| ハロロドスピラ・ハロフィラ | |
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| 科学的分類 | |
| ドメイン: | |
| 門: | |
| クラス: | |
| 注文: | クロマティアル目
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| 家族: | |
| 属: | |
| 種: | ハロフィラ
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| 二名法名 | |
| ハロロドスピラ・ハロフィラ (レイモンドとシストロム 1969)イムホフとズーリング 1997 [1]
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Halorhodospira halophilaは、15~20% の塩分濃度の環境で最適に生育する能力を持つ Halorhodospira の一種です。以前はEctothiorhodospira halophilaと呼ばれていました。嫌気性で桿菌状のグラム陰性細菌です。H . halophila には鞭毛があります。
一般的な特徴
H. halophila は、知られている中で最も好塩性の生物の 1 つです。らせん状の形態を持つ、絶対光合成性で嫌気性の紅色硫黄細菌です。H. halophila は飽和 NaCl 濃度で独立栄養成長を示します。H . halophilaはプロテオバクテリア門のガンマ亜門に属するグラム陰性細菌で、光栄養性であることが知られています(クラス: ガンマプロテオバクテリア)。H . halophila は、ゲノム配列が決定された最初の光栄養性の高度好塩菌です。ゲノムは 2,678,452 bp で構成され、自動ゲノム注釈によって決定された 2,493 の予測遺伝子をエンコードします。そのゲノムから 2,407 のタンパク質が予測され、1,905 に推定機能が割り当てられています。[2] H. halophilaは浸透圧のバランスをとるためにグリシン、ベタイン、エクトインなどの有機溶質を生成します。各細菌は鞭毛を持っています。[3]結晶化池などの塩分濃度が25%以上の高塩分環境で増殖することが実証されています。 [4]
代謝
H. halophila は硫化物を硫黄に酸化し、硫黄は細胞外に沈着し、さらに硫酸塩に酸化されます。
H. halophilaには、解糖系、クエン酸回路、アミノ酸代謝など、多数の代謝経路が含まれています。極限条件下で光合成独立栄養成長が可能であり、特徴的な硫黄代謝が特徴です。H . halophilaのプロテオームは高度に酸性です。細菌は、高濃度のKCl を含む培地で増殖した場合でも、細胞質カリウム含有量が低いことが、X 線微量分析とプラズマ発光分析によって確認されています。[5] H. halophila は、既知の疾患を引き起こしません。
アプリケーション
H. halophila は、その窒素固定酵素によって触媒される窒素固定の副産物である水素ガスを生成するため、水素生成に大きな役割を果たす可能性があります。また、 H. halophila は、グリシン、ベタイン、エクトイン、トレハロースなどの有機溶質の生成にも役立ちます。
光活性黄色タンパク質(PYP)は、細菌H. halophila由来の青色光センサーです。[6] PYPなどの光活性タンパク質は、タンパク質シグナル状態の形成を研究するためのモデルシステムとして一般的に認められています。
参考文献
- ^ Parte、AC「ハロロドスピラ」。LPSN。
- ^ チャラコム、ジーン F.マジッド、ソフィア。デオール、ラトナカール。ブレッティン、トーマス S.ブルース、デイビッド。デラノ、スザナ F.デッター、ジョン C.グリーズナー、シェリル D.ハン、クリフ S.ミスラ、モニカ。レイテンガ、クリスタ G.ミハイロワ、ナタリア。タンジャ、ウォイク。ピットラック、サム。ノーラン、マット。ランド、ミリアム L.サンダース、エリザベス。タピア、ロクサーヌ。ラピダス、アラ。イワノバ、ナタリア。ホフ、ワウター D. (2013)。 「ハロロドスピラ ハロフィラ SL1 の完全なゲノム配列」。ゲノム科学の標準。8 (2): 206–214。土井:10.4056/sigs.3677284。PMC 3746430。PMID 23991253。
- ^ 「HAMAP: Halorhodospira halophila (株 DSM 244 / SL1) (Ectothiorhodospira halophila (株 DSM 244 / SL1)) 完全プロテオーム ExPASy プロテオミクス サーバー。スイス バイオインフォマティクス研究所 http://hamap.expasy.org/proteomes/HALHL.html
- ^ アントン、J;ロセロ=モラ、R;ロドリゲス・バレラ、F;アマン、R (2000)。 「太陽塩田の晶析池に存在する極度の好塩性細菌」。応用および環境微生物学。66 (7): 3052–3057。ビブコード:2000ApEnM..66.3052A。土井:10.1128/aem.66.7.3052-3057.2000。PMC 92110。PMID 10877805。
- ^ Ratnakar; Challacombe, Jean; Raiford, Douglas W.; Hoff, Wouter D. (2013). 「極めて好塩性のプロテオバクテリウムは、高酸性のプロテオームと低細胞質カリウム含有量を兼ね備えている」。The Journal of Biological Chemistry . 288 (1): 581–588. doi : 10.1074/jbc.M112.420505 . PMC 3537055 . PMID 23144460.
- ^ van Wilderen, LJ; van der Horst, MA; van Stokkum, IH; Hellingwerf, KJ; van Grondelle, R; Groot, ML (2006). 「超高速赤外分光法は、光活性黄色タンパク質の光サイクルへの正常な移行のための重要なステップを明らかにした」。米国科学 アカデミー紀要。103 ( 41): 15050–15055。Bibcode :2006PNAS..10315050V。doi : 10.1073 / pnas.0603476103。PMC 1940041。PMID 17015839。
外部リンク
- BacDive の Halorhodospira halophila の標準株 – 細菌多様性メタデータ
