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| SecYタンパク質/Sec61α | |||||||||
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 タンパク質伝導チャネルの構造。[1] | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | 秘書 | ||||||||
| パム | PF00344 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00612 | ||||||||
| SCOP2 | 1rh5 / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.A.5 | ||||||||
| OPMスーパーファミリー | 19 | ||||||||
| OPMタンパク質 | 1rh5 | ||||||||
| メンブラノーム | 165 | ||||||||
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SecYタンパク質は、細菌のSec輸出経路とタンパク質分泌ATPase複合体の主要な膜貫通サブユニットであり、 SecYEGトランスロコンとしても知られています。SecYEG複合体の相同体は真核生物と古細菌に見られ、サブユニットはSec61αとして知られています。[2]
グラム陰性細菌では、シグナルペプチドを運ぶタンパク質の一部が内膜を横切って分泌されるが、これはプレタンパク質トランスロカーゼ経路を介して起こる。タンパク質は前駆物質として細胞質で生成され、膜内のトランスロカーゼ成分に導くためにシャペロンサブユニットを必要とする。[3]そこから、成熟したタンパク質は外膜に向けられるか、ペリプラズムタンパク質として残る。トランスロカーゼタンパク質サブユニットは細菌染色体上にコード化されている。
トランスロカーゼ経路は、シャペロンタンパク質（SecB）、ATPase（SecA）、膜貫通複合体（SecY、SecE、およびSecG）、および成熟ペプチドのペリプラズムへの放出を促進する2つの追加の膜タンパク質（SecDおよびSecF）を含む7つのタンパク質で構成されています。[3]シャペロンタンパク質SecB [4]は、細菌細胞質内で「二量体の二量体」として存在する、非常に酸性のホモテトラマータンパク質です。SecBは、翻訳後にプレタンパク質を展開した状態で維持し、これらを末梢膜タンパク質ATPase SecAに誘導して分泌します。[5]
細胞質領域 2 と 3、および TM ドメイン 1、2、4、5、7、および 10 はよく保存されています。保存された細胞質領域は細胞質分泌因子と相互作用すると考えられており、TM ドメインはタンパク質の輸出に関与している可能性があります。[6] SecY は一部の藻類の葉緑体ゲノムにもコードされており、そこではクロモ藻類とクリプト藻類に存在する葉緑体小胞体 (CER) の 2 つの膜を介した原核生物のようなタンパク質輸出システムに関与している可能性があります。[7]
亜科
- SecY関連トランスロカーゼInterPro : IPR014269
このドメインを含むヒトタンパク質
SEC61A1 ; SEC61A2;
参照
参考文献
- ^ Van den Berg B、Clemons WM、Collinson I、Modis Y、Hartmann E、Harrison SC、Rapoport TA (2004 年 1 月)。「タンパク質伝導チャネルの X 線構造」。Nature . 427 ( 6969 ) : 36–44。Bibcode :2004Natur.427...36B。doi : 10.1038/nature02218。PMID 14661030。S2CID 4360143。
- ^ Auer J、Spicker G、Böck A (1991年6月)。「真正細菌のsecYと相同な古細菌Methanococcus vannieliiの遺伝子の存在」。Biochimie . 73 ( 6): 683–8. doi :10.1016/0300-9084(91)90048-6. PMID 1764515。
- ^ ab Bieker KL、Phillips GJ、Silhavy TJ (1990 年 6 月)。「大腸菌の sec 遺伝子と prl 遺伝子」。Journal of Bioenergetics and Biomembranes。22 (3): 291–310。doi : 10.1007 /BF00763169。PMID 2202721。S2CID 10694864 。
- ^ Driessen AJ (2001 年 5 月). 「SecB、2 つの顔を持つ分子シャペロン」(PDF) . Trends in Microbiology . 9 (5): 193–6. doi :10.1016/S0966-842X(01)01980-1. hdl : 11370/4e5ebfac-d58c-42db-b42e-01c22d469a82 . PMID 11336818.
- ^ Müller JP (1999年7月). 「大腸菌におけるプレタンパク質過剰発現のSecB合成への影響」FEMS Microbiology Letters . 176 (1): 219–27. doi :10.1111/j.1574-6968.1999.tb13665.x. PMID 10418149.
- ^ Suh JW、Boylan SA、Thomas SM、Dolan KM、Oliver DB、Price CW (1990 年 2 月)。「枯草菌からの secY ホモログの分離: 真正細菌における共通タンパク質輸出経路の証拠」。分子 微生物学。4 ( 2): 305–14。doi :10.1111/j.1365-2958.1990.tb00597.x。PMID 2110998。S2CID 27373166 。
- ^ Douglas SE (1992年2月). 「Cryptomonas phiのプラスチドゲノムにsecYホモログが見つかる」. FEBS Letters . 298 (1): 93–6. Bibcode :1992FEBSL.298...93D. doi : 10.1016/0014-5793(92)80029-G . PMID 1544427. S2CID 22351990.