PANドメイン

PANドメインは、タンパク質間相互作用やタンパク質-炭水化物相互作用を媒介することで、多様な生物学的役割を果たす重要な機能的多様性を持っています。^{[ 1 ]}これらのドメインは、ノッティンに見られるものと同様のヘアピンループのような構造を持っていますが、ジスルフィド結合のパターンが異なります。

プラスミノーゲン/肝細胞増殖因子ファミリーのメンバーのN末端ドメイン、血漿プレカリクレイン/凝固因子XIファミリーのアップルドメイン、およびさまざまな線虫タンパク質のドメインは、同じモジュールスーパーファミリーであるPANモジュールに属することが示されている。^{[ 1 ]} PANドメインは、3つのジスルフィド結合の保存されたコアを含んでいる。ファミリーの一部のメンバーには、ドメインのN末端とC末端を連結する4番目のジスルフィド結合が追加で存在する。

アップルドメインは、PANドメインの他の例と同様に、7本のβストランドが折り畳まれて湾曲した逆平行シートを形成し、その中にαヘリックスが収まっている。2つのジスルフィド結合がヘリックスを中央のβ4およびβ5ストランドに固定し、3つ目のジスルフィド結合がドメインのN末端とC末端を連結している。アップルドメインでは、β4–β5ループとβ5–β6クロスオーバーループが、シートのαヘリックスとは反対側に小さなポケットを形成している。^{[ 2 ]}

天然プラスミノーゲンでは、PANドメインは5つのクリングルドメインと関連している。^{[ 3 ]} PANドメインとクリングル間の相互作用は、天然プラスミノーゲンの四次複合体を安定化させる上で重要な役割を果たしている。