フェルディナンドコニア

フェルディナンドコニア属は、バチルス目バチルス科に属する、グラム陽性染色を示す桿菌の属である。 ^{[1] [2]}この属のタイプ種はフェルディナンドコニア・ヒューミである。^[3]

Ferdinandcohnia は、もともとBacillus属に属する種で構成されており、その多系統性は科学界で長い間問題として認識されてきました。^{[4] [5]} Bacillusに種を割り当てるために使用される基準が曖昧だったため、多様な生化学的特徴を持つ無関係な生物でいっぱいの大きな属が生まれました。^{[6]この属の分類を明らかにするために複数の系統学的研究が行われ、多くの種が}Virgibacillus、Solibacillus、Brevibacillus、Ectobacillusなどの新しい属に移されました。^{[7] [8] [9] [1]}最近、Bacillus はBacillus subtilisとBacillus cereusに近縁の種のみに限定されています。^{[10] [1]}

フェルディナンド・コーンという名前は、近代細菌学と微生物学の創始者であるドイツの生物学者フェルディナント・コーン教授（1828-1898）を記念して選ばれました。 ^[1]

出典: ^[1]

Ferdinandcohnia属の菌は主に好気性ですが、一部の種は通性嫌気性です。細胞はすべて運動性があり、胞子を形成します。ほとんどの種は耐塩性があり、0～5% (w/v) の NaCl を含む環境で生育できます。種は土壌、田んぼ、人間の排泄物、洞窟内の空気、塩分濃度の高い湖など、さまざまな環境で見つかります。Ferdinandcohniaは5°C ～ 47°C の温度範囲で生存できますが、最適な成長は 30～37°C の範囲で起こります。

ゲノム配列の解析により、この属に特有の8つの保存されたシグネチャーインデル（CSI）が特定されています。 ^[1]これらの保存されたインデルは、トリオースリン酸イソメラーゼ、ABCトランスポーターATP結合タンパク質、ビス（5'-ヌクレオシル）テトラホスファターゼPrpE、3-イソプロピルリンゴ酸脱水酵素大サブユニット、GNATファミリーN-アセチルトランスフェラーゼ、LTAシンターゼファミリータンパク質、DNA結合タンパク質WhiA、およびヌクレオシドトリホスファターゼYtkDに存在し、 Ferdinandcohniaを他のバチルス科の属および細菌と分子的に区別するための信頼性の高い手段を提供します。^[1]

2021年5月現在、フェルディナンドコニア属には有効な名前が公表されている種が合計4種あります。^[3] これらの種は、保存されたタンパク質と16S rRNAゲノム配列のさまざまなデータセットからの連結配列に基づいて作成されたさまざまな系統樹上で、単系統の枝にグループ化されていることがわかっています。^{[1]この系統群は}、ゲノム分類データベース（GTDB）で構築されたツリーにも含まれています。^[11]

さらに、有効に公表されていない3種（「バチルス・ニトロレデューセン」、「バチルス・シネサロウメンシス」、「バチルス・ティモネンシス」）も、フェルディナンドコニア属のメンバーと確実にグループ化され、同じ固有の分子マーカーを共有していることがわかっています。^[1]しかし、培養株情報が不足しているため、これらの種を属に移すことは提案されていません。これらの種と将来特定される種を適切に分類するためには、適切なデータが分析に利用可能になったときに分類基準を再検討することが不可欠です。