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 BAB30904 の SURP ドメインのソリューション構造。 | |||||||||
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| シンボル | 驚き | ||||||||
| パム | PF01805 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
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分子生物学において、タンパク質ドメイン SWAP は、モデル生物である Drosophila melanogasterのスプライシング制御因子である Suppressor-of-White-APricot という用語に由来しています。このタンパク質ドメインは、スプライシングを制御する制御因子に見られます。これは、スプライシング 制御 タンパク質に見られます。[1] 遺伝子が発現すると、 DNAはメッセンジャーRNA (mRNA)に転写されなければなりません。しかし、時にはイントロンと呼ばれる介在配列または中断配列が含まれます。mRNA スプライシングは、これらの配列を除去し、より好ましい配列を残すのに役立ちます。mRNA スプライシングは、遺伝子発現の転写後修飾プロセスにおいて不可欠なイベントです。[2] SWAP は、配偶子を除くすべての細胞でこのプロセスを制御するのに役立ちます。
関数
タンパク質ドメインSWAPの役割は、性細胞を除くすべての細胞における性別に依存しないプレmRNAの処理 を制御することです。これには自己調節が含まれており、それ自身のプレmRNAのスプライシングを制御します。[3] SWAPの哺乳類ホモログは甲状腺ホルモン調節遺伝子として機能します。つまり、甲状腺によって制御されます。[4] [5]
構造
SWAPタンパク質は、共線的に配列した一連の新規配列モチーフを共有している。[3]これは、それらが時間の経過とともに保存されてきたことを意味する。異なる生物のSWAPタンパク質は、配列の点でいくつかの類似性を共有しており、進化の歴史のある時点で関連していた可能性がある。
参考文献
- ^ Denhez F, Lafyatis R (1994年6月). 「ショウジョウバエのスプライシング調節因子であるサプレッサー・オブ・ホワイト・アプリコットの脊椎動物相同遺伝子における調節選択スプライシングの保存と機能ドメインの同定」. The Journal of Biological Chemistry . 269 (23): 16170–9. doi : 10.1016/S0021-9258(17)33989-3 . PMID 8206918.
- ^ Clancy, Suzanne (2008). 「RNAスプライシング：イントロン、エクソン、スプライソソーム」Nature Education . 1 (1) . 2011年3月31日閲覧。
- ^ ab Spikes DA、Kramer J、Bingham PM、Van Doren K (1994 年 10 月)。「SWAP pre-mRNA スプライシング制御因子は、構成的スプライシングタンパク質の prp21 ファミリーと高度に保存された配列モチーフを共有する、新しい古代のタンパク質ファミリーです」。Nucleic Acids Research。22 ( 21 ) : 4510–9。doi :10.1093/ nar /22.21.4510。PMC 308487。PMID 7971282 。
- ^ Cuadrado A、Bernal J、Muñoz A (1999 年 8 月)。「スプライシング制御因子 Suppressor-of-white-apricot の哺乳類ホモログが甲状腺ホルモン調節遺伝子として同定」。脳研究。分子脳研究。71 (2): 332–40。doi :10.1016/s0169-328x(99)00212-0。PMID 10521587 。
- ^ Khan A、Sulkowski ZL、Chen T、Zavacki AM、Sajdel-Sulkowska EM（2012年6月）。「ラットの周産期チメロサール曝露後の小脳甲状腺ホルモン依存性遺伝子発現の性別依存的変化」生理学および薬理学ジャーナル63（3）：277–83。PMID 22791642 。