小型カハール体特異的RNA

小型カハール体特異的RNA（scaRNA ）は、小型核小体RNA（snoRNA）の一種で、小型核リボ核タンパク質（snRNPまたはsnurp）の生合成に関与する核内小器官（細胞内小器官）であるカハール体に特異的に局在します。scaRNAは、RNAポリメラーゼII によって転写されるスプライソソームRNAであるU1、U2、U4、U5、U12の修飾（メチル化およびシュードウリジル化）を誘導します。

最初に同定されたscaRNAはU85である。^{[ 1 ]}これは、典型的なsnoRNAとは異なり、複合C/DボックスおよびH/ACAボックスsnoRNAであり、シュードウリジル化と2'- O-メチル化の両方を誘導することができる。すべてのscaRNAが複合C/DおよびH/ACAボックスsnoRNAであるわけではなく、ほとんどのscaRNAは、核小体でリボソームRNA（rRNA）の修飾を指示するsnoRNAと構造的にも機能的にも区別がつかない。

ショウジョウバエのscaRNA

いくつかの研究でショウジョウバエのscaRNAが同定された。^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} そのうちの1つの研究では、いくつかのショウジョウバエscaRNAがカハール体を欠損した変異体ショウジョウバエの核質で同様に機能することが示された。^{[ 4 ]}さらに調査した結果、scaRNA pugU6-40はU6 snRNAを標的とし、その修飾はCBではなく核小体で起こり、pugU1-6とpugU2-55は2つのRNA（snRNAと28s rRNA）を誘導することが示された。^{[ 5 ]}

小カハール体特異的RNA 1

分子生物学において、小型カハール体特異的RNA 1（SCARNA1またはACA35としても知られる）は、カハール体に存在する小型核小体RNAであり、U2スプライソソームRNAのU89残基におけるシュードウリジル化に関与していると考えられている。

scaRNA1は非コードRNAであり、タンパク質に翻訳されない遺伝子の機能的産物である。このようなRNA分子は通常、重要な二次構造やリガンド結合モチーフを含み、細胞内の多くの重要な生物学的プロセスに関与している。^[⁶^]

scaRNA1は、予測されるヘアピン-ヒンジ-ヘアピン-テール構造、保存されたH/ACAボックスモチーフを持ち、GAR1タンパク質と関連していることから、snoRNAのH/ACAボックスクラスに属する。 ^[⁷^]

参考文献

1 2 Jády BE、Kiss T (2001 年 2 月)。「小さな核小体ガイド RNA は、U5 スプライソソーム RNA の 2′- O -リボースメチル化とシュードウリジル化の両方に機能する」。The EMBO Journal。20 ( 3 ) : 541– 551。doi : 10.1093 / emboj / 20.3.541。PMC 133463。PMID 11157760。
↑トルトリエッロ G、アッカルド MC、シャロ F、アングリサニ A、トゥラーノ M、フリア M (2009 年 5 月)。「予測されたガイド機能を備えた新規ショウジョウバエアンチセンスscaRNA」。遺伝子。436 ( 1–2 ): 56–65 .土井: 10.1016/j.gene.2009.02.005。PMID 19230845。
↑ Tycowski KT、Shu MD、Kukoyi A、Steitz JA (2009年4月)。「保存されたWD40タンパク質はscaRNP粒子のカハール体局在シグナルに結合する」。Molecular Cell。34 ( 1): 47– 57。doi : 10.1016/ j.molcel.2009.02.020。PMC 2700737。PMID 19285445。
1 2 Deryusheva S、Gall JG (2009年12 月)。「ショウジョウバエの小型カハール体特異的 RNAはカハール体が存在しない場合でも機能する」。Molecular Biology of the Cell。20 ( 24 ): 5250–5259。doi : 10.1091/ mbc.E09-09-0777。PMC 2793299。PMID 19846657。
1 2 Deryusheva S、Gall JG (2013 年 12月)。「ショウジョウバエで同定された新規小型カハール体特異的 RNA: ガイド RNA 機能の調査」。RNA。19 ( 12 ) : 1802–1814。doi : 10.1261 / rna.042028.113。PMC 3884663。PMID 24149844。
↑ Darzacq X、Jády BE、Verheggen C、Kiss AM、Bertrand E、Kiss T (2002 年 6 月)。「カハール体特異的小型核 RNA: 2′-O-メチル化およびシュードウリジル化ガイド RNA の新規クラス」。The EMBO Journal。21 ( 11 ): 2746–2756。doi : 10.1093/emboj / 21.11.2746。PMC 126017。PMID 12032087。
↑ Kiss AM、Jády BE、Bertrand E、Kiss T (2004年7月)。「ヒトボックスH/ACAシュードウリジル化ガイドRNA機構」。分子細胞生物学。24 ( 13): 5797–5807。doi : 10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004。PMC 480876。PMID 15199136。

外部リンク

snoRNAbase：ヒトH/ACAおよびC/DボックスsnoRNAデータベース
Rfamの小型カハール体特異的RNAのページ

[pmid11157760-1] 1 2 Jády BE、Kiss T (2001 年 2 月)。「小さな核小体ガイド RNA は、U5 スプライソソーム RNA の 2′- O -リボースメチル化とシュードウリジル化の両方に機能する」。The EMBO Journal。20 ( 3 ) : 541– 551。doi : 10.1093 / emboj / 20.3.541。PMC 133463。PMID 11157760。

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[3] Tycowski KT、Shu MD、Kukoyi A、Steitz JA (2009年4月)。「保存されたWD40タンパク質はscaRNP粒子のカハール体局在シグナルに結合する」。Molecular Cell。34 ( 1): 47– 57。doi : 10.1016/ j.molcel.2009.02.020。PMC 2700737。PMID 19285445。

[:0-4] 1 2 Deryusheva S、Gall JG (2009年12 月)。「ショウジョウバエの小型カハール体特異的 RNAはカハール体が存在しない場合でも機能する」。Molecular Biology of the Cell。20 ( 24 ): 5250–5259。doi : 10.1091/ mbc.E09-09-0777。PMC 2793299。PMID 19846657。

[:1-5] 1 2 Deryusheva S、Gall JG (2013 年 12月)。「ショウジョウバエで同定された新規小型カハール体特異的 RNA: ガイド RNA 機能の調査」。RNA。19 ( 12 ) : 1802–1814。doi : 10.1261 / rna.042028.113。PMC 3884663。PMID 24149844。

[darzacq_2002-6] Darzacq X、Jády BE、Verheggen C、Kiss AM、Bertrand E、Kiss T (2002 年 6 月)。「カハール体特異的小型核 RNA: 2′-O-メチル化およびシュードウリジル化ガイド RNA の新規クラス」。The EMBO Journal。21 ( 11 ): 2746–2756。doi : 10.1093/emboj / 21.11.2746。PMC 126017。PMID 12032087。

[pmid15199136-7] Kiss AM、Jády BE、Bertrand E、Kiss T (2004年7月)。「ヒトボックスH/ACAシュードウリジル化ガイドRNA機構」。分子細胞生物学。24 ( 13): 5797–5807。doi : 10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004。PMC 480876。PMID 15199136。

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ショウジョウバエのscaRNA

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