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| 略語 | INCF |
|---|---|
| 形成 | 2005年[1] |
| 本部 | INCF事務局 |
| 位置 | |
| 座標 | 北緯59°20′54.46″ 東経18°1′25.78″ / 北緯59.3484611° 東経18.0238278° / 59.3484611; 18.0238278 |
理事会議長 | メアリーアン・マートン[2] |
| Webサイト | インド |
国際神経情報科学調整施設(INCF)は、オープン、FAIR、 [4] 、引用可能な神経科学の原則を取り入れた標準とベストプラクティスを開発、評価、推奨することを使命とする国際的な非営利団体です。INCFは、標準とベストプラクティスがどのように再現性を促進し、データとコードを含む研究成果全体の公開を可能にするかについてのトレーニングも提供しています。INCFは、OECDのグローバルサイエンスフォーラム作業部会の勧告により2005年に設立されました。 [ 5] INCFは、スウェーデンのストックホルムにあるカロリンスカ研究所が主催しています。[6] INCFネットワークは、神経情報科学、神経科学、データサイエンス、テクノロジー、科学政策と出版の分野で活動する機関、組織、企業、個人で構成されています。このネットワークは、様々なカテゴリーの世界的なニューロインフォマティクス活動を調整する統治機関とワーキンググループで構成されており、標準とベストプラクティスの開発と承認を指導・監督するとともに、標準とベストプラクティスが再現性を促進し、データとコードを含む研究成果全体の公開を可能にする方法に関するトレーニングを提供しています。[7]現在のディレクターはマシュー・エイブラムスとヘレナ・レドマーであり、[8]理事会の議長はメアリーアン・マートンです。
INCFネットワークの目的は[9]、脳を理解するための計算的アプローチの応用を促進し、計算方法を使用して規模、技術、種を超えた多様なデータを統合および分析し、脳を理解して社会の健康と幸福にプラスの影響を与えるために必要なインフラストラクチャを開発することです。
背景
神経系をうまく理解するための重要な要素は、神経科学と情報科学の統合です。神経系を研究する分野である神経科学は、ゲノムの研究から、さまざまな機能状態や介在するすべての分析レベルにおける人間や他の種の行動の脳画像化の研究まで、最も洗練された技術を使用して、脳がどのように機能するかを理解するという素晴らしい課題に応えてきました。この取り組みにより、大量のデータが生成され、複雑さのレベルが増すにつれて、その量はますます増加しています。生成されるデータは、研究レベルや分析方法が異なるため、多種多様です。この統合の課題に立ち向かい、これらのデータを効率的かつ最大限に活用するには、次の共有リソースを開発および作成する必要があります。
- 神経科学データおよび知識データベース;
- 分析およびモデリングツール
- 計算モデル。
この課題は、神経科学と情報科学を融合した神経情報科学の分野を通じて解決されています。
歴史
創世記
ニューロインフォマティクスという新しい分野における国際的な取り組みを調整するという勧告は、1998年に当時のOECDメガサイエンスフォーラムの主導で作成されたバイオインフォマティクスに関する報告書の中で初めてなされました。 [10]スティーブン・H・コズロウ博士が議長を務めるグローバルサイエンスフォーラムのニューロインフォマティクス作業部会での広範な議論の後、国際ニューロインフォマティクス調整評議会とニューロインフォマティクス研究の助成金制度を創設するという提案が2002年に提示されました。[11]このプロジェクトは、2004年1月のOECD科学大臣会合で承認されました。その後、16か国(オーストラリア、カナダ、中国、チェコ共和国、デンマーク、フィンランド、フランス、ドイツ、インド、イタリア、日本、オランダ、ノルウェー、スウェーデン、スイス、英国、米国、オーストラリアのビクトリア州)と欧州委員会が、INCFと国際ニューロインフォマティクス計画(PIN)の法的根拠となる作業文書を策定しました。[12]
設立
INCF [13]の設立条件は2005年7月に満たされ、7カ国(チェコ共和国、フィンランド、ドイツ、ノルウェー、スウェーデン、スイス、米国)が了解文書に署名し、財政的貢献を約束しました。INCF事務局の誘致に着手しました。2つの提案が受理され、理事会の指示により、11月3日、OECD [14]は提案を検討し順位付けするための専門家パネルを招集しました。パネルはスウェーデンの提案に高い順位を付け、この勧告は11月28日にOECD本部で開催されたINCF理事会によって承認されました。広範囲にわたる国際的な議論の後、INCFは2007年2月にストックホルムのカロリンスカ研究所に本部を置いて正式に発足しました。
INCFは、神経情報科学と脳研究の再現性における協力を推進しています。
- オープンでFAIR(見つけやすく、アクセスしやすく、相互運用性があり、再利用可能な)神経科学( FAIRデータ)をサポートする標準とベストプラクティスの開発と承認を通じて、世界的な神経科学インフラストラクチャの調整を提供する[15]
- 研究者、管理者、学生に、ニューロインフォマティクスが厳密さと再現性、オープンで公正な科学を推進し、研究成果の全体(物語、データ、コード)を公開することについて教育する[16]
- 神経科学をFORCE(FAIR、オープン、研究対象ベース、引用可能なエコシステム)に向けて推進する分野として奨励する
- 科学分野としての神経情報科学の進歩と継続的な発展を促進する
主なプログラム成果
含む
- ワックスホルム空間(WHS)[17] 、げっ歯類の脳の座標ベースの参照空間
- スケーラブル・ブレイン・アトラス[18]は、脳アトラス、画像データ、トポロジーを表示するWebベースのエンジンである。
- NineML [19]汎用モデル記述言語
- マルチシミュレーションコーディネータ(MUSIC)[20]は、大規模なニューロンシミュレータと他のアプリケーションが実行中に通信することを可能にする。
- 神経画像情報データモデル(NI-DM)[21]は、出所情報を含むメタデータの生成、保存、およびクエリのためのフレームワークである。
- KnowledgeSpace [22]は、脳研究の概念を世界中のデータ、モデル、文献とリンクするコミュニティベースの百科事典である。
- TrainingSpace [23]はINCF、私たちのパートナー、そして既存のコミュニティリソースによって開発された神経情報科学トレーニングリソースをリンクするオンラインリポジトリです。
参照
参考文献
- ^ “歴史”. KI.se . 2019年10月9日閲覧。
- ^ ab 「連絡先」。INCF 。 2019年10月9日閲覧。
- ^ 「ミッション | INCF」www.incf.org . 2019年10月9日閲覧。
- ^ Hagstrom, Stephanie (2014-09-03). 「FAIR データ原則」. FORCE11 . 2017-12-04閲覧。
- ^ 「About」。Neuroscience Peer Review Consortium 。 2017年9月19日閲覧。
- ^ “Location | INCF”. www.incf.org . 2019年10月9日閲覧。
- ^ 「INCFネットワーク | INCF」。www.incf.org 。 2019年10月9日閲覧。
- ^ 「Key personal | INCF」www.incf.org . 2019年10月8日閲覧。
- ^ 「私たちの活動 | INCF」www.incf.org . 2017年12月4日閲覧。
- ^ メガサイエンスフォーラム生物情報科学ワーキンググループ(1999年1月)。最終報告書(報告書)。経済協力開発機構。pp. 3–4, 49–50, 70–72 。 2017年9月19日閲覧– INCF ownCloud経由。
- ^ グローバルサイエンスフォーラム ニューロインフォマティクスワーキンググループ(2002年6月)。ニューロインフォマティクスに関する報告書(報告書)。経済協力開発機構。pp. 5、11–15、46 。2017年9月19日に取得– ICNF ownCloud経由。
- ^ 「プロジェクトの開始 | INCF」www.OECD.org . 2019年10月9日閲覧。
- ^ "Incf | INCF". www.incf.org . 2017年12月4日閲覧。
- ^ 「OECD.org - OECD」。www.oecd.org 。 2017年12月4日閲覧。
- ^ Wilkinson M、Dumontier M、 Aalbersberg I、他 (2016 年 3 月)。「科学データの管理と管理に関する FAIR 指導原則」。Scientific Data。3 ( 160018 ): 160018。Bibcode : 2016NatSD ... 360018W。doi :10.1038/sdata.2016.18。PMC 4792175。PMID 26978244。
- ^ Breeze JL、Poline JB、Kennedy DN(2012年7月) 。「神経イメージング分野におけるデータの共有と公開」。GigaScience。1 (9 ):9。doi : 10.1186 /2047-217x - 1-9。PMC 3626511。PMID 23587272。
- ^ Johnson GA、Badea A、Brandenburg J、Cofer G、Fubara B、Liu S、Nissanov J (2010 年 11 月)。「Waxholm Space: マウス脳研究を調整するための画像ベースのリファレンス」。NeuroImage。53 ( 2 ) : 365–372。doi :10.1016/ j.neuroimage.2010.06.067。PMC 2930145。PMID 20600960。
- ^ 「スケーラブルな脳アトラス - 指先でわかる神経解剖学」scalablebrainatlas.incf.org . 2017年12月4日閲覧。
- ^ "NineML" . 2017年12月4日閲覧。
- ^ MUSIC、MUltiSimulation コーディネーター、国際神経情報学調整施設 (INCF)、2017-11-14、2017-12-04取得
- ^ 「- 神経画像データモデル」。2017年12月4日閲覧。
- ^ 「KnowledgeSpace - ホーム」。knowledge-space.org 。 2017年12月4日閲覧。
- ^ 「TrainingSpace - ホーム」。training.incf.org 。 2018年4月24日閲覧。
外部リンク
- 公式サイト
- ニューロインフォマティクス会議 – 2019 年 (ポーランド、ワルシャワ)、2018 年 (カナダ、モントリオール)、2017 年、2016 年、2015 年、2014 年、2013 年、2012 年、2011 年、2010 年、2009 年、2008 年
- 神経科学ピアレビューコンソーシアム
- Van Essen, David (2007 年春)。「SfN 会長 David Van Essen からのメッセージ」。Neuroscience Quarterly。2007年 7 月 13 日時点のオリジナルよりアーカイブ。

