。
歴史的系統学と現在の分類学
2021年現在、エルシニア科には8つの属が有効に公表されている。[2]この科のメンバーはもともと腸内細菌科のメンバーであり、異なる生化学的特徴と異なる生態学的ニッチを持つ、系統学的に無関係な大きな種のグループであった。腸内細菌科への種の当初の割り当ては、主に16S rRNAゲノム配列解析に基づいていたが、これは識別力が低いことが知られており、その結果は使用されるアルゴリズムと生物情報に依存して変化する。それにもかかわらず、解析は依然として多系統分岐を示しており、科内に異なるサブグループが存在することを示している。[1]
2016年、Adeoluらは、比較ゲノム解析と、保存されたゲノム配列、16S rRNA配列、多座配列解析から構築されたさまざまな系統樹の分岐パターンに基づいて、腸内細菌科を7つの新しい科に分類することを提案しました。この科に特有の分子マーカー、特に保存されたシグネチャーインデルも、系統樹とは独立した分類を支持する証拠として特定されました。[1]
参考文献
- ^ abcde アデオル、M;アルナハル、S;ナウシャド、S; S グプタ、R (2016 年 12 月)。 「『腸内細菌目』のゲノムに基づく系統発生および分類学：腸内細菌科、エルウィニア科科 11 月号、ペクトバクテリア科 11 月号、エルシニア科 11 月号、ハフニア科 11 月号、 Morganellaceae 11 月、および Budviciaceaeファム。11月」。系統的および進化的微生物学の国際ジャーナル。66 (12): 5575–5599。土井：10.1099/ijsem.0.001485。PMID 27620848。
- ^ “Family: Yersiniaceae”. lpsn.dsmz.de . 2021年6月5日閲覧。