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| エッガーテラ科 | |
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| 科学的分類 | |
| ドメイン： | |
| 門: | |
| クラス： | |
| 注文： | エッガーテラ目 グプタら2013 [1 ]
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| 家族： | エッガーテラ科 グプタら2013 [1 ]
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| 属[3] | |
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エッガーテラ科はグラム陽性菌、桿菌または球菌の放線菌類の科である。[1] [3]エッガーテラ目（Eggerthellales）内の唯一の科である。[3]
Eggerthellaceaeという名前は、科のタイプ属を意味するラテン語のEggerthellaと、科を表す接尾辞「-ceae」に由来しています。これらを合わせると、Eggerthellaceae は命名上のタイプがEggerthella属である科を指します。[4]
生化学的特性と分子シグネチャー
この科の菌は、ほとんどが嫌気性で、運動性がなく（運動性を示すゴルドニバクター属とセネガリマシリア属の一部の種を除く）、糖分解性がなく、胞子を形成しない。[4] Eggerthellaceae属の菌は、ヒトや動物の糞便、結腸、膣、口腔、血液などヒト由来のその他の菌から一般的に分離される。[4]一部の菌は、歯周病や歯内感染症、クローン病、重度の血液菌血症のヒト検体からも分離されている。[4] Eggerthellaceae属の菌の G+C 含有量は43.4～66.3 mol% である。[4]
ゲノム配列の解析により、さまざまなEggerthellaceae種にのみ存在する多様なタンパク質中に13 個の保存されたシグネチャーインデル(CSI) が特定されました。これらの CSI を含むタンパク質は、コンタエクシヌクレアーゼ ABC サブユニット UvrC、DNA ポリメラーゼ IIIサブユニット アルファ、リボヌクレアーゼ III、tRNA (N6-イソペンテニルアデノシン (37)-C2)-メチルチオトランスフェラーゼ (MiaB)、ペプチド鎖放出因子 2、16S rRNA (シトシン (1402)-N (4))-メチルトランスフェラーゼ、伸長因子 Tu、UDP-N-アセチルグルコサミン 1-カルボキシビニルトランスフェラーゼDNA ポリメラーゼ IIIサブユニット イプシロン、UDP-グルコース 4-エピメラーゼ、およびDNA 指向性 RNA ポリメラーゼサブユニット アルファです。[1] [4]同定されたCSIは、Eggerthellaceae科のメンバーを他のすべてのCoriobacteriia科および他の細菌と区別するための信頼性が高く重要な手段を提供します。
系統発生
現在受け入れられている分類法は、命名法上の原核生物名リスト（LPSN）に基づいています。[3]
注記
- ^ Asaccharobacter、Ellagibacter、Enteroscipio、Paraeggerthella、およびRubneribacterはこの系統樹には含まれていません。
参照
参考文献
- ^ abcd Gupta RS、Chen WJ、Adeolu M、Chai Y (2013)。 「コリオバクテリア綱とそのさまざまな分岐群の分子サイン。コリオバクテリア綱を、修正されたコリオバクテリア科およびアトポビア科を含む修正コリオバクテリウム目への分割案。11月、およびエッガーテラ科を含むエッガーテラレス目11月。」 11月」。Int J Syst Evol 微生物。63 (Pt 9): 3379–3397。土井：10.1099/ijs.0.048371-0。PMID 23524353。
- ^ ab Nouioui I、Carro L、García-López M、Meier-Kolthoff JP、Woyke T、Kyrpides NC、Pukall R、Klenk HP、Goodfellow M、Markus Göker M (2018)。「放線菌門のゲノムベースの分類 」。Front。Microbiol。9：2007。doi ：10.3389 / fmicb.2018.02007。PMC 6113628。PMID 30186281。
- ^ abcd Euzéby JP, Parte AC. 「Eggerthellaceae」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2021年6月23日閲覧。
- ^ abcdefg Gupta、Radhey S. (2021)、Carro、Lorena (編)、「Eggerthellaceae」、Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria、American Cancer Society、pp. 1–11、doi :10.1002/9781118960608.fbm00384、ISBN 978-1-118-96060-8, S2CID 243126790 , 2021-07-05取得
- ^ 「The LTP」 。 2023年11月20日閲覧。
- ^ 「LTP_all tree in newick format」。2023年11月20日閲覧。
- ^ 「LTP_08_2023 リリースノート」(PDF) 。 2023年11月20日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
- ^ "bac120_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
