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| 書かれた | Ｃ |
|---|---|
| 利用可能 | 英語 |
| タイプ | バイオインフォマティクスツール |
| ライセンス | GNU 一般公衆利用許諾書 |
| Webサイト | エンボスオープンバイオ |
EMBOSS は分子生物学とバイオインフォマティクスのユーザーコミュニティのニーズに合わせて開発された無料の C ソフトウェア解析パッケージです。 [1]このソフトウェアはさまざまな形式のデータに自動的に対応し、Web からシーケンスデータを透過的に取得することもできます。また、パッケージには広範なライブラリが用意されているため、他の科学者が真のオープンソース精神でソフトウェアを開発してリリースできるプラットフォームとなっています。EMBOSS は、シーケンス解析用の現在利用可能なさまざまなパッケージとツールをシームレスに統合します。
EMBOSS は、European Molecular B iology Open S oftware Suiteの頭文字をとったものです。名前のEuropean という部分は、より広い範囲を暗示しています。EMBOSS の中核グループは、ユーザーが必要とする新しいアプリケーションを開発するために、他の多くのグループと連携しています。これは、 EMBnet (European Molecular Biology Network) で最初から行われていました。EMBnet は世界中に多くのノードを持ち、そのほとんどは国立バイオインフォマティクス サービスです。EMBnet はプログラミングの専門知識を持っています。1998 年 9 月、最初のワークショップが開催され、EMBnet から 30 人がヒンクストンに行き、 EMBOSS について学び、今後の方向性について話し合いました。[2]
EMBOSS パッケージには、配列アライメント、配列パターンによる高速データベース検索、タンパク質モチーフ識別 (ドメイン分析を含む) など、 さまざまなアプリケーションが含まれています。
AJAXおよびNUCLEUSライブラリは、GNUライブラリ一般公衆利用許諾書の下でリリースされています。EMBOSSアプリケーションは、 GNU一般公衆利用許諾書の下でリリースされています。[3]
EMBOSS アプリケーション グループ
参照
- オープンバイオインフォマティクス財団
- Soaplab - EMBOSS を含むSOAP Web サービス インターフェース
- Genostar - グラフィカルアプリケーションにEMBOSSツールの一部を統合
参考文献
- ^ Rice P、Longden I、Bleasby A (2000)。「EMBOSS: 欧州分子生物学オープンソフトウェアスイート」。Trends in Genetics。16 ( 6): 276–277。doi : 10.1016 /S0168-9525(00)02024-2。PMID 10827456 。
- ^ Rice P, Bleasby A (1999). 「EMBOSS: 欧州分子生物学オープンソフトウェアスイート」Biochemist E-volution . 16 (6): 276–7. doi :10.1016/s0168-9525(00)02024-2. PMID 10827456.
- ^ 「1.1. ライセンス情報」。
外部リンク
- 公式サイト