LRRC23

ロイシンリッチリピート含有タンパク質23は、ヒトではLRRC23遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

LRRC23の機能は不明である。LRRC23はロイシンリッチリピートファミリーに属するタンパク質であり、タンパク質間相互作用に関与することが知られている。実験的証拠は、LRRC23が免疫系および自然発生的な自己免疫疾患を制御する制御性T細胞の発達に関連する経路でCD28タンパク質と相互作用することを示唆している。^{[ 8 ]}

LRRC23は、内部に2種類の繰り返し配列を含む343残基に及ぶ。RADAR ^{[ 9 ]}によって検出および整列された最も豊富な繰り返し配列はロイシンリッチ繰り返し配列で、89-287番目の塩基で9回繰り返される。もう1つの繰り返し配列は、3-36番目の塩基で2回出現する。以下のRADARプログラムの出力は、すべての繰り返し配列の構成と位置を要約し、それらを互いに比較できるように整列している。

ヒトゲノムはLRRC23の既知の3つのバリアントを生成する。^{[ 7 ]}最大のスプライスバリアントであるバリアント3は8つのエクソンを含む。バリ​​アント1と2は代替の最初のエクソンを使用し、バリアント2は7番目のエクソンを除外するため、mRNAを構成するエクソンは合計7つになる。

LRRC23の実際の構造は不明ですが、2OMW A（e値1.00e-17）などの様々な類似タンパク質の結晶構造と比較すると、他のロイシンリッチリピートタンパク質に典型的な構造であることがわかります。交互に配置されたβシートとコイルがらせん状のペプチド鎖を形成し、βシートが凹面を占めるアーチ状の形状を形成します。^{[ 10 ]}

2OMW_AとLRRC23のアラインメント構造は、LRRC23タンパク質の72番目から272番目のアミノ酸残基に及ぶ。保存されたアスパラギン残基は黄色で強調表示されており、その間隔と繰り返し構造の規則性を示している。このモデルは、NCBIが提供するCn3Dソフトウェアを使用して作成された。

• UCSCゲノムブラウザにおけるLRRC23ヒト遺伝子の位置。
• UCSCゲノムブラウザにおけるLRRC23ヒト遺伝子の詳細。