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| テルペンシンセ | |||||||||
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 (+)-ボルニル二リン酸合成酵素: mgおよび生成物との複合体 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | テルペンシンセ | ||||||||
| パム | PF01397 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| SCOP2 | 5eau / スコープ / SUPFAM | ||||||||
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分子生物学では、このタンパク質ドメインはテルペン合成酵素ファミリー (TPS) に属します。その役割は、ステロールや カロチンなどの一次代謝の一部であるテルペンを合成することであり、二次代謝の一部でもあります。このエントリでは、TPS タンパク質の N 末端ドメインに焦点を当てます。
関数
テルペン合成酵素は代謝において重要な分子を生成する役割を担っており、これらの分子はテルペノイドと呼ばれる大きなグループの一部です。特に、N末端ドメインはコパリル二リン酸合成酵素（CPS）活性部位の特徴を持っています。[1]
構造
N末端ドメインはセスキテルペンシクラーゼエピアリストロケン合成酵素のそれと同様のαバレルを形成する。[2]
保全
このタンパク質ドメインを含む配列はテルペン合成酵素ファミリーに属します。この遺伝子ファミリーはtps（テルペン合成酵素）と命名されることが提案されています。配列比較により、モノテルペン（C 10）合成酵素、セスキテルペン（C 15）合成酵素、ジテルペン（C 20）合成酵素の間に類似性が明らかになりました。系統発生に基づいて6つのサブグループに分割され、Tpsa-Tpsfと呼ばれています。[3]
- Tpsaにはベチスピリジン合成酵素が含まれる。[4]
- Tpsbには(-)-リモネン合成酵素が含まれる。[5]
- Tpscにはコパリル二リン酸合成酵素（カウレン合成酵素A）が含まれる。[6]
- Tpsdにはタキサジエン合成酵素[ 7]、 ピネン合成酵素[ 8]、ミルセン合成酵素[9]が含まれます。
- Tpseにはent-カウレン合成酵素Bが含まれる。[10]
- TpsfにはS-リナロール合成酵素が含まれる。[11]真菌 Phaeosphaeria sp. （株L487） では、ゲラニルゲラニルドリン酸からのent-カウレンの合成は、単一の二機能性タンパク質によって促進される。[12]
参照
参考文献
- ^ Chen F, Tholl D, Bohlmann J , Pichersky E (2011). 「植物のテルペン合成酵素ファミリー：植物界全体で高度に多様化した、特殊な代謝のための中規模遺伝子ファミリー」。Plant J. 66 (1): 212–29. doi : 10.1111/j.1365-313X.2011.04520.x . PMID 21443633.
- ^ Whittington DA, Wise ML, Urbansky M, Coates RM, Croteau RB, Christianson DW (2002). 「ボルニル二リン酸合成酵素: 構造とテルペノイドシクラーゼによるカルボカチオン操作戦略」Proc Natl Acad Sci USA . 99 (24): 15375–80. Bibcode :2002PNAS...9915375W. doi : 10.1073/pnas.232591099 . PMC 137724 . PMID 12432096.
- ^ Bohlmann J、Steele CL、Croteau R (1997 年 8 月)。「グランドモミ (Abies grandis) 由来のモノテルペン合成酵素。ミルセン合成酵素、(-)-(4S)-リモネン合成酵素、(-)-(1S,5S)-ピネン合成酵素の cDNA 単離、特性評価、および機能発現」。J . Biol. Chem . 272 ( 35): 21784–92。doi : 10.1074/ jbc.272.35.21784。PMID 9268308。
- ^ [1]、5-エピ-アリストロケン合成酵素、[2]および(+)-デルタ-カジネン合成酵素SWISSPROT
- ^ Hyatt, DC; Youn, B.; Zhao, Y.; Santhamma, B.; Coates, RM; Croteau, RB; Kang, C. (2007). 「4S-リモネン合成酵素前駆体 - Mentha spicata (スペアミント)」。米国科学アカデミー紀要。104 (13). Uniprot.org: 5360–5. doi : 10.1073 /pnas.0700915104 . PMC 1838495 . PMID 17372193 . 2012-08-02閲覧。
- ^ Ait-Ali, T.; Swain, SM; Reid, JB; Sun, T.; Kamiya, Y. (1997). 「Ent-コパリル二リン酸合成酵素、葉緑体前駆体 - Pisum sativum (エンドウ豆)」. The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology . 11 (3). Uniprot.org: 443–54. doi : 10.1046/j.1365-313X.1997.11030443.x . PMID 9107034. 2012-08-02に取得。
- ^ Wildung, MR; Croteau, R. (1996). 「タキサジエン合成酵素 - Taxus brevifolia (Pacific yew)」. The Journal of Biological Chemistry . 271 (16). Uniprot.org: 9201–4. doi : 10.1074/jbc.271.16.9201 . PMID 8621577. S2CID 3191132. 2012-08-02閲覧。
- ^ 「ピネン合成酵素、葉緑体前駆体 - Abies grandis (Grand fir)」。Uniprot.org 。 2012年8月2日閲覧。
- ^ 「ミルセン合成酵素、葉緑体前駆体 - Abies grandis (Grand fir)」。Uniprot.org 。 2012年8月2日閲覧。
- ^ Yamaguchi, S.; Saito, T.; Abe, H.; Yamane, H.; Murofushi, N.; Kamiya, Y. (1996). 「Ent-kaur-16-ene synthase, chloroplast precursor - Cucurbita maxima (Pumpkin)」. The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology . 10 (2). Uniprot.org: 203–13. doi :10.1046/j.1365-313X.1996.10020203.x. PMID 8771778 . 2012-08-02に取得。
- ^ 「リナロール合成酵素 - Clarkia concinna (Red Ribbons)」。Uniprot.org 。 2012年8月2日閲覧。
- ^ Kawaide H, Imai R, Sassa T, Kamiya Y (1997 年 8 月). 「真菌 Phaeosphaeria sp. L487 由来の ent-カウレン合成酵素。真菌ジベレリン生合成における二機能性ジテルペンシクラーゼの cDNA 単離、特性評価、および細菌発現」。J . Biol. Chem . 272 (35): 21706–12. doi : 10.1074/jbc.272.35.21706 . PMID 9268298。