遺伝子発現オムニバス

遺伝子発現オムニバス
コンテンツ
説明	遺伝子発現プロファイリングとRNAメチル化データベース
接触
研究センター	国立バイオテクノロジー情報センター
主な引用	エドガー・Rら（2002）
アクセス
Webサイト	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/?term=

Gene Expression Omnibus ( GEO ) は、国立生物工学情報センター(NCBI)が管理する遺伝子発現プロファイリングとRNA メチル化プロファイリングのデータベースです。 ^[1]これらのハイスループットスクリーニングゲノムデータは、マイクロアレイまたはRNA-Seq実験データから得られます。^{[2]これらのデータは}、マイクロアレイ実験に関する最小限の情報(MIAME) 形式に準拠している必要があります。^[3]

用語集

^ ab Edgar, R; Domrachev, M; Lash, AE (2002年1月1日). 「遺伝子発現オムニバス: NCBI遺伝子発現およびハイブリダイゼーションアレイデータリポジトリ」. Nucleic Acids Research . 30 (1): 207–10. doi : 10.1093/nar/30.1.207 . PMC 99122. PMID 11752295 .
^ Barrett, T; Wilhite, SE; Ledoux, P; Evangelista, C; Kim, IF; Tomashevsky, M; Marshall, KA; Phillippy, KH; Sherman, PM; Holko, M; Yefanov, A; Lee, H; Zhang, N; Robertson, CL; Serova, N; Davis, S; Soboleva, A (2013 年 1 月)。「NCBI GEO: 機能ゲノムデータセットのアーカイブ - 更新」。核酸研究。41 (データベース号): D991-5。doi : 10.1093 / nar / gks1193。PMC 3531084。PMID 23193258。
^ Brazma, A; Hingamp, P; Quackenbush, J; Sherlock, G; Spellman, P; Stoeckert, C; Aach, J; Ansorge, W; Ball, CA; Causton, HC; Gaasterland, T; Glenisson, P; Holstege, FC; Kim, IF; Markowitz, V; Matese, JC; Parkinson, H; Robinson, A; Sarkans, U; Schulze-Kremer, S; Stewart, J; Taylor, R; Vilo, J; Vingron, M (2001 年 12 月)。「マイクロアレイ実験に関する最小限の情報 (MIAME) - マイクロアレイデータの標準に向けて」。Nature Genetics . 29 (4): 365–71. doi : 10.1038/ng1201-365。PMID 11726920。S2CID 6994467 。