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| ハプログループ L5 | |
|---|---|
| 起源の可能性のある時期 | 114,200-126,200年前[1] |
| 起源地の可能性 | 東アフリカ、ナイル川上流域 |
| 祖先 | L2-6 |
| 子孫 | L5a、L5c |
| 突然変異の定義 | 3423、7972、12432、12950 [2] |
ハプログループ L5 は、ヒトのミトコンドリア DNA (mtDNA) 系統です。以前はL1eとして知られていました。
分布
L5は東アフリカを中心とする小さなハプログループです。最も頻度が高いのは東中央アフリカのムブティ・ ピグミーで、15%です。 [3]タンザニア（サンダウェなど）、ケニア、チャド、エチオピア、スーダン、ヌビア、エジプト[4] [注1]、サウジアラビア でも比較的低い頻度で存在します。 [5]
ハプログループL5は、スーダンのクルブナルティ島の墓地で初期キリスト教時代（西暦550-800年）の標本から確認されている。[6]
サブクラス
木
このハプログループL5サブクレードの系統樹は、マンニス・ヴァン・オーブンとマンフレッド・カイザーによる論文「ヒトミトコンドリアDNA変異の包括的系統樹の更新」[2]とその後の発表された研究に基づいています。
- 最も最近の共通祖先 (MRCA)
- L1-6
- L2-6
- L5
- L5a
- L5a1
- L5a1a
- L5a1b
- L5a1c
- L5a2
- L5a1
- L5c
- L5c1
- L5c2
- L5a
- L5
- L2-6
- L1-6
参考文献
- ^ Soares, P; Ermini, L; Thomson, N; Mormina, M; Rito, T; Röhl, A; Salas, A; Oppenheimer, S; MacAulay, V (2009). 「浄化選択の修正: 改良されたヒトミトコンドリア分子時計」. American Journal of Human Genetics . 84 (6): 740–59. doi :10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773 .
- ^ ab van Oven, Mannis; Manfred Kayser (2008年10月13日). 「ヒトミトコンドリアDNAの変異に関する包括的系統樹の更新」. Human Mutation . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457. S2CID 27566749.
- ^ Sarah A. Tishkoff 他 2007、「mtDNA と Y 染色体の遺伝的変異から推定されるアフリカのクリック音話者集団の歴史」分子生物学と進化 2007 24(10):2180-2195
- ^ ステバノビッチ、A; A. ジル。 E.ブザイド; R. ケフィ; F.パリ。 RPゲイロー。 JLスパドーニ。 F.エルチェナウィ。 E. ベラウド・コロン (2004 年 1 月 29 日)。 「エジプトの座りがちな集団におけるミトコンドリア DNA 配列の多様性」。人類遺伝学の年代記。68 (1): 23-39。土井：10.1046/j.1529-8817.2003.00057.x。PMID 14748828。S2CID 44901197 。
- ^ Abu-Amero et al. 2008年2月. 「アラビア半島のミトコンドリアDNA構造」、BMC Evolutionary Biology. 8(45): 52.
- ^ Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). 「IUAES インターコングレス 2016 抄録集 - コミュニティは分裂しているのか? 次世代シーケンシングによる中世クルブナルティのコミュニティゲノムの解明」。IUAESインターコングレス 2016 抄録集。IUAES : 115。
注記
- ^ サンプル UPE52 はサブクレード L5a です。
外部リンク
ウィキメディア・コモンズには、ハプログループ L5 (mtDNA)に関連するメディアがあります。
- 一般的な
- マニス・ヴァン・オーヴェンのフィロツリー
- ハプログループ L5
- イアン・ローガンのハプログループ L5
- YFull MTree のハプログループ L5
- MITOMAP のハプログループ L5