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| HMG（高機動グループ）ボックス | |||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||
| シンボル | PF00505 | ||||||||||
| パム | PF00505 | ||||||||||
| ファム一族 | CL0114 | ||||||||||
| エコド | 190.1.1 | ||||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||||
| SCOP2 | 1hsm / スコープ / SUPFAM | ||||||||||
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分子生物学において、HMGボックス（高移動度グループボックス）は、DNA結合に関与するタンパク質ドメインである。[1]このドメインは、クロマチン関連高移動度グループタンパク質のDNA結合を総合的に媒介する約75個のアミノ酸残基から構成される。HMGボックスは、多くの転写因子やクロマチンリモデリング複合体に存在し、非配列または配列特異的なDNA結合を媒介することができる。[2]
構造
HMGボックスドメインの構造はループで区切られた3つのαヘリックスから構成されています（右図参照）。[3]
関数
HMGボックスを含むタンパク質は、非B型DNA構造（ねじれたりほどけたり）にのみ高い親和性で結合します。[1] HMGボックスドメインは、転写、複製、DNA修復などのDNA依存性プロセスの調節に関与するいくつかの高移動度グループタンパク質に見られ、これらはすべてクロマチンの構造変化を必要とします。[3] シングルボックスおよびダブルボックスHMGタンパク質は、結合時に曲がりを誘発することでDNA構造を変化させます。[4] [5]
参考文献
- ^ ab Stros M、Launholt D、Grasser KD (2007 年 10 月)。「HMG ボックス: さまざまな DNA 結合タンパク質に存在する多用途タンパク質ドメイン」。Cell . Mol. Life Sci . 64 (19–20): 2590–606. doi :10.1007/s00018-007-7162-3. PMC 11136187. PMID 17599239. S2CID 28156847 .
- ^ Štros, M.; Launholt, D.; Grasser, KD (2007年10月). 「HMGボックス：さまざまなDNA結合タンパク質に存在する多用途タンパク質ドメイン」. Cellular and Molecular Life Sciences . 64 (19–20): 2590–2606. doi :10.1007/s00018-007-7162-3. PMC 11136187. PMID 17599239. 2023年2月18日閲覧。
- ^ ab Thomas JO (2001 年 8 月). 「HMG1 および 2: 構造的 DNA 結合タンパク質」. Biochem. Soc. Trans . 29 (Pt 4): 395–401. doi :10.1042/BST0290395. PMID 11497996.
- ^ D. Murugesapillai et al、HMO1によるDNAの架橋とループ形成はヌクレオソームフリークロマチンを安定化させるメカニズムを提供する、Nucleic Acids Res (2014) 42 (14): 8996-9004
- ^ D. Murugesapillai et al、高移動度グループB構造DNA曲げタンパク質の単一分子研究、Biophys Rev (2016) doi:10.1007/s12551-016-0236-4
外部リンク
- 米国国立医学図書館医学件名標目表(MeSH)の HMG ボックス ドメイン