欧州分子生物学ネットワーク(EMBnet)は、バイオインフォマティクスの専門知識と能力を結集することでバイオインフォマティクスサービスを強化することを目的とした国際的な科学ネットワークおよび関心グループです。 [ 1 ] 2011年時点で、EMBnetは32か国に37のノードを有しています。ノードには、バイオインフォマティクス関連の大学学部、研究機関、および国のサービスプロバイダーが含まれます。
ほとんどの EMBnet ノードの主な任務は、各国の科学コミュニティにバイオインフォマティクスデータベース、専門ソフトウェア、十分なコンピューティングリソースと専門知識へのアクセスを提供することです。EMBnet はバイオインフォマティクスのトレーニングとソフトウェア開発の分野でも活動しています。EMBnet メンバーによって作成されたソフトウェアの例としては、 EMBOSS、wEMBOSS、[ 2 ] UTOPIAなどがあります。
EMBnetは幅広いユーザーグループを代表しており、EMBLの欧州バイオインフォマティクス研究所(EBI)、スイスバイオインフォマティクス研究所(Swiss-Prot)、ミュンヘンタンパク質配列情報センター(MIPS)などのデータベース作成者と緊密に連携し、ヨーロッパ全域で均一なサービス提供を実現しています。EMBnetはオランダで公益財団法人(Stichting )として登録されています。
1988年の設立以来、EMBnetは生物学的データベースの維持管理を担当する個人の非公式なネットワークから、遺伝学と分子生物学の拡大する分野に貢献するためにバイオインフォマティクスの専門家が協力する世界唯一の組織へと発展しました。EMBnetは主に学術機関で構成されていますが、産業界の会員によって重要な付加価値を得ています。EMBnetの成功は、ヨーロッパ以外の組織からの参加をますます促しています。
EMBnetは、トレーニングコースの開催、技術支援の提供、そして会員間の効果的な交流と、急速に変化する生物学研究のニーズへの対応を可能にする、実績のあるインフラストラクチャを備えています。これは、単一の機関では実現できないことです。
2005年、同組織は1カ国につき複数のメンバーを登録できるように、新たなノードの種類を創設した。新しいカテゴリ名は「関連ノード」である。
EMBnetは年次総会(AGM)によって運営され、3つのプロジェクト委員会の活動を監督する執行委員会(EB)によって調整されています。
EMBnetは、生物学分野で初めてGopherサーバーとワールドワイドウェブサーバー(CSC BioBox)を導入した。
EMBnetは、インターネット(NDT)、分散コンピューティング(HASSLE)、効率的なデータベースの閲覧とリンク(シーケンス検索システム、SRS)を利用した、日々のデータベース更新のためのソリューションを最初に考案した企業です。
Pingプロジェクトは、ヨーロッパ全域におけるネットワーク効率に関する継続的な情報を得る手段として創設されました。
EMBnetは、最新のソフトウェアアルゴリズムをユーザーに無料で提供することに尽力しており(Extended GCGまたはEGCG [ 3 ])、最先端の公開ソフトウェア(EMBOSS)の開発を続けています。
EMBER :欧州マルチメディアバイオインフォマティクス教育リソース。EMBERは、マルチメディアバイオインフォマティクス教育ツール群の開発を目的とした欧州連合(EU)資金提供プロジェクトでした[ 4 ] 。EMBERは、バイオインフォマティクスに関する自己完結型のインタラクティブなWebチュートリアルと、 CD-ROMに収録された同等のスタンドアロンコースで構成されています。
EMBnetコミュニティは、査読付き学術誌『Briefings in Bioinformatics (BiB) 』の創刊に携わりました。BiBはEMBnetからの教育助成金によっても支援されています。
バイオインフォマティクスの学習、教育、トレーニングのためのグローバル組織(GOBLET)は、 2012年のEMBnet年次総会で非営利財団として設立されました。[ 5 ] [ 6 ]
1994年から2009年まで、EMBnetはEMBnet.newsを発行していました。[ 7 ]その主な目的は、ネットワークからの最新ニュースや開発に関する情報をユーザーコミュニティに提供し、報告することでした。
EMBnet.journalは、 EMBnet.newsの後継誌として2010年に創刊され(巻号は中断なく継続)、査読付きのオープンアクセス科学誌で、バイオインフォマティクスのオリジナル研究論文や技術論文を掲載しています。[ 8 ] [ 9 ]この雑誌は、研究論文、レビュー、技術ノートを掲載するセクションと、査読なしの解説、レポート、ユーザーガイド、トレーニング情報、ニュースを掲載するセクションの2つに分かれています。EMBnet.journalは、会議録や会議抄録も補足として掲載しています。