ジャガー（ソフトウェア）

ジャガー
開発者	シュレディンガー株式会社
オペレーティング·システム	Linux、Microsoft Windows、Mac OS X
タイプ	計算化学
ライセンス	コマーシャル
Webサイト	https://www.schrodinger.com/jaguar

Jaguarは、気相と溶液相の両方の第一原理量子化学計算に使用されるコンピュータソフトウェアパッケージです。 ^[1]これは、Schrödinger社が販売している商用ソフトウェアです。このプログラムは、 Richard FriesnerとWilliam Goddardの研究グループによって開発され、当初はPS-GVB（プログラムに搭載されていたいわゆる擬似スペクトル一般化原子価結合法を指す）と呼ばれていました。

Jaguar は、他の 2 つの Schrödinger 製品のコンポーネントです。Jaguarにグラフィカルユーザーインターフェイスを提供する Maestroと、量子化学エンジンとして Jaguar を使用するQM/MMプログラム QSite です。現在のバージョンは Jaguar 10.4 (2020) です。

特徴

Jaguarの特徴は擬スペクトル近似を使用していることです。^[2]この近似は、ほとんどの量子化学計算で使用されている計算コストの高い積分演算に適用できます。その結果、計算が高速化され、精度の低下がほとんどありません。^[3]^[4]^[5]

現在のバージョンには次の機能が含まれています。

ハートリー・フォック（RHF、UHF、ROHF）と密度汎関数理論（LDA、勾配補正、分散補正、ハイブリッド汎関数）
局所2次モーラー・プレセ摂動論（LMP2）
一般化原子価結合完全対合（GVB-PP）およびGVB-LMP2計算
配置間相互作用（CIS）と時間依存密度汎関数理論（TDDFT）を用いた励起状態の予測
構造最適化と遷移状態探索
ポアソン・ボルツマン方程式に基づく溶媒和計算
赤外線（IR）、核磁気共鳴（NMR）、紫外線（UV）、振動円二色性（VCD）スペクトルの予測
pKa予測
さまざまな分子表面の生成（静電ポテンシャル、電子密度、分子軌道など）
さまざまな分子特性（多重極モーメント、分極率、振動周波数など）の予測

参照

量子化学コンピュータプログラム

参考文献

^ Young, David (2001). 「付録 AA2.5 Jaguar」.計算化学. Wiley-Interscience. p. 337.
^ Orszag, Steven A. (1972年9月). 「擬スペクトル近似とスペクトル近似の比較」.応用数学研究. 51 (3): 253–259. doi :10.1002/sapm1972513253.
^ Friesner, RA (1991年10月). 「巨大分子の電子構造計算のための新しい方法」. Annual Review of Physical Chemistry . 42 (1): 341–367. Bibcode :1991ARPC...42..341F. doi :10.1146/annurev.pc.42.100191.002013. PMID 1747190. S2CID 32730211.
^ Friesner, Richard A.; Murphy, Robert B.; Beachy, Michael D.; Ringnalda, Murco N.; Pollard, W. Thomas; Dunietz, Barry D.; Cao, Yixiang (1999 年 4 月). 「大型分子の相関 ab Initio 電子構造計算」. The Journal of Physical Chemistry A. 103 ( 13): 1913–1928. Bibcode :1999JPCA..103.1913F. doi :10.1021/jp9825157.
^ Lado, F.; Lomba, E.; Lombardero, M. (1995). 「完全に異方性の分子からなる流体の積分方程式アルゴリズム」(PDF) . The Journal of Chemical Physics . 103 (1): 481. Bibcode :1995JChPh.103..481L. doi :10.1063/1.469615.

外部リンク

シュレディンガー株式会社

[1] Young, David (2001). 「付録 AA2.5 Jaguar」.計算化学. Wiley-Interscience. p. 337.

[pseudo-fluid-mech-2] Orszag, Steven A. (1972年9月). 「擬スペクトル近似とスペクトル近似の比較」.応用数学研究. 51 (3): 253–259. doi :10.1002/sapm1972513253.

[hf-pseudo-3] Friesner, RA (1991年10月). 「巨大分子の電子構造計算のための新しい方法」. Annual Review of Physical Chemistry . 42 (1): 341–367. Bibcode :1991ARPC...42..341F. doi :10.1146/annurev.pc.42.100191.002013. PMID 1747190. S2CID 32730211.

[dft-pseudo-4] Friesner, Richard A.; Murphy, Robert B.; Beachy, Michael D.; Ringnalda, Murco N.; Pollard, W. Thomas; Dunietz, Barry D.; Cao, Yixiang (1999 年 4 月). 「大型分子の相関 ab Initio 電子構造計算」. The Journal of Physical Chemistry A. 103 ( 13): 1913–1928. Bibcode :1999JPCA..103.1913F. doi :10.1021/jp9825157.

[lmp2-pseudo-5] Lado, F.; Lomba, E.; Lombardero, M. (1995). 「完全に異方性の分子からなる流体の積分方程式アルゴリズム」(PDF) . The Journal of Chemical Physics . 103 (1): 481. Bibcode :1995JChPh.103..481L. doi :10.1063/1.469615.