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フアン・フェルナンデスミズナギドリ（学名： Pterodroma externa ）は、ミズナギドリ科に属する海鳥の一種です。チリ沖のフアン・フェルナンデス諸島にある単一の島に営巣します。以前は、太平洋とインド洋の熱帯海域に生息するシロエリミズナギドリ（学名： Pterodroma cervicalis ）の亜種として分類されていました。
フアン・フェルナンデスミズナギドリは、体長43cm、翼開長95～97cm、体重500gの大型ミズナギドリ科の鳥です。上面は濃い茶色がかった灰色で、翼を広げると黒いM字型の模様があります。下面は白く、翼の下面は黒く縁取られています。顔は白く、目の下に黒い「帽子」が伸びています。足は黄色で、先端は濃い茶色です。嘴は黒く、先端が鉤状になっており、ミズナギドリ目特有の管状の鼻孔があります。
営巣地は標高の高い尾根（ 750m以上）で、そこで2～3mの巣穴を掘り、年に1羽の雛を育てます。メスは11月中旬に白い卵を1個産み、つがいの2羽が交代で約60日間卵を温めます。雛は2月中旬に孵化し、5月に巣立つまで90～100日間両親から餌を与えられます。雛は巣立ち体重に達し、羽毛が完全に生え揃うまで巣穴の中で過ごします。雛は主に吐き戻した魚やイカを食べます。
繁殖期には、ミズナギドリはアレハンドロ・セルカーク島とロビンソン・クルーソー島（いずれもフアン・フェルナンデス諸島）周辺の海域、およびチリ沿岸で採餌する。ミズナギドリ類は、ハシボソミズナギドリ類や他の海鳥類と群れをなして見られる。非繁殖期には、ミズナギドリ類は赤道海流と反流で採餌し、北はハワイ諸島まで移動する。オーストラリア、ニュージーランドのチャタム諸島、フィジー、アメリカ合衆国（アリゾナ州とオレゴン州）では迷鳥として記録されている。
ミズナギドリはチリのアレハンドロ・セルカーク島でのみ繁殖する。1985～86年の繁殖個体数は100万ペアと推定され、世界全体では300万～500万羽に及ぶ可能性がある。営巣地では、外来種（ネコやネズミ）による捕食、そして程度は低いものの、外来草食動物（ヤギ）による生息地の喪失によって脅かされている。IUCNレッドリストでは、固有種であることと外来捕食者による脅威のため、絶滅危惧種に指定されている。