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コプト正教会のアレクサンドリア教皇座は、歴史的にエジプトのアレクサンドリアに置かれている。一般にはアレクサンドリア教皇座、あるいは聖マルコの聖座として知られており、コプト教皇は聖マルコを正当な後継者であると主張している。
エジプトがイスラム教徒に征服された後、統治権力はアレクサンドリアからカイロに移った。クリストドロス教皇の在位中、コプト教皇の公式住居はカイロの吊り下げ教会に移された。[ 1 ]
アレクサンドリアのコプト正教会の教皇の現在の座は、アレクサンドリアとカイロの両方にあり、総主教宮殿、聖マルコ・コプト正教会大聖堂（聖マルコ大聖堂として知られる）、およびその他の総主教関連施設が収容されている複合施設内にあります。
エジプトのニトリア砂漠（ワディ・エル・ナトルン）のスケテス地方にある聖ピショイ修道院の外壁内には、主要な総主教の居住区も存在する。ここは、教皇が霊的静養を行う際や、東方正教会、あるいはローマ・カトリック教会との間で主要な教会会議を開催する際に使用される。