トランス活性化応答要素

トランス活性化応答エレメント (TAR)
トランス活性化応答エレメント (TAR)
	mir-TARの予測される二次構造と配列の保存性
識別子
シンボル	ミール-TAR
代替記号	タール
Rfam	RF00250
その他のデータ
RNAタイプ	遺伝子; miRNA
ドメイン	ウイルス
行く	GO:0035068 GO:0035195
それで	SO:0000233 SO:0001244
PDB構造	PDBe

HIVトランス活性化応答（TAR）要素は、ウイルスプロモーターのトランス活性化とウイルス複製に必要であることが知られているRNA要素です。TARヘアピンは、Tat タンパク質の結合部位として機能する動的構造^[1]であり、この相互作用は長末端反復プロモーターの活性を刺激します。^[2]

さらに解析を進めると、TARはTARステムループの両鎖から成熟したマイクロRNAを生成するプレマイクロRNAであることが判明しました。 ^{[3]これらのmiRNAは、}ERCC1、IER3、^[4]CDK9、Bimの遺伝子をダウンレギュレーションすることで、感染細胞のアポトーシスを防ぐと考えられています。^[5]

ヒトポリオーマウイルス2（JCウイルス）は、後期プロモーターにTAR相同配列を含み^[6]、これはHIV-1由来のTatに応答する。^[7]^[8]

参考文献

^ ルー、ジア;カダクザ、ビーナ M.趙、梁。ら。（2011年）。「HIV-1 TAR RNA とアロステリック認識の立体構造の動的アンサンブル図」。生化学。50 (22): 5042–5057。土井：10.1021/bi200495d。PMID 21553929。
^ Kulinski, T; Olejniczak M; Huthoff H; Bielecki L; Pachulska-Wieczorek K; Das AT; Berkhout B; Adamiak RW (2003). 「HIV-1 TAR RNA ヘアピンの頂端ループはクロスループ塩基対によって安定化される」J Biol Chem . 278 (40): 38892–38901. doi : 10.1074/jbc.M301939200 . PMID 12882959.
^ Ouellet DL、Plante I、Landry P、他 (2008年4月)。「HIV-1 TARエレメントの非対称処理により放出される機能性マイクロRNAの同定」。Nucleic Acids Res 36 ( 7): 2353–2365. doi :10.1093/nar/gkn076. PMC 2367715. PMID 18299284 .
^ Klase Z、Winograd R、Davis J 、 et al. (2009)。「HIV-1 TAR miRNAは細胞遺伝子発現を変化させることでアポトーシスを防ぐ」。Retrovirology。6 : 18。doi : 10.1186 / 1742-4690-6-18。PMC 2654423。PMID 19220914。
^ Narayanan, A; Iordanskiy, S; Das, R; Van Duyne, R; Santos, S; Jaworski, E; Guendel, I; Sampey, G; Dalby, E; Iglesias-Ussel, M; Popratiloff, A; Hakami, R; Kehn-Hall, K; Young, M; Subra, C; Gilbert, C; Bailey, C; Romerio, F; Kashanchi, F (2013 年 7 月 5 日)。「HIV-1 感染細胞由来のエクソソームにはトランス活性化応答エレメント RNA が含まれる」。The Journal of Biological Chemistry。288 (27 ) : 20014–20033。doi : 10.1074/ jbc.m112.438895。PMC 3707700。PMID 23661700。
^ Chowdhury, Mashiul; Taylor, J. Paul; Chang, Chun-Fan; Rappaport, Jay; Khalili, Kamel (1992). 「TAR に類似した配列がヒト免疫不全ウイルス 1 型 Tat による JC ウイルス後期プロモーターの誘導に重要であるという証拠」Journal of Virology . 66 (12): 7355–7361. doi : 10.1128/jvi.66.12.7355-7361.1992 . PMC 240440 . PMID 1331525.
^ 温妻宗一;亀岡正則；杉浦茂樹中道和夫；温妻千代子。三好勲；竹上勉 (2012) 「外因性ヒト免疫不全ウイルス-1 タンパク質 Tat は、神経芽腫細胞株における JC ウイルスの複製を効率的に促進します。」医学ウイルス学ジャーナル。84 (4): 555–561。土井：10.1002/jmv.23239。PMID 22337293。S2CID 35625307 。
^ Krachmarov, Chavdar P.; Chepenik, Lara G.; Barr-Vagell, Sharon; Khalili, Kamel; Johnson, Edward M. (1996). 「ヒト免疫不全ウイルス1のTatタンパク質と細胞タンパク質Purαの会合によるJCウイルスTat応答性転写制御エレメントの活性化」。米国科学アカデミー紀要。93 (24): 14112–14117。Bibcode : 1996PNAS ...9314112K。doi : 10.1073 / pnas.93.24.14112。PMC 34556。PMID 8943069。

外部リンク

Rfamのトランス活性化応答エレメント (TAR) のページ
hiv1-mir-TAR の miRBase ページ

[1] ルー、ジア;カダクザ、ビーナ M.趙、梁。ら。（2011年）。「HIV-1 TAR RNA とアロステリック認識の立体構造の動的アンサンブル図」。生化学。50 (22): 5042–5057。土井：10.1021/bi200495d。PMID 21553929。

[2] Kulinski, T; Olejniczak M; Huthoff H; Bielecki L; Pachulska-Wieczorek K; Das AT; Berkhout B; Adamiak RW (2003). 「HIV-1 TAR RNA ヘアピンの頂端ループはクロスループ塩基対によって安定化される」J Biol Chem . 278 (40): 38892–38901. doi : 10.1074/jbc.M301939200 . PMID 12882959.

[pmid18299284-3] Ouellet DL、Plante I、Landry P、他 (2008年4月)。「HIV-1 TARエレメントの非対称処理により放出される機能性マイクロRNAの同定」。Nucleic Acids Res 36 ( 7): 2353–2365. doi :10.1093/nar/gkn076. PMC 2367715. PMID 18299284 .

[pmid19220914-4] ^ Klase Z、Winograd R、Davis J 、 et al. (2009)。「HIV-1 TAR miRNAは細胞遺伝子発現を変化させることでアポトーシスを防ぐ」。Retrovirology。6 : 18。doi : 10.1186 / 1742-4690-6-18。PMC 2654423。PMID 19220914。

[5] Narayanan, A; Iordanskiy, S; Das, R; Van Duyne, R; Santos, S; Jaworski, E; Guendel, I; Sampey, G; Dalby, E; Iglesias-Ussel, M; Popratiloff, A; Hakami, R; Kehn-Hall, K; Young, M; Subra, C; Gilbert, C; Bailey, C; Romerio, F; Kashanchi, F (2013 年 7 月 5 日)。「HIV-1 感染細胞由来のエクソソームにはトランス活性化応答エレメント RNA が含まれる」。The Journal of Biological Chemistry。288 (27 ) : 20014–20033。doi : 10.1074/ jbc.m112.438895。PMC 3707700。PMID 23661700。

[6] Chowdhury, Mashiul; Taylor, J. Paul; Chang, Chun-Fan; Rappaport, Jay; Khalili, Kamel (1992). 「TAR に類似した配列がヒト免疫不全ウイルス 1 型 Tat による JC ウイルス後期プロモーターの誘導に重要であるという証拠」Journal of Virology . 66 (12): 7355–7361. doi : 10.1128/jvi.66.12.7355-7361.1992 . PMC 240440 . PMID 1331525.

[7] 温妻宗一;亀岡正則；杉浦茂樹中道和夫；温妻千代子。三好勲；竹上勉 (2012) 「外因性ヒト免疫不全ウイルス-1 タンパク質 Tat は、神経芽腫細胞株における JC ウイルスの複製を効率的に促進します。」医学ウイルス学ジャーナル。84 (4): 555–561。土井：10.1002/jmv.23239。PMID 22337293。S2CID 35625307 。

[8] Krachmarov, Chavdar P.; Chepenik, Lara G.; Barr-Vagell, Sharon; Khalili, Kamel; Johnson, Edward M. (1996). 「ヒト免疫不全ウイルス1のTatタンパク質と細胞タンパク質Purαの会合によるJCウイルスTat応答性転写制御エレメントの活性化」。米国科学アカデミー紀要。93 (24): 14112–14117。Bibcode : 1996PNAS ...9314112K。doi : 10.1073 / pnas.93.24.14112。PMC 34556。PMID 8943069。