南イリノイの鉱山労働者

マイナーズは2007年5月23日、ゲートウェイ・グリズリーズとのアウェー戦で初シーズンを開始し、その夜にティム・ドーンが球団初のホームランを放った。6日後、ホーム初戦でエバンズビル・オッターズと対戦し、6,251人の観客の前で9対6で勝利した。チームは259,392人のファンを迎え、フロンティアリーグの観客動員記録を更新した（以前の記録は2004年にゲートウェイが記録した217,500人）。マイナーズはまた、フロンティアリーグ史上初めて1試合平均5,000人以上のファン（5,086人）を集めたチームとなった。さらに、サザンイリノイ・マイナーズのファンは、メインマスコットのビッグ・ジョンを応援し、2008年4月2日にCNBCが過去最大規模のオンライン投票で選出したマイナーリーグ野球のベストロゴ賞の総合優勝に大きく貢献した。^{[ 5 ]}審判はイリノイ州コブデンのウェズリー・ペンロッドだった。

初年度に49勝47敗の成績を残したマイナーズは、2008年に初のプレーオフ出場を果たした。ポストシーズン・オールスターに選ばれた外野手のジョーイ・メトロポロス（打率.315、20本塁打、66打点）とフロンティアリーグ最優秀投手ライアン・バード（13勝3敗、防御率2.48、リーグ最多の152奪三振）に率いられたサザン・イリノイは58勝38敗の成績で、ワイルドカード枠でポストシーズンに進出した。9月8日、ホームでウィンディシティ・サンダーボルツを4対2で破り、チーム史上初のプレーオフ勝利を挙げた。しかし、最終的にリーグ優勝を果たしたサンダーボルツとのディビジョンシリーズで4試合で敗退した。

2010年シーズンはマイナーズにとって歴史的なシーズンとなり、6月9日から6月28日まで20連勝というフロンティアリーグ記録を樹立し、合計64勝でリーグ史上2番目に多いシーズン勝利数を記録した。その年、レントワンパークはフロンティアリーグ初のオールスターゲームを開催し、マイナーズはオールスターブレイク時点で39勝9敗の成績を収め、10人の選手をシーズン中盤のショーケースに送り込んだ。リーグ最高の64勝32敗の総合成績のおかげで、初のディビジョンタイトルを獲得し、2度目のプレーオフ出場を果たしたが、リバーシティラスカルズとの激戦の5試合シリーズで3勝2敗で敗れた。^{[ 6 ]}

^{2011年に58勝38敗}の成績で再びポストシーズンに進出したものの、ディビジョンシリーズで再びリバーシティに敗れたサザンイリノイは、55勝39敗でワイルドカードとしてプレーオフに進出し、ウィンディシティとシャウムバーグブーマーズを1勝上回った^。 [ 8 ^{]マイナーズは}、リーグ最高の64勝32敗の成績で終わったトラバースシティビーチバムズとディビジョンシリーズで対戦した。アウェーで行われた第1戦で、マイナーズはポストシーズンオールスター外野手のハビエル・ヘレーラ（シーズン序盤にロックフォードリバーホークスとのトレードで獲得）のソロホームランと、エース右腕のデビッド・ハーデンの8イニング無失点の好投により、ビーチバムズを1対0で完封した。第2試合では、トラバースシティが初回に3点を挙げ、6回には4-0とリードしたが、マイナーズが6回に3点を返し、8回にはコーリー・ハリチャックのタイムリーヒットで同点に追いついた。10回も4-4の同点で迎えた場面で、外野手のケン・グレゴリーが勝ち越しのソロホームランを放ち、これが最終的に5-4でマイナーズの延長戦勝利の決め手となった。サザンイリノイは、ホームでの第3戦を4-3で制し、優勝候補のビーチバムズをスイープし、クラブ史上初のフロンティアリーグチャンピオンシップシリーズに進出した。

チャンピオンシップシリーズでは、マイナーズは、ゲートウェイ・グリズリーズを5試合シリーズで3勝2敗で破ったフローレンス・フリーダムと対戦した。マイナーズは再びアウェーでシリーズを開始し、再びシリーズの最初の2試合を制した。第1戦では、3回に1対0でリードされていたサザン・イリノイは、捕手のクリス・アンダーソン（2ランホームラン）と二塁手のキャノン・レスターの連続ホームランで3対1とリードを奪った。フローレンスは6回に2点を返して同点に追いついたが、7回にフリーダムの2つのエラーで決勝点が入った。マイナーズは8回にグレゴリーのタイムリー二塁打で得点を締めくくり、5対3で勝利した。

第2試合では、サザンイリノイ大学がグレゴリー、レスター、そして遊撃手のジェイク・カーゼのホームランで6回終了時点で5対2とリードを奪った。フローレンスは7回に2点を返して1点差に詰め寄ったが、マイナーズは8回に外野手のチャド・マドックスの3ランホームランを含む4点を挙げ、9対4で勝利した。

フローレンスはレント・ワン・パークで行われた第3戦で4対3の僅差で勝利し、マイナーズのポストシーズン全勝を阻止し、9月16日にホームで行われる第4戦へと駒を進めた。マドックスの2ランホームランを含む4回裏の3得点により3対0とリードしたフローレンスは、7回に2点、8回に1点を奪い、同点に追いついた。試合は3対3のまま延長戦に突入し、12回裏まで両チームとも得点を奪えなかった。満塁2アウトの場面で、カーゼはフローレンスのブレント・チョバンから四球を選び、押し出しで優勝を決め、マイナーズはチーム史上初のリーグタイトルを獲得した。シリーズで打率.500（16打数8安打）、2二塁打、2本塁打、3打点を記録したレスターは、チャンピオンシップシリーズのMVPに選ばれた。

マイナーズは2009年以来初めて2013年にプレーオフ進出を逃したが、2014年には60勝36敗の成績でシーズンを終え、 9月³日（レギュラーシーズンの最終日前日）にレイク・エリー・クラッシャーズ^{とのアウェー戦で勝利し、}イースト・ディビジョンのタイトルを獲得した。これはチーム史上2度目のディビジョン優勝だった。同年、チームは2009年のフロンティア・リーグMVPであるジョーイ・メトロポロスの背番号31を永久欠番とした。これはチーム史上初の永久欠番となった。エース左腕のマット・バイウォーターは、チームにとって2度目となるフロンティア・リーグ最優秀投手賞を受賞した。

2015年、マイナーズは63勝33敗でリーグ最高の成績を収め、チーム史上2番目に良い成績でシーズンを終えた。^{[ 10 ]}また、8月30日にトラバースシティ戦で三塁手スティーブ・マリーノがサヨナラ2ランホームランを放ち、記憶に残る形でイーストディビジョン優勝を決めたことで、2年連続のイーストディビジョン優勝も果たした。右腕先発のアダム・ロペスは10勝0敗、防御率1.86で、マイナーズの投手として2年連続でリーグの最優秀投手賞を受賞した。マイナーズはまた、2015年に歴代最多勝利と最多奪三振の記録を持つライアン・バードの背番号13を永久欠番とし、チーム史上2番目の永久欠番となった。

2016年、マイナーズは創立10周年シーズンをフィールド上でのさらなる成功で祝い、レギュラーシーズンは2年連続で63勝33敗を記録した。^{[ 11 ]} 2位のエバンズビル・オッターズに7勝1/2敗差をつけて3年連続の地区優勝（今回は西地区）を果たし、フロンティアリーグ史上2 番目に3年連続で地区優勝を果たしたチーム（2005～2007年のワシントン・ワイルドシングスに次ぐ）となり、リーグ史上初めて3シーズン連続で60勝以上を挙げたチームとなった。

マイナーズは2017年、選手兼コーチ兼インストラクターのラルフ・サンタナの背番号20を永久欠番とした。サンタナは2007年に二塁手としてチーム初のポストシーズン・オールスターに選出され、2008年から2013年まで打撃コーチを務め、2012年にはフロンティアリーグ年間最優秀コーチ賞を受賞した。チームはその年を39勝57敗の成績で終え、史上初（そして現在まで唯一）の負け越しシーズンとなった。

マイナーズは2018年に48勝47敗の成績を残し、過去12年間で11回目の勝ち越しシーズンとなった。

2019年、マイナーズは53勝43敗の成績でシーズンを終え、13年間で12回目の勝ち越しシーズンとなった。また、2016年以来となるポストシーズンオールスター選手も輩出した。チェイス・カニンガムは10勝5敗、防御率3.23、132奪三振、チーム記録となる136 ＋2 / 3イニングを投げ、フロンティアリーグ最優秀投手賞を5人目に受賞し、外野手のカイル・デイビスもポストシーズンオールスターに選ばれた。カニンガムは勝利数と投球回数でリーグトップとなり、奪三振数では1つ差で2位となった。デイビスはホームラン（15）と打点（62）でリーグトップ10入りを果たした。 

2019年10月にフロンティアリーグが旧キャンナムリーグから5チームを吸収したため、マイナーズはリーグの新設されたミッドウェスタンディビジョンに所属することになった。マイナーズの2020年シーズンは、フロンティアリーグがCOVID-19パンデミックのため2020年チャンピオンシップシーズンの中止を発表した6月24日に中断された。

2021年10月6日、54勝42敗（勝率.563）で西地区3位となったもののプレーオフ進出を逃したオーナーのジェインとジョン・シモンズは、プロ野球から引退し、サザン・イリノイ・マイナーズの運営を終了すると発表した。^{[ 12 ] [ 13 ]}

2021年には、マイナーズの野球カードの最終セットが制作された。これらのカードはこれまで、マイナーリーグ球団向けのカード製造を専門とするグランドスタンド社によって印刷・販売されていた。

マイク・ピントはマイナーズの監督を務めており、今シーズンで14年目だった。また、マイナーズの最高執行責任者（COO）を兼任するようになって4年目だった。