ライプニッツ協会傘下の研究施設であるライプニッツ研究所DSMZ (ドイツ微生物細胞培養コレクション有限会社)は、ブラウンシュヴァイクに所在する。当初は微生物培養コレクション(DSM)として設立されたDSMZは、細胞培養、オンラインバイオインフォマティクスサービス、オフライン分析サービスを提供するまでに発展した。また、研究プロジェクトの実施も行っている。
2021年現在、DSMZは75,000種類の異なる生物資源を所蔵する、世界で最も多様な生物資源コレクションです。 [ 1 ] [ 2 ]これらには、微生物(32,000以上の細菌株、690の古細菌株、7,000の酵母および真菌株を含む)のほか、840以上のヒトおよび動物細胞培養物、1,500以上の植物ウイルス、940以上のバクテリオファージ、250のプラスミドが含まれます(2021年時点)。[ 2 ]
2010年以来、ライプニッツ研究所DSMZの科学ディレクターは、コンスタンツ大学で博士号を取得した微生物学者のヨルグ・オーバーマンである。[ 3 ]彼はブラウンシュバイク工科大学で微生物学の教授職を務めている。[ 3 ] 2018年8月からは、ベッティーナ・フィッシャーを事務局長として、同研究所を率いている。[ 3 ]
現在、DSMZには約200名の科学者と技術スタッフが勤務しています。[ 4 ]これは公益として認められた企業/非営利団体です。[ 1 ] 2018年、ライプニッツ研究所DSMZは、指令(欧州連合) 511/2014に基づく世界初の登録コレクションとして認められ、名古屋議定書に従って生物資源の取り扱いにおいてすべての利用者に必要な法的確実性を提供しています。[ 5 ] [ 6 ] DSMZは、欧州文化コレクション機構(ECCO)、世界文化コレクション連盟(WFCC)、世界生物多様性情報施設(GBIF)などの国際機関のパートナーです。[ 7 ]
DSMZは、80か国以上に10,000を超える顧客を持つグローバルなサービスプロバイダーであり、生命科学分野の大学、非大学、および産業研究向けに微生物と細胞培養を提供しています。また、ブダペスト条約のガイドラインに従って、生物材料(合計11,700を超える生物資源)の特許およびセキュリティの保管場所としても機能しています。[ 8 ]ドイツで唯一の生物資源の特許保管場所です。[ 9 ] DSMZは、バイオセーフティレベル1および2の生物資源のみを保管しています。
2010年、DSMZはGBDP(Genome Blast Distance Phylogeny)アルゴリズムを使用してDNA-DNAハイブリダイゼーションに類似した値を生成するGGDC(Genome-to-Genome Distance Calculator)ウェブサーバーを構築しました。これは、全ゲノムだけでなく単一遺伝子も比較できます。GGDC 2は2013年に公開されました。[ 10 ] GGDC 3は2021年に公開されました。[ 11 ] [ 12 ]
2012年に、DSMZが維持管理する、自由にアクセスできるデータベースBacDive(細菌多様性メタデータベース)[ 13 ]が設立されました。このデータベースには、さまざまな原核生物の株に関する情報が含まれています。2016年には53,978株の情報が見つかりましたが[ 14 ]、2021年にはその数は82,000株以上に増加しました[ 15 ] 。DSMZが提供する細胞株については、同様の「DSMZCellDive」サービスがあります。
2017年、DSMZは参照ICTV分類データベースのゲノムと比較したGGDC距離に基づいてウイルスゲノムを分類するVICTORを設立した。[ 16 ] 2021年、DSMZはTYGS(Type Strain Genome Server)を設立し、アップロードされた細菌ゲノムをサーバーのデータベース内のタイプ株ゲノム に対するdDDH値に基づいて分類できるようにした。 [ 17 ]
2020年にDSMZで、命名法上の地位を有する原核生物名のリスト(LPSN)の新しいバージョンが確立されました。 [ 18 ] LPSNは2021年にTYGSと密接に統合されました。[ 12 ]
DSMZの8つの部門には、微生物生態学および多様性研究[ 19 ]と微生物ゲノム研究[ 20 ]の研究部門に加えて、微生物[ 21 ] 、バイオエコノミーおよび健康研究のためのバイオリソース[ 22 ] 、ヒトおよび動物細胞株[ 23 ]、植物ウイルス[ 24 ]の収集部門、分析[ 25 ]、バイオインフォマティクス、ITおよびデータベース[ 26 ]の部門が含まれています。独立した若手研究グループ(2021年現在:VirusInteract(植物ウイルスとその宿主との相互作用)および微生物バイオテクノロジー)の設立により、選択された最新のトピックについて研究を行う若手科学者に資格取得の機会が提供されます。