Loading article…
| リボキナーゼ | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 リボキナーゼ二量体、ヒト | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 2.7.1.15 | ||||||||
| CAS番号 | 9026-84-0 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | BRENDAエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZyme ビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイク | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | アミゴー / クイックゴー | ||||||||
| |||||||||
酵素学では、リボキナーゼ（EC 2.7.1.15）は化学反応を触媒する酵素である。
- ATP + d-リボース ⇌ ADP + d-リボース 5-リン酸
したがって、この酵素の2 つの基質はATPとd-リボースであり、 2 つの生成物はADPとd-リボース 5-リン酸です。
この酵素クラスの体系名は、ATP: d-リボース 5-ホスホトランスフェラーゼです。 よく使われる他の名前には、デオキシリボキナーゼ、リボキナーゼ (リン酸化)、d-リボキナーゼなどがあります。 この酵素は、ペントースリン酸経路に関与します。
リボキナーゼ（RK）は、糖キナーゼのホスホフルクトキナーゼB（PfkB）ファミリーに属します。[1]このファミリー（RKファミリーとしても知られる）の他のメンバーには、アデノシンキナーゼ（AK）、イノシン-グアノシンキナーゼ、フルクトキナーゼ、および1-ホスホフルクトキナーゼが含まれます。[1] [2] [3] PfkB/RKファミリーのメンバーは、3つの保存された配列モチーフの存在によって識別され、このタンパク質ファミリーの酵素活性は、一般に五価イオンの存在に依存します。[1] [2] [4] PfkBファミリーのタンパク質の特徴的な特性である保存されたNXXEモチーフは、五価イオン依存性に関与しています。RKおよび他のいくつかのPfKファミリーのタンパク質の構造は、多くの生物から決定されています。[5] AdKと他のPfkBファミリータンパク質間の配列類似性は低いものの、これらのタンパク質は構造レベルでは非常に類似しています。[1]
構造研究
2007 年末現在、このクラスの酵素については 7 つの構造が解明されており、PDBアクセッション コードは1GQT 、1RK2 、1RKA 、1RKD 、1RKS 、1VM7 、および2FV7 です。
参考文献
- ^ abcd Park J, Gupta RS (2008 年 9 月). 「アデノシンキナーゼ とリボキナーゼ - RK タンパク質ファミリー」.細胞および分子生命科学. 65 (18): 2875– 96. doi :10.1007/s00018-008-8123-1. PMC 11131688. PMID 18560757. S2CID 11439854.
- ^ ab Bork P、Sander C、Valencia A (1993 年 1 月)。「異なるタンパク質フォールドにおける類似酵素機能の収束的進化: 糖キナーゼのヘキソキナーゼ、リボキナーゼ、およびガラクトキナーゼファミリー」。タンパク質 科学。2 ( 1 ): 31– 40。doi : 10.1002 / pro.5560020104。PMC 2142297。PMID 8382990。
- ^ Spychala J、Datta NS、Takabayashi K、Datta M、Fox IH、Gribbin T、Mitchell BS (1996 年 2 月)。「ヒトアデノシンキナーゼ cDNA のクローニング: 微生物リボキナーゼおよびフルクトキナーゼとの配列類似性」。米国科学 アカデミー紀要。93 (3): 1232– 7。Bibcode : 1996PNAS ...93.1232S。doi : 10.1073/ pnas.93.3.1232。PMC 40062。PMID 8577746。
- ^ Maj MC、Singh B、Gupta RS（2002年3月）。「五価イオン依存性は、多様なソースからのアデノシンキナーゼの保存された特性です：リン酸およびマグネシウムイオン結合と基質阻害に関与する新しいモチーフの特定」。生化学。41（12）：4059-69。doi：10.1021/bi0119161。PMID 11900549 。
- ^ Sigrell JA、Cameron AD、Jones TA、Mowbray SL（1998年2月）。「リボースおよびジヌクレオチドとの複合体における大腸菌リボキナーゼの構造を1.8Å分解能で決定：キナーゼ構造の新しいファミリーへの洞察」。構造。6（2）：183–93。doi ： 10.1016 / s0969-2126（98 ）00020-3。PMID 9519409。
さらに読む
- Agranoff BW、Brady RO (1956年3 月)。「子牛肝臓リボキナーゼの精製と特性」(PDF)。The Journal of Biological Chemistry。219 ( 1): 221– 9。doi : 10.1016/ S0021-9258 ( 18)65786-2。PMID 13295274。
- Ginsburg A (1959年3月). 「Lactobacillus plantarum由来のデオキシリボキナーゼ」(PDF) . The Journal of Biological Chemistry . 234 (3): 481–7 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)70230-5 . PMID 13641245.
