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ジャレッド・ローチ | |
|---|---|
 2011年のローチ | |
| 市民権 | アメリカ合衆国 |
| 母校 | ワシントン大学 コーネル大学 |
| 知られている | ペアワイズエンドシーケンシング |
| 科学者としてのキャリア | |
| フィールド | バイオテクノロジー、ゲノミクス、システム生物学 |
| 機関 | システム生物学研究所 |
| 論文 | ランダムサブクローニング、ペアワイズエンドシーケンシング、および脊椎動物トリプシノーゲンの分子進化 （1998） |
| 博士課程の指導教員 | リロイ・フッド |
| Webサイト | ISBのプロフィール |
ジャレッド・C・ローチは、ワシントン大学の大学院生時代にペアワイズエンドシーケンシング戦略を発明したアメリカの生物学者です。[1] [2] [3] [4]
教育と初期のキャリア
ローチはコーネル大学に入学し、1990年に生物学の理学士号を取得した。その後ワシントン大学に進学し、1998年に免疫学の博士号、1999年に医学博士号を取得した。2001年までユタ大学で内科の研修を受けた。[5]
キャリア
1990年代に大学院生としてスタートしたローチは、ヒトゲノム計画の初期から2003年の終了まで携わりました。 [4] [6]彼は、リロイ・フッドの研究室 の大学院生時代に、ペアワイズエンドシーケンシングを発明しました。 [4] [7] [3]
ローチ氏は1999年から2000年までワシントン大学分子生物工学科の上級研究員を務めた。2001年にはシステム生物学研究所の研究員となった。[8]
2009年、ローチはミラー症候群と原発性繊毛機能不全症を患う2人の子供を含む4人家族の全ゲノム配列を解読するプロジェクトの第一著者となった。[9] [10]この取り組みにより、単純な劣性メンデル遺伝病であるミラー症候群の原因が特定された。[11] また、ヒトで初めての完全な全染色体親ハプロタイプも作成された。[5]親ハプロタイピングとは、ゲノム内のすべての変異を父方と母方の染色体に割り当てるプロセスである。[12]研究チームはこれらの技術を適用して、アダムス・オリバー症候群、小児交代性片麻痺、てんかんの特定のサブタイプ、掌蹠角化症、ファンコニ貧血の遺伝子など、いくつかの遺伝性疾患に関連する遺伝子変異を特定した。[13] [14] [15] [16] [17]
2007年から2009年まで、シアトル小児病院のハイスループット分析コア（HAC）研究所の科学ディレクターを務めた。2009年以来、システム生物学研究所の上級研究員を務めている。ローチ氏のグループは現在、アルツハイマー病に焦点を当て、複雑な遺伝性疾患にシステム生物学を応用している。[18]
2020年、ローチ氏はワシントン州で最初に発生したSARS-CoV-2の分子系統学を解明するプロジェクトに参加した。[19] [20] [21]
主な出版物
ローチは70以上の出版物を執筆しており、9000回以上引用されている。[22] [23]
- Aparicio, S.; Chapman, J.; Stupka, E.; Putnam, N.; Chia, JM; Dehal, P.; Christoffels, A.; Rash, S.; Hoon, S.; Smit, A.; Gelpke, MD; Roach, J.; Oh, T.; Ho, IY; Wong, M.; Detter, C.; Verhoef, F.; Predki, P.; Tay, A.; Lucas, S.; Richardson, P.; Smith, SF; Clark, MS; Edwards, YJ; Doggett, N.; Zharkikh, A.; Tavtigian, SV; Pruss, D.; Barnstead, M.; et al. (2002). 「Fugu rubripes ゲノムの全ゲノム ショットガン アセンブリと分析」。Science。297 (5585): 1301– 10. Bibcode :2002Sci...297.1301A. doi :10.1126/science.1072104. PMID 12142439. S2CID 10310355.
- Roach, JC; Glusman, G.; Rowen, L.; Kaur, A.; Purcell, MK; Smith, KD; Hood, LE; Aderem, A. (2005). 「脊椎動物の Toll 様受容体の進化」。米国 科学アカデミー紀要。102 ( 27): 9577– 82。Bibcode : 2005PNAS..102.9577R。doi : 10.1073 / pnas.0502272102。PMC 1172252。PMID 15976025。
- Roach, JC; Boysen, C.; Wang, K.; Hood, L. (1995). 「ペアワイズエンドシーケンシング: ゲノムマッピングとシーケンシングへの統一アプローチ」. Genomics . 26 (2): 345– 53. doi :10.1016/0888-7543(95)80219-c. PMID 7601461.
- Roach, JC; Glusman, G.; Smit, AF; Huff, CD; Hubley, R.; Shannon, PT; Rowen, L.; Pant, KP; Goodman, N.; Bamshad, M.; Shendure, J.; Drmanac, R.; Jorde, LB; Hood, L.; Galas, DJ (2010). 「全ゲノム配列解析による家族カルテットの遺伝的継承の解析」. Science . 328 (5978): 636– 9. Bibcode :2010Sci...328..636R. doi :10.1126/science.1186802. PMC 3037280. PMID 20220176 .
- Roach, JC; Glusman, G.; Hubley, R.; Montsaroff, SZ; Holloway, AK; Mauldin, DE; Srivastava, D.; Garg, V.; Pollard, KS; Galas, DJ; Hood, L.; Smit, AF (2011). 「ヒト家族の遺伝的フェージングによる染色体ハプロタイプ」. American Journal of Human Genetics . 89 (3): 382– 97. doi : 10.1016 /j.ajhg.2011.07.023. PMC 3169815. PMID 21855840.
- Roach, JC (1995). 「ランダムサブクローニング」.ゲノム研究. 5 (5): 464– 73. doi : 10.1101/gr.5.5.464 . PMID 8808467.
参考文献
- ^ Xiao W、Wu L、Yavas G、Simonyan V、Ning B 、 Hong H (2016)。「精密医療の進歩におけるパーソナルゲノムアセンブリの課題、解決策、品質指標」。Pharmaceutics。8 ( 2 ) : 15。doi : 10.3390 / pharmaceutics8020015。PMC 4932478。PMID 27110816。
{{cite journal}}: CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク) - ^ ティマーマン、ルーク（2016年8月10日）。フッド：ゲノミクス時代の先駆者。バンデラプレス。265ページ。ISBN 978-0997709308。
- ^ ab Jones, Neil C. (2004). バイオインフォマティクスアルゴリズム入門。Pevzner, Pavel。ケンブリッジ、マサチューセッツ州: MIT プレス。p. 300。ISBN 978-0-262-25643-8. OCLC 57559562.
- ^ abc Hood, Lee (2008年7月1日). 「発見の個人的な旅：技術の開発と生物学の変化」. Annual Review of Analytical Chemistry . 1 (1): 1– 43. Bibcode :2008ARAC....1....1H. doi :10.1146/annurev.anchem.1.031207.113113. PMID 20636073. S2CID 6436663.
- ^ ab Vence, Tracy (2011 年 11 月)。「ゲノム解析: 新しいアルゴリズムにより、研究者は 2 つの家族のハプロタイプを生成」。ゲノム テクノロジー。2011 年 11 月。
- ^ シェア、スティーブ（2011年10月24日）。「ゲノムと未来のテクノロジー」。ウィークデイ。NPR。KUOW。
- ^ Roach, Jared (1995). 「ペアワイズエンドシーケンシング：ゲノムマッピングとシーケンシングへの統一アプローチ」. Genomics . 26 (2): 345– 353. doi :10.1016/0888-7543(95)80219-C. PMID 7601461.
- ^ 「ISBのJared Roachが語る、2つのテクノロジーが1つよりも優れている理由」GenomeWeb 2005年6月8日2020年10月23日閲覧。
- ^ ウェイド、ニコラス（2010年3月11日）。「病気の原因はゲノムで特定される」ニューヨークタイムズ。1ページ。
- ^ スチュワート、カーステン（2010年3月10日）。「ある家族のゲノムを解明する」ソルトレーク・トリビューン。
- ^ Ada Hamosh (2017年2月16日). 「ジヒドロオロテート脱水素酵素; DHODH」. Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) . 国立医学図書館. 2021年2月8日閲覧。
- ^ Chen, Rui; Snyder, Michael (2013 年 1 月). 「パーソナライズされたオミクスの精密医療への可能性」. Wiley Interdisciplinary Reviews. Systems Biology and Medicine . 5 (1): 73– 82. doi :10.1002/wsbm.1198. ISSN 1939-005X. PMC 4154620. PMID 23184638 .
- ^ Capuano, Alessandro; Garone, Giacomo; Tiralongo , Giuseppe; Graziola, Federica (2020). 「小児期の交代性片麻痺：ATP1A3変異の遺伝子型と表現型の関係を理解する」。臨床遺伝学 の応用。13：71–81。doi ： 10.2147 / TACG.S210325。ISSN 1178-704X。PMC 7125306。PMID 32280259。
- ^ Ceccaldi, Raphael; Sarangi, Prabha; D'Andrea, Alan D. (2016 年 6 月). 「ファンコニ貧血経路: 新たな役割と新たな機能」. Nature Reviews. 分子細胞生物学. 17 (6): 337– 349. doi :10.1038/nrm.2016.48. ISSN 1471-0080. PMID 27145721. S2CID 1712640.
- ^ Marla JF O'Neill (2015年10月5日). 「ADAMS-OLIVER SYNDROME 6; AOS6」. Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) . 国立医学図書館. 2021年2月8日閲覧。
- ^ Cassandra L. Kniffin (2015年1月8日). 「SYNTAXIN 1B; STX1B」. Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) . 国立医学図書館. 2021年2月8日閲覧。
- ^ Marla JF O'Neill (2015年6月1日). 「一過性受容体電位カチオンチャネル、サブファミリーV、メンバー3; TRPV3」。Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)。国立医学図書館。 2021年2月8日閲覧。
- ^ 「システム生物学研究所」ISB . 2021年2月8日閲覧。
- ^ カンブ、ルイス（2020年3月31日）。「コロナウイルスデータの洪水がワシントン州の疾病報告システムを圧倒し、データの遅れにつながる」シアトルタイムズ。
- ^ カンブ、ルイス（2020年5月14日）。「コロナウイルスがワシントンを襲ったのはいつですか？抗体を持つスノホミッシュ郡の住民2人が12月に病気になりました」シアトルタイムズ。
- ^ ドートン、サンディ（2020年5月26日）。「新たな分析により、ワシントン州のコロナウイルス流行の歴史が書き換えられる可能性」シアトルタイムズ。
- ^ 「NCBI Pubmedの「Roach JCC」」 。 2022年11月5日閲覧。
- ^ 「Jared Roach の Google Scholar プロフィール」 。2022年11 月 5 日閲覧。
外部リンク
- システム生物学研究所在籍中にジャレッド・ローチが執筆した出版物のリスト