シネルギストタ

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シネルギストタ
科学的分類
ドメイン：	細菌 Jumas-Bilak et al. 2021年[1]
門:	Synergistota Jumas-Bilak et al. 2009年
クラス：	Synergistia Jumas-Bilak et al. 2009年
注文：	Synergistales Jumas-Bilak et al. 2009年
家族
アセトミクロビウム科 ミナミフィラ科 アミノチオフィラ科 アミノバクテリア科 デチオスルホビブリオ科 シナギス科 サーモシナギス科 テルモビルガ科
同義語
「シナジスタエオタ」オーレンら。 2015年 「Synergistetes」Jumas-Bilak et al. 2009年 「シナジストータ」Whitman et al. 2018年

Synergistotaはグラム陰性染色を示し、桿菌/ビブリオイド細胞の形状を持つ嫌気性細菌の門です。 ^{[2] [3]} Synergistotaは二層の細胞膜を持っていますが、^{[4] [5]リポ多糖類の}生合成に関与するさまざまなタンパク質の遺伝子はSynergistotaではまだ検出されておらず、非定型の外細胞膜を持っている可能性があることを示唆しています。^{[4] [5] Synergistotaは、動物の消化管、土壌、油井、}廃水処理場など、嫌気性環境の大部分に生息しており、嚢胞、膿瘍、歯周病の領域など、人間の病気の発生部位にも存在します。^{[6] [7]}病気に関係する部位に存在することから、Synergistotaは日和見病原体であると考えられていますが、健康な人の臍の微生物叢や正常な膣内細菌叢にも見られます。^{[7] [8]この門の種は、}歯周病、^[9]胃腸感染症、軟部組織感染症にも関与しています。^{[7]この門の他の種は、嫌気性消化器での}バイオガス生産のための汚泥分解に大きく貢献していることが確認されており、水素ガスを生成することで再生可能エネルギー生産への利用が期待されています。^[10]現在、既知のSynergistotaの種と属はすべて、単一の綱（Synergistia）、目（Synergistiales）、科（Synergistaceae）に属しています。^[3]

配列決定されたSynergistotaゲノムの最近の比較解析により、配列決定されたすべてのSynergistota種または系統樹で観察されるそれらのサブクレードの一部に特有のタンパク質配列において、多数の保存されたシグネチャーインデル（CSI）が特定されました。^[11]特定されたCSIのうち、RpoCタンパク質の300 aaを超える大きな挿入を含む、RpoB、RpoC、UvrD、GyrA、PolA、PolC、MraW、NadD、PyrE、RpsA、RpsH、FtsA、RadAなどの広く分布するタンパク質の32個は、さまざまなSynergistota種に存在しますが、分離された細菌を除いて、これらのCSIは他のすべての生物のタンパク質相同体には見つかりません。これらのCSIは、Synergistota種を他のすべての細菌と区別するための新しい分子マーカーを提供します。^[11] RpoBの13アミノ酸を含む重要なタンパク質の他の7つのCSIは、ジョンケテラ、ピラミドバクター、デチオスルホビブリオの種に独自に存在することがわかり、これらの細菌の間に密接で特異的な関係があることを示しており、系統樹によっても強く裏付けられています。ジョンケテラとピラミドバクターにのみ存在する15の追加CSIは、これら2つの種の間に密接な関連があることを示しています。^[11]最後に、アミノモナス種とテルマネロビブリオ種の密接な関係も、特定された9つのCSIによって裏付けられています。特定された分子マーカーは、Synergistota門の種を科や目などの中間の分類上の階級に分割するための信頼性の高い手段を提供します。^[11]

現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LSPN）^[18]と国立生物工学情報センター（NCBI） ^[19]に基づいています。

• 相乗 植物門Jumas-Bilak et al. 2021年
  • Class Synergistia Jumas-Bilak et al. 2009年
    • Order Synergistales Jumas-Bilak et al. 2009年
      • 「パカエラ」属Ndongo et al. 2017年
        • 種 ?「P.massiliensis」Ndongo et al. 2017年
      • 属「Candidatus Tammella」Hongoh et al. 2007年
        • 種 ?「Ca.T.caduceiae」Hongoh et al. 2007年
      • アミノチオ フィラ科Pradel et al. 2023
        • アミニチオフィラス 属Pradel et al. 2023年
      • アセトミクロ ビア科Pradel et al. 2023
        • アセトミクロビウム 属Soutschek et al. 1985 [ Anaerobaculum Rees et al. 1997年]
      • 科Aminiphilaceae Pradel et al. 2023
        • 属 " Aminirod " Liu et al. 2021年
          • 種 ?「A. プロピオナティフィルス」Liu et al. 2021年
        • アミニフィラス・ ディアス属et al. 2007年
      • アミノバクテリア 科Pradel et al. 2023
        • アミノバクテリ ウム属Baena et al. 1999年
        • アミニビブリオ 属Honda et al. 2013年
        • フレティバクテリ ウム属Vartoukian et al. 2013
        • Genus Lactivibrio Qiu et al. 2014年
      • Dethiosulfovibrionaceae 科Pradel et al. 2023年
        • Dethiosulfovibrio 属Magot et al. 1997年
        • Jonquetella Jumas -Bilak 属 et al. 2007年
        • ピラミドバクター 属Downes et al. 2009
        • ラリミクロビウム 属Jumas-Bilak et al. 2015年
      • シネルギスト 科Jumas-Bilak et al. 2009 [クロストリジウム目 XV 科; サーモシネルギスト科Yang et al. 2021 ]
        • アミノモナス 属Baena et al. 1999年
        • 「Candidatus Caccocola」属Gilroy et al. 2021年
        • クロアシバチルス 属Ganesan et al. 2008年末。ロフトら。 2013年
        • 属「Candidatus Equadaptatus」Gilroy et al. 2022年
          • 種？「Ca. E. faecalis」ギルロイら 2022
        • 属Synergistes Allison et al. 1993
        • テルマナエロビブリオ 属Baena et al. 1999年末。パラニアッパンら。 2013年
      • サーモシナギス 科Yang et al. 2021
        • Genus Thermosynergistes Yang et al. 2021年
      • サーモビルガ 科Pradel et al. 2023
        • サーモビルガ 属Dahle および Birkeland 2006

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