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| テラバクテリア | |
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| 放線菌類（放線菌亜門） の走査型電子顕微鏡写真 | |
科学的分類 
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| ドメイン： | 細菌 |
| クレード: | Terrabacteria Battistuzzi et al.、2004、Battistuzzi & Hedges、2009 |
| 門 | |
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| 同義語 | |
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テラバクテリアは、グラム陽性菌門（放線菌門と桿菌門）のほか、シアノバクテリア門、クロロフレクソタ門、デイノコッコタ門など、原核生物種の約3分の2を含む分類群です。[1] [2]
テラバクテリアの名前（テラ= 「土地」）は、陸上の生命の進化的圧力に由来しています。テラバクテリアは、環境の危険（乾燥、紫外線、高塩分など）への耐性や酸素発生型光合成などの重要な適応を持っています。また、グラム陽性分類群の細胞壁のユニークな特性は、おそらく陸上の条件に応じて進化し、多くの種で病原性に寄与しています。[2]これらの結果により、陸上適応が原核生物の進化において現在理解されているよりも大きな役割を果たした可能性があるという可能性が残されています。[1] [2]
テラバクテリアは2004年に放線菌門、シアノバクテリア門、デイノコッコ門に対して提案され[1] 、後にバシロタ門とクロロフレキソタ門を含むように拡張された。[2] その他の系統解析[3] [4] [5]は、これらの門の密接な関係を支持している。テラバクテリア門に分類されなかった原核生物の種のほとんどは、それらの種の共通祖先が湿潤な環境にあったと推定されることから、ハイドロバクテリア分類群に割り当てられている。一部の分子系統解析[6] [7]はテラバクテリアとハイドロバクテリアのこの二分法を支持していないが、樹木の根元に焦点を当てたものを含む最新のゲノム解析[4] [5]では、これら2つのグループが単系統であることが判明している。[4]
テラバクテリアとハイドロバクテリアは約30億年前に分岐したと推測されており、その当時は陸地（大陸）に原核生物が定着していたことを示唆している。[2] テラバクテリアとハイドロバクテリアは、2009年までに知られている原核生物の97％と細菌種の99％を含む大きなグループを形成し、光栄養能力（selas = 光）を暗示してセラバクテリアの分類群に分類されている。[8]現在、テラバクテリア +ハイドロバクテリア以外の細菌門は、セラバクテリアの分類群を正当化するものであり、フソバクテリアを含むかどうか議論されている。[2] [4]
「グリドバクテリア」という名称[9]にはテラバクテリアの一部が含まれていたが、グラム陽性菌の大型グループであるバシロタと放線菌は含まれておらず、分子系統学的データによっても裏付けられていない。[1] [2] [3] [6] [7] [4] [5]さらに、グリドバクテリアと命名した論文[9]には分子系統学や統計分析が含まれておらず、広く使用されている3ドメインシステムに従っていなかった。例えば、真核生物が古細菌から分岐したのはごく最近（約9億年前）であると主張していたが、これは化石記録と矛盾しており[10] 、真核生物+古細菌の系統は放線菌の近縁種として細菌の中に組み入れられていた。
2022年に、原核生物の界レベルの分類群に新しいルールが導入され、その新しいルールを提案した同じ2人の著者が2024年に新しい名前を提案しました。[11]彼らは、「細菌界の分類学的に好ましい解決策は、バティストッツィとヘッジスの研究で明らかな細分化を改良して受け入れることであると思われる」と結論付けました。[2]新しい（そして唯一の有効な）名前はバチラティです。[11]
系統発生
BattistuzziとHedges（2009）の系統解析による系統樹は分子時計の補正を加えたもので、次のようになっている。[1] [2]
最近の分子解析により、関係が不明であった他の門も含めて、おおよそ以下の関係が判明した。[12] [13] [14] [15] [16] [17]
一方、コールマンら[4]は、Thermotogota、Deinococcota、Synergistotaおよび関連群からなる系統群をDSTと名付け、さらに分析により、超小型細菌（CPRグループ）はChloroflexotaに近縁であるTerrabacteriaに属する可能性があることを示唆した。この研究によれば、時折含まれるAquificota門はHydrobacteriaに属し、 Fusobacteriota門はTerrabacteriaとHydrobacteriaの両方に属する可能性がある。結果は次の通りである。[4]
参考文献
- ^ abcde Battistuzzi FU、Feijao A、Hedges SB（2004年11月）。「原核生物の進化のゲノムタイムスケール：メタン生成 、光合成、および陸上への定着の起源 に関する洞察」BMC Evolutionary Biology。4：44。doi ： 10.1186 / 1471-2148-4-44。PMC 533871。PMID 15535883。
- ^ abcdefghij Battistuzzi FU、ヘッジズ SB (2009 年 2 月)。 「古代に陸上生活に適応した原核生物の主要なクレード」。分子生物学と進化。26 (2): 335–343。土井：10.1093/molbev/msn247。PMID 18988685。
- ^ ab Bern M、Goldberg D (2005年5月)。「細菌系統学のための代表的タンパク質の自動選択」。BMC Evolutionary Biology。5 ( 1): 34。doi : 10.1186 / 1471-2148-5-34。PMC 1175084。PMID 15927057。
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