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研究データのアーカイブとは、自然科学、社会科学、生命科学を含む学術研究データを長期的に保存することです。様々な学術誌は、研究者がどの程度のデータと方法を公開アーカイブに保存する必要があるかについて異なる方針を持っており、実際にアーカイブされる内容は分野によって大きく異なります。同様に、主要な助成機関もデータの公開アーカイブに対して様々な姿勢を持っています。一般的に、科学の伝統では、出版物には他の研究者が研究を再現し、検証できるように十分な情報を含めることが求められてきました。近年、一部の分野の研究は、容易に独立して再現できない大規模なデータセットに依存しているため、このアプローチはますます困難になっています。
データアーカイブの重要性は、分野によって異なる。一部の分野では、研究を再現するために必要なデータはすべて既に論文に掲載されている。一方、医薬品開発においては、膨大な量のデータが生成されるため、研究者が製薬会社が発表する報告書がデータを正確に反映していることを検証できるよう、データをアーカイブする必要がある。
データ保存とデータアーカイブは、どちらも長期的にデータを保護するという点で共通していますが、しばしば混同されがちです。しかし、その目的は異なります。データ保存は、バックアップを作成し、データを安全な場所に保存し、必要なときにいつでもアクセスできるようにすることで、データの紛失、破損、破壊を防ぐことに重点を置いています。一方、データアーカイブは、もはや積極的に使用されていないデータを長期保存のために別の場所に移動することです。アーカイブされたデータは多くの場合、結合および圧縮されており、アクセスは可能ですが、日常的な使用や頻繁な更新を目的としたものではありません。
データアーカイブの要件は、科学史において比較的新しい発展である。これは、大量のデータを中央の場所に保存してアクセスできるようにした情報技術の進歩によって可能になった。例えば、米国地球物理学連合（AGU）は、 WWWの開始から約3年後の1993年に、データアーカイブに関する最初のポリシーを採用した。[ 1 ]このポリシーは、AGUの論文で引用されたデータセットは、認定されたデータセンターによってアーカイブされなければならないことを義務付けており、「データ論文」の作成を許可し、データアーカイブの維持におけるAGUの役割を確立している。しかし、論文の著者にデータをアーカイブすることを義務付けてはいない。
組織的なデータアーカイブが確立される以前は、論文を評価または再現しようとする研究者は、著者からデータと方法に関する情報を要求する必要がありました。学術界では、著者が補足データを共有することが期待されています。しかし、このプロセスは時間とエネルギーの無駄遣いであり、結果もまちまちでした。情報は年月を経て失われたり、破損したりする可能性がありました。場合によっては、著者が情報提供を拒否することもありました。
研究が健康問題や公共政策の形成を扱う場合、データのアーカイブとデューデリジェンスの必要性が大幅に高まります。[ 2 ] [ 3 ]
Biotropicaでは、掲載条件として、論文の結果を裏付けるデータと、それを記述するメタデータがDryad、 Figshare、 GenBank、 TreeBASE、 NCBIなどの適切な公開アーカイブにアーカイブされている必要があります。著者は、論文が公開されるとすぐにデータを公開するか、アーカイブの技術が許せば、論文公開後 3 年間までデータへのアクセスを制限できます。データの利用可能性を説明する記述は、著者への指示に記載されているとおり、原稿に含まれます。機密情報 (例: 絶滅危惧種の場所) を含む研究については、編集長の裁量でデータのアーカイブ義務の例外が認められる場合があります。この方針の動機を説明する編集記事は、こちらでご覧いただけます。より包括的なデータリポジトリのリストは、こちらでご覧いただけます。 データを収集およびアーカイブする研究者との協力文化の促進:熱帯生物学者が収集するデータは、多くの場合、長期にわたり、複雑で、収集に費用がかかります。『Biotropica』編集委員会は、アーカイブされたデータセットを再利用する著者に対し、それらのデータセットを最初に収集した科学者を共同研究者として積極的に参加させることを強く推奨します。データ収集者の研究対象システムの自然史に関する深い洞察を活用することで、新たな分析における誤りのリスクを軽減し、 ATBCと『Biotropica』が広く認められている分野横断的かつ異文化間の協力と研修を促進することにより、研究の質と影響力を大幅に向上させることができると考えています。
注：Biotropicaは、Dryadにデータを登録する著者の手数料を負担するわずか2つの学術誌のうちの1つです。
American Naturalist では、著者に受理された論文に関連するデータを公開アーカイブに登録することを求めています。遺伝子配列データと系統樹については、それぞれGenBankまたはTreeBASEへの登録が必要です。生態学および進化生物学データ用のDryadリポジトリなど、特定のデータセットに適したアーカイブは多数あります。GenBank、TreeBASE、および Dryad のすべてのアクセッション番号は、原稿が制作段階に入る前に受理された原稿に含める必要があります。データが他の場所に保存されている場合は、リンクを提供してください。データが公開文献から収集されたものである場合、読者の便宜のために、収集したデータを Dryad に登録してください。データ共有の障害がある場合は、適切な取り決めができるように、投稿時に編集者に知らせてください。 [ 4 ]
論文の結論の根拠となる一次データは、科学的研究の検証可能性と透明性にとって極めて重要であり、今後数十年にわたって利用可能な形で保存されるべきです。そのため、『Journal of Heredity』誌では、新たに報告されたヌクレオチド配列、アミノ酸配列、および構造座標を、適切な公開データベース（例：GenBank、EMBLヌクレオチド配列データベース、日本DNAデータベース、タンパク質データバンク、Swiss-Prot）に提出することを義務付けています。最終原稿には、アクセッション番号を記載する必要があります。その他のデータ形式（例：マイクロサテライト遺伝子型、連鎖地図、画像）については、本誌は共同データアーカイブポリシー（JDAP）の原則を支持し、すべての著者に、一次データセットをDryad、TreeBASE、または生物複雑性知識ネットワークなどの適切な公開アーカイブに保存することを推奨しています。著者には、出版時にデータを公開するか、アーカイブの技術が許せば、出版後最長1年間データへのアクセスを制限することを推奨します。米国遺伝学会は、個々の研究者が大規模なデータセットの作成と管理に多大な労力を費やしていることを認識しています。したがって、二次分析やメタ分析においては、こうした労力を尊重し、協力的な精神で取り組むことを推奨します。
— oxfordjournals.org [ 5 ]
Molecular Ecology誌は、論文の結果を裏付けるデータは、GenBank、Gene Expression Omnibus、TreeBASE、Dryad、Knowledge Network for Biocomplexity、所属機関または資金提供機関のリポジトリ、あるいはMolecular Ecologyウェブサイトの補足情報など、適切な公開アーカイブに保存されることを期待しています。データは科学研究の重要な成果物であり、今後数十年にわたって保存され、利用可能であるべきです。著者は、出版時にデータを公開することも、アーカイブの技術が許せば、出版後最長1年間、データへのアクセスを制限することもできます。特にヒト被験者データや絶滅危惧種の生息地などの機密情報については、編集者の裁量で例外が認められる場合があります。
—ワイリー[ 6 ]
このような資料は、認定された独立したサイト（URLとアクセス番号は著者が提供）でホストするか、Nature誌に投稿時に、ジャーナルのオンライン投稿サービス経由でアップロードするか、ファイルが大きすぎるかこの目的に適さない形式の場合はCD/DVD（5枚）で送付する必要があります。このような資料は、著者の個人または機関のウェブサイトのみでホストすることはできません。[ 7 ] Nature誌は、査読者にすべての補足データと方法がアーカイブされているかどうかを確認することを求めています。この方針では、査読者に次のようないくつかの質問を検討するようアドバイスしています。「著者に論文に付随する補足方法またはデータをオンラインで提供するよう求めるべきか？（このようなデータには、モデリング研究のソースコード、詳細な実験プロトコル、または数学的導出が含まれる可能性があります。）」
Science は、科学コミュニティが利用できる公開データを集約するデータベースの取り組みを支援しています。そのため、出版前に、大規模なデータセット (マイクロアレイデータ、タンパク質または DNA 配列、高分子構造の原子座標または電子顕微鏡マップなど) は、承認されたデータベースに登録され、公開論文に含めるための登録番号が付与されなければなりません。[ 9 ] 「材料と方法」 – Science は現在、一般的に、著者は材料と方法の説明の大部分を補足資料としてオンラインに掲載し、印刷された原稿には本文の論理に従うために必要な分だけ方法の説明を記載するよう求めています。(もちろん、論文が根本的に新しい方法または技術の研究である場合は、この制限は適用されません。)
王立協会誌に掲載された研究成果を他者が検証し、発展させることができるようにするため、著者は論文の結果を裏付けるデータ、コード、および研究資料を公開することが出版条件となっている。
データセットとコードは、適切な、認知された、公開リポジトリに登録する必要があります。データ専用のリポジトリが存在しない場合は、Dryad（リポジトリ）やFigshareなどの汎用リポジトリにデータセットを登録してください。
『考古学科学ジャーナル』は、少なくとも2013年からデータ公開ポリシーを設けています。そのポリシーでは、「記事に関連するすべてのデータは、補足ファイルで公開するか、外部リポジトリに保存し、記事内でリンクする必要があります」と規定しています。ポリシーでは、データは考古学データサービス、デジタル考古学記録、PANGAEAなどのリポジトリに保存することを推奨しています。2018年の調査では、データ公開率は53%であることが判明しており、これはこのポリシーの執行が不十分であるか、編集者、査読者、著者の間でこのポリシーの解釈と実施方法についての理解が不十分であることを反映しています。[ 12 ]
米国では、国立科学財団（NSF）がデータアーカイブに関する要件を厳格化しました。NSFから資金提供を求める研究者は、助成金申請書の補足資料として2ページのデータ管理計画を提出することが義務付けられています。 [ 13 ]
米国科学財団（NSF）のDatanetイニシアチブにより、地球データ観測ネットワーク（DataONE）プロジェクトへの資金提供が実現しました。DataONEは、世界中の科学者によって作成された生態学的および環境的データの科学データアーカイブを提供します。DataONEの目標は、多スケール、多分野、多国籍のデータを保存し、アクセスを提供することです。DataONEのユーザーコミュニティには、科学者、生態系管理者、政策立案者、学生、教育者、そして一般市民が含まれます。
ドイツ研究振興協会（DFG）は、研究データは研究者自身の所属機関または適切な全国規模のインフラストラクチャに少なくとも10年間保管することを義務付けている。[ 14 ]
英国デジタルキュレーションセンターは、資金提供者のデータポリシーの概要を維持している。[ 15 ]
研究データはデータライブラリまたはデータアーカイブに保管されます。データライブラリ、データアーカイブ、またはデータリポジトリは、研究における二次利用を目的とした数値データセットおよび/または地理空間データセットのコレクションです。データライブラリは通常、研究データのアーカイブおよび当該組織のデータ利用者へのサービス提供のために設立された、より大きな組織（学術機関、企業、科学機関、医療機関、政府機関など）の一部です。データライブラリは、ローカルデータコレクションを保管し、さまざまな手段（CD- / DVD -ROMまたはダウンロード用の中央サーバー）を通じてそれらへのアクセスを提供します。データライブラリは、利用者が情報にアクセスできるように、ライセンスされたデータリソースの購読を維持することもあります。データライブラリがデータアーカイブとみなされるかどうかは、コレクション内の独自の保有量、長期保存サービスの提供の有無、および（国立データアーカイブのように）より広範なコミュニティにサービスを提供しているかどうかによって異なります。ほとんどの公共データライブラリは、研究データリポジトリ登録簿に記載されています。
2001年8月、研究図書館協会（ARL）は、数値データリソースの収集とサービス提供に関わるARL加盟機関の調査結果を示す報告書[ 16 ]を発表しました。
図書館サービスは、研究における数値データセットやその他の種類のデータセットの利用に関して、機関レベルでのサポートを提供します 。通常提供されるサポート活動には、以下のようなものがあります。
以下のリストは、科学データアーカイブに関するものです。
社会科学では、データライブラリはデータアーカイブと呼ばれています。[ 17 ]データアーカイブは、社会データや行動データの取得、準備、保存、普及を行う専門機関です。社会科学におけるデータアーカイブは1950年代に発展し、国際的な動きとして認識されてきました。
1964年までに、国際社会科学会議（ISSC）は社会科学データアーカイブに関する第2回会議を主催し、社会科学データに関する常設委員会を設置した。これら2つはデータアーカイブ運動を刺激した。21世紀初頭までに、ほとんどの先進国と一部の発展途上国は、正式かつ十分に機能する国家データアーカイブを組織した。さらに、大学や高等教育機関のキャンパスには、教職員や学生がデータにアクセスできる「データライブラリ」が設置されていることが多い。これらのほとんどがアーカイブの責任は最小限で、その機能は国家機関に依存している（Rockwell、2001、p. 3227）。[ 18 ]