クリングルドメイン

クリングルドメインは、3つのジスルフィド結合によって安定化された大きなループ構造に折り畳まれる自律的なタンパク質ドメインです。これらは、血液凝固因子とのタンパク質間相互作用において重要な役割を果たします。その名称は、クリングルという北欧の菓子に由来しており、クリングルはクリングルにやや似ています。

クリングルドメインは、プラスミノーゲン、肝細胞増殖因子、プロトロンビン、アポリポタンパク質(a)に見つかっている。

クリングルは、血液凝固タンパク質および線溶タンパク質全体に見られます。クリングルドメインは、メディエーター（膜、他のタンパク質、リン脂質など）の結合や、タンパク質分解活性の調節に役割を果たしていると考えられています。^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}クリングルドメイン^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}は、3つのループと3つのジスルフィド結合構造を特徴としており、その立体構造は多数の水素結合と小さな逆平行βシートによって定義されます。これらは、MEROPSペプチダーゼファミリーS1Aに属するセリンプロテアーゼであるプロトロンビンやウロキナーゼ型プラスミノーゲンアクチベーターなどの一部の血漿タンパク質に、さまざまな数のコピーで存在します。

このドメインを含むヒトタンパク質

ATF ; F12 ; F2 ; HABP2 ; HGF ; HGFAC ;クレメン1 ;クレメン2 ; LPA ; LPAL2 ; MST1 ; PIK3IP1 ;プラット;プラウ; PLG ; PRSS12 ; ROR1 ; ROR2 ;

参考文献

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↑ Patthy L、Trexler M、Banyai L、Varadi A、Vali Z (1984)。「クリングル：タンパク質結合に特化したモジュール。フィブロネクチンのゼラチン結合領域とプロテアーゼのクリングル構造の相同性」。FEBS Lett。171 ( 1 ): 131– 136。doi : 10.1016 /0014-5793(84 ) 80473-1。PMID 6373375。S2CID 12669742。
↑ Atkinson RA、Williams RJ (1990)「1H核磁気共鳴分光法と距離幾何学によるヒトプラスミノーゲン由来クリングル4ドメインの溶液構造」J. Mol. Biol . 212 (3): 541– 552. doi : 10.1016/0022-2836(90)90330-O . PMID 2157850 .
↑ Castellino FJ、Beals JM (1987)。「ヒトプラスミノーゲン、プロトロンビン、組織プラスミノーゲン活性化因子、ウロキナーゼ、および凝固因子XIIのクリングルドメイン間の遺伝的関係」。J . Mol . Evol . 26 ( 4 ) : 358–369。Bibcode : 1987JMolE..26..358C。doi : 10.1007/ BF02101155。PMID 3131537。S2CID 22249781。
↑ Patthy L (1985). "血液凝固および線溶のプロテアーゼのモジュールからの集合による進化". Cell . 41 (3): 657– 663. doi : 10.1016/S0092-8674(85)80046-5 . PMID 3891096 . S2CID 32104232 .
↑ Takahashi K, Ikeo K, Gojobori T (1991). "Evolutionary origin of numerous kringles in human and simian apolipoprotein(a)" . FEBS Lett . 287 (1): 146– 148. doi : 10.1016/0014-5793(91)80036-3 . PMID 1879523 . S2CID 13366195 .

外部リンク

Kringleドメインは、2020年5月28日にWayback Machineにアーカイブされました（PROSITE）。
SMARTデータベースにおけるKRドメインのエントリ
プロトロンビン構造の下にあるクリングルドメインの漫画

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[PUB00001620-6] Takahashi K, Ikeo K, Gojobori T (1991). "Evolutionary origin of numerous kringles in human and simian apolipoprotein(a)" . FEBS Lett . 287 (1): 146– 148. doi : 10.1016/0014-5793(91)80036-3 . PMID 1879523 . S2CID 13366195 .

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関連するトピック

ループ構造

タンパク質ドメイン

凝固因子との

タンパク質間相互作用において重要な役割を果たします。その名称は、