セカンドジェネレーションマルチプレックスプラス(SGM Plus)は、アプライドバイオシステムズ社が開発したDNAプロファイリングシステムです。セカンドジェネレーションマルチプレックスの改良版であり、 1998年から英国国立DNAデータベースで使用されています。
SGM Plusのプロファイルは、10個の遺伝子マーカーそれぞれに対応する1組の数字と、アメロゲニン性別判定検査の結果を示す2文字(XXまたはXY)からなる、計10組の数字のリストで構成されています。各数字のペアは、マーカーの2つの対立遺伝子の値を示しており、それぞれの値は被験者の両親から受け継がれます。両方の対立遺伝子が同じ場合は、ペアではなく1つの数字のみが記録されます。
SGM Plusで使用される遺伝子マーカー(または遺伝子座)はすべてショートタンデムリピート(STR)です。使用されるマーカーは、VWA、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D3S1358、D16S539、D2S1338、D19S433です。マーカーの名称がDで始まる場合、Dの直後の数字はマーカーを含む染色体を示します。たとえば、D21S11は21番染色体上にあります。SGM Plusでは、アメロゲニン(アメロ)による性別判定検査も使用します。
SGM Plusは、SGMがマーカーD3S1358、D16S539、D2S1338、およびD19S433を使用しない点でSGMとは異なります。
SGM Plusは、 CODIS FGA、TH01、VWA、D3S1358、D8S1179、D16S539、D18S51、およびD21S11と8つのマーカーを共有しています。CODISと異なる点は、追加のマーカーD2S1338とD19S433を使用していることと、5つのマーカーCSF1PO、TPOX、D5S818、D7S820、D13S317を使用していないことです。[ 1 ]
プライマーには、電気泳動による検出のために、以下の蛍光色素が標識されている。
各遺伝子座のプライマーは、低分子量から高分子量へと、色素上に以下の順序で配置されている。
各プライマーに結合している色素は、元のSGM DNAプロファイリングシステムの色素とは異なる。
米国国立標準技術研究所の論文からの被験者GT36865のSGM Plusプロファイルは以下のとおりです。[ 2 ]
DNAデータベースから取得したSGM Plusプロファイルには、対立遺伝子の値のみが表示されます。[ 4 ]
15,18; 6,9; 11,13; 22,22; 31,32.2; 14,17; 17,20; 11,12; 13,16.3; 15,16; XY
各値は、対立遺伝子内のタンデムリピートの数を表します。非標準的なリピートは、完全なリピート単位の数と部分リピートの塩基対数を小数点を挟んで示します。
同一性確率(ランダム一致確率とも呼ばれる)とは、無作為に選ばれた2人の個人が同一の遺伝子プロファイルを持つ確率のことである。
Applied Biosystemsは、SGM Plusの同一性確率はアフリカ系アメリカ人では約13兆分の1、白人アメリカ人では約3.3兆分の1と推定している。[ 5 ]
ヒト遺伝学委員会は、ランダム一致の確率は1兆分の1程度であると報告している。しかし、「SGM Plusプロファイリングシステムが初めて導入されたとき、一致確率が10億分の1未満の識別結果は法廷で引用しないことで科学界内で合意があった。これは、一致確率はあくまで推定値であることを考慮し、DNA証拠の価値を過大評価することを避けるため、また、使用される数値が専門家以外にとっても意味のあるものであることを確認するためである」と述べている。 [ 6 ]
英国検察庁は、「SGM Plus DNAプロファイリングは個人を非常に識別しやすい。無関係な2人のプロファイルが偶然一致する確率は非常に低く、10億分の1程度である。しかし、この一致確率を引用するために必要な統計的テストを実施することはまだできておらず、実際には10億分の1というより保守的な偶然の一致の数値が使用されている。」と述べている。[ 7 ]