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比較生物学は、自然の変異と不均衡を利用して、遺伝子から群集まであらゆるレベルの生命のパターンと、生態系における生物の重要な役割を理解します。比較生物学は、個体または高等分類群の系統発生の歴史と、それを動かすメカニズムとパターンを理解するための系統横断的なアプローチです。比較生物学には、進化生物学、分類学、新生学、古生物学、動物行動学、人類学、生物地理学に加えて、発生生物学、ゲノミクス、生理学、生態学、その他多くの生物科学分野への歴史的アプローチが含まれます。比較アプローチは、人間の健康、遺伝学、生物医学、保全生物学にも数多くの応用があります。生物学的関係（系統発生、家系）は比較分析にとって重要であり、通常は系統樹またはクラドグラムによって表され、単一の起源（相同性）を持つ特徴と複数の起源（相同性）を持つ特徴を区別します。