ルグドゥニン

ルグドゥニン
名前
	IUPAC名 (1 R ,4 R ,7 S ,10 R ,13 S ,16 R ,19 S )-7-(1 H -インドール-3-イルメチル)-10-イソブチル-4,13,16,19-テトライソプロピル-21-チア-3,6,9,12,15,18,23-ヘプタアザビシクロ[18.2.1]トリコサン-2,5,8,11,14,17-ヘキソン
識別子
CAS番号	1989698-37-4;
3Dモデル（JSmol）	インタラクティブ画像;
チェビ	チェビ:133127 ;
ケムスパイダー	57427231;
パブケム CID	121596231;
CompTox ダッシュボード ( EPA )	DTXSID801336028;
	InChI InChI=1S/C40H62N8O6S/c1-19(2)15-27-35(50)45-31(21(5)6)38(53)47-32(22(7)8)39(54)48- 3 3(23(9)10)40-44-29(18-55-40)36(51)46-30(20(3)4)37(52)43-28(34(49)42-27) 16-24-17-41- 26-14-12-11-13-25(24)26/h11-14,17,19-23,27-33,40-41,44H,15-16,18H2,1-10H3,(H,42 ,49)(H,43,52)(H,45,50)(H,46,51)(H,47,53)(H,48,54)/t27-,28+,29+,30- 、31+、32-、33+、40?/m1/s1 キー: QZNGYMKAHFFKCJ-ZBQZSICZSA-N; InChI=1/C40H62N8O6S/c1-19(2)15-27-35(50)45-31(21(5)6)38(53)47-32(22(7)8)39(54)48- 33 (23(9)10)40-44-29(18-55-40)36(51)46-30(20(3)4)37(52)43-28(34(49)42-27)16 -24-17-41-2 6-14-12-11-13-25(24)26/h11-14,17,19-23,27-33,40-41,44H,15-16,18H2,1-10H3,(H,42 ,49)(H,43,52)(H,45,50)(H,46,51)(H,47,53)(H,48,54)/t27-,28+,29+,30- 、31+、32-、33+、40?/m1/s1 キー: QZNGYMKAHFFKCJ-ZBQZSICZBY;
	笑顔 CC(C)C[C@@H]1C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C(=O)N[C@H](C2N[C@@H](CS2)C(=O)N[C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N1)Cc3c[nH]c4c3cccc4)C(C)C)C(C)C)C(C)C)C(C)C;
プロパティ
化学式	Ｃ４０Ｈ６２Ｎ８Ｏ６Ｓ
モル質量	783.05 グラムモル−1
	特に記載がない限り、データは標準状態（25 °C [77 °F]、100 kPa）の材料に関するものです。インフォボックス参照

ルグドゥニンは、チアゾリジン含有環状ペプチドに分類される治験中の抗生物質です。2016年に、ヒトの鼻腔から、ヒトマイクロバイオームのその部分で病原菌の増殖を抑制する細菌種としてブドウ球菌ルグドゥネンシスが特定された後に単離されました。^[1]^[2]^[3]

ルグドゥニンは、リボソーム以外で合成される環状ペプチドで、黄色ブドウ球菌の増殖を阻害する。ルグドゥニン遺伝子は30kbpのオペロン上に位置する。lugA 、lugB、lugC、lugD遺伝子は4つの非リボソームペプチド合成酵素をコードしており、その前に推定調節遺伝子lugRが存在する。^[4]

生合成

ルグドゥニンは、S. lugdunensisの非リボソームペプチド合成酵素によって合成される。分子は、チアゾリジン複素環と 3 つの D アミノ酸からなる環状ペプチドである。ルグドゥニン合成を司るオペロンは約 30 kb で、4 つの非リボソームペプチド合成酵素遺伝子を含む。オペロンには、ホスホパンテテイニルトランスフェラーゼ、モノオキシゲナーゼ、未知の調整酵素、調節遺伝子、およびタイプ II チオエステラーゼが含まれる。^[5]ホスホパンテテイニルトランスフェラーゼは、キャリアタンパク質として機能する T ドメインの活性化を行う。モノオキシゲナーゼは、ルグドゥニン中間体に単一のヒドロキシル基を組み込む。タイプ II チオエステラーゼは、生合成中に停止する中間体を除去するために利用される。^[要出典]

ルグドゥニンに関する驚くべき点は、オペロンが 5 つのアデニル化ドメインのみをコードしていることである。これは、このような大きな分子にしては興味深いほど少ない数である。この矛盾は、LugC が 3 つの連続したバリン残基を交互に D および L 配置で追加することで説明される。チアゾリジン環は、還元によって代謝産物が放出された後に形成される。N 末端の L-システイン残基は、C 末端の L-バリン残基のカルボニル^{[6]を求核的に攻撃し、イミン大環状分子を形成する。この反応で形成された}シッフ塩基は、次にシステインチオールによって求核的に攻撃され、前述のチアゾリジン複素環を生成する。^{[引用が必要]}

参考文献

^ ギャラガー、ジェームズ (2016-07-27). 「抗生物質耐性: 『鼻水戦争』研究が新たな薬剤クラスの到来を告げる」BBCニュース2016-07-27閲覧。
^ ジッパーラー、アレクサンダー;コナース、マーティン・C.ラウクス、クラウディア。ベルシャイト、アン。ヤネック、ダニエラ。ヴァイデンマイヤー、クリストファー。マーク・ブリアン。シリング、ナディーン A.クリストフ・スラヴェチンスキー (2016)。「新規抗生物質を産生するヒトの共生生物は病原体の定着を阻害する」。自然。535 (7613): 511–516。Bibcode :2016Natur.535..511Z。土井：10.1038/nature18634. PMID 27466123。S2CID 205249755 。
^ 「科学者が鼻の中に隠された微生物の宝物を発見」ロサンゼルス・タイムズ2016年7月27日2016年7月27日閲覧。
^ クリスマー、ベルンハルト;ペシェル、アンドレアス。グロンド、ステファニー。ブローッツ・エスターヘルト、平家。シテック、ビルギット。カルバッハー、ヒューバート。ウィルマン、マティアス。マティアス元帥。スラヴェチンスキー、クリストフ。シリング、ナディーン A.マーク・ブリアン。ヴァイデンマイヤー、クリストファー。ヤネック、ダニエラ。ベルシャイト、アン。ラウクス、クラウディア。コナース、マーティン・C.ジッパーラー、アレクサンダー (2016 年 7 月)。「拡張データ図 1: ルグデュニンの遺伝子クラスターと S. lugdunensis IVK28-Xyl の生成」。自然。535 (7613): 511–516。Bibcode :2016Natur.535..511Z。doi :10.1038/nature18634. PMID 27466123. S2CID 205249755.
^ Krauss, Sophia; Zipperer, Alexander; Wirtz, Sebastian; Saur, Julian; Konnerth, Martin C.; Heilbronner, Simon; Torres Salazar, Benjamin O.; Grond, Stephanie; Krismer, Bernhard; Peschel, Andreas (2020-12-16). 「Staphylococcus lugdunensis における異なる ABC トランスポーターによる新規フィブペプチド抗菌剤 Lugdunin の分泌と自己耐性」.抗菌剤および化学療法. 65 (1): e01734–20. doi :10.1128/AAC.01734-20. ISSN 0066-4804. PMC 7927808 . PMID 33106269.
^ 「ルグドゥニン - 概要 | ScienceDirect Topics」www.sciencedirect.com . 2022年6月4日閲覧。

外部リンク

「プレスリリース：人体の中に潜在的に命を救う物質が眠っている」（PDF）。www.uni - tuebingen.de。テュービンゲン大学。 2016年7月28日閲覧。

[1] ギャラガー、ジェームズ (2016-07-27). 「抗生物質耐性: 『鼻水戦争』研究が新たな薬剤クラスの到来を告げる」BBCニュース2016-07-27閲覧。

[2] ジッパーラー、アレクサンダー;コナース、マーティン・C.ラウクス、クラウディア。ベルシャイト、アン。ヤネック、ダニエラ。ヴァイデンマイヤー、クリストファー。マーク・ブリアン。シリング、ナディーン A.クリストフ・スラヴェチンスキー (2016)。「新規抗生物質を産生するヒトの共生生物は病原体の定着を阻害する」。自然。535 (7613): 511–516。Bibcode :2016Natur.535..511Z。土井：10.1038/nature18634. PMID 27466123。S2CID 205249755 。

[3] 「科学者が鼻の中に隠された微生物の宝物を発見」ロサンゼルス・タイムズ2016年7月27日2016年7月27日閲覧。

[4] クリスマー、ベルンハルト;ペシェル、アンドレアス。グロンド、ステファニー。ブローッツ・エスターヘルト、平家。シテック、ビルギット。カルバッハー、ヒューバート。ウィルマン、マティアス。マティアス元帥。スラヴェチンスキー、クリストフ。シリング、ナディーン A.マーク・ブリアン。ヴァイデンマイヤー、クリストファー。ヤネック、ダニエラ。ベルシャイト、アン。ラウクス、クラウディア。コナース、マーティン・C.ジッパーラー、アレクサンダー (2016 年 7 月)。「拡張データ図 1: ルグデュニンの遺伝子クラスターと S. lugdunensis IVK28-Xyl の生成」。自然。535 (7613): 511–516。Bibcode :2016Natur.535..511Z。doi :10.1038/nature18634. PMID 27466123. S2CID 205249755.

[5] Krauss, Sophia; Zipperer, Alexander; Wirtz, Sebastian; Saur, Julian; Konnerth, Martin C.; Heilbronner, Simon; Torres Salazar, Benjamin O.; Grond, Stephanie; Krismer, Bernhard; Peschel, Andreas (2020-12-16). 「Staphylococcus lugdunensis における異なる ABC トランスポーターによる新規フィブペプチド抗菌剤 Lugdunin の分泌と自己耐性」.抗菌剤および化学療法. 65 (1): e01734–20. doi :10.1128/AAC.01734-20. ISSN 0066-4804. PMC 7927808 . PMID 33106269.

[6] 「ルグドゥニン - 概要 | ScienceDirect Topics」www.sciencedirect.com . 2022年6月4日閲覧。